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微生物 - li -omicslab
摘要：澳门，被公认为是全球旅游枢纽，是世界上人口稠密的地区，为有利于耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌（MRSA）在医疗保健和社区环境中传播提供了一个独特的环境，在本地和全球范围内提出了重要的公共卫生问题。MRSA在澳门不同的城市中的流行病学和分子特征在很大程度上没有核定。这项为期五年的纵向研究（2017-2022）检查了MRSA在澳门MRSA的局部流行率和分子型，未来的MRSA类型分布通过ARIMA建模预测。随后，我们分析了MRSA的流行病学特征，包括标本来源，临床部门，收集年份，季节，患者年龄，性别和年度游客人数。还评估了菌株的全面抗生素耐药性谱。通过头孢辛蛋白盘扩散法鉴定为MRSA，并通过多层次序列键入（MLST）验证。MRSA检测率显示出向上的趋势，从2017年的30.1％增加到2022年的45.7％。SCCMEC IV型主要是（28.9％），其次是II型（25.4％），III（22.1％）和V（22.1％）。MRSA分离株的主要来源是痰（39.2％）和分泌物（25.6％）。年龄较大，作为MRSA感染的危险因素，而没有发现与季节性差异，性别或年度游客人数的显着关联。尽管表现出对头孢辛蛋白，奥沙西林和苯甲酰霉素的普遍耐药性，但澳门MRSA分离株仍然对万古霉素，tigecycline，tigecycline，quinupristin，nitrofurantoin和lineZolidzolid仍然完全敏感。对MACAU中MRSA分布的持续监视和分析可以为有效地管理MRSA预防和控制措施提供宝贵的见解。
阿奇霉素对肺结核患者免疫力影响的评价
干预措施 本研究为前瞻性随机研究，旨在评估阿奇霉素对结核病患者的免疫调节作用。对有可疑结核病症状（包括咳嗽 > 两周、体重减轻、疲劳、发烧、夜间出汗）的患者，将进行痰涂片显微镜检查、Xpert MTB/RIF、分枝杆菌培养和胸部 X 光检查以诊断肺结核。将使用 Genotype MTBDR 测试（不再市售）进行在线探针测试 (LPA)，以将耐药结核病患者排除在研究之外。将根据结核病管理指南进行 HIV 检测，并将 HIV 阳性患者排除在研究之外。患者将在征得同意和伦理批准后入组。将使用手动随机化方法（抛硬币，掷出正面 = 有或反面 = 没）将患者分配到标准治疗（2HRZE/4HR）组，接受或不接受阿奇霉素治疗。该研究将以开放标签研究的形式进行。阿奇霉素的初始剂量为 500 毫克，随后每天一次 250 毫克，连续 28 天，形式为薄膜包衣片。两组患者将根据病情严重程度、年龄和性别进行分层。患者将在 12 个月内招募并随访 12 个月。该研究将招募 50 名首次患上肺结核、血清阴性、对所有一线药物敏感且居住在布拉柴维尔的男女成年人（>18 岁）。两组患者的病情严重程度、年龄和性别将尽可能匹配。每次随访咨询时都将通过胸部X光和肺功能测试来评估肺部表现。
接受生物抗风湿药物治疗的类风湿关节炎患者潜伏性和活动性结核病的发展：一项单中心前瞻性研究
近年来，生物制剂彻底改变了类风湿关节炎 (RA) 的治疗方法。然而，临床试验数据和实际临床实践表明，目前正在使用的生物制剂可能是潜伏性结核感染患者结核病 (TB) 复发的危险因素。因此，在对 RA 患者开始生物治疗之前，必须筛查潜伏性和活动性结核感染。这项前瞻性研究旨在分析 2017 年至 2022 年期间越南白梅医院接受生物制剂抗风湿药物治疗的 RA 患者的临床特征，并确定影响这些患者发生活动性结核病和潜伏性结核病感染的因素。在 12 个月的随访期内，在总共 180 名患者中，20% 被确诊为潜伏性结核病感染，3 名（1.7%）患者发展为活动性结核病（肺结核、胸膜结核和臀结核各一例）。结核病危险因素暴露史和缺乏教育与活动性和潜伏性结核病感染的发生显著相关，比值比（95% 可信区间 [CIs]）分别为 1.98（1.78；2.2）和 1.45（1.31；1.6）。随访时间和 X 光、计算机断层扫描、支气管镜检查和痰抗酸菌检查次数被确定为有助于潜伏性结核病早期诊断的因素，比值比（95% CIs）分别为 1.00（1；1.01）、1.02（1；1.05）、1.12（1.11；1.2）、1.11（1.09；1.2）和 1.13（1.09；1.17）。我们的研究表明，在越南等结核病负担较高的国家，潜伏性结核病感染在类风湿性关节炎患者中患病率很高。我们还为类风湿性关节炎患者潜伏性和活动性结核病感染的筛查、监测和治疗提供了有用的信息。
2025 NHSN呼吸机相关事件（VAE）清单
•“正常的呼吸道菌群”，“正常口腔植物群”，“混合呼吸道菌群”，“混合口服植物群”，“改变口腔菌群”或其他类似的结果，表明隔离口腔或上呼吸道的共生菌群。注意：“植物群”的报告并不排除从样品中隔离或鉴定出的合格生物的使用。仅将“植物群”排除在外。•任何尚未指定的念珠菌物种或酵母菌；任何凝固酶阴性的葡萄球菌物种；以及从痰液中鉴定出的任何肠球菌，气管吸入剂，支气管肺泡灌洗或受保护的样品刷样品。如果从肺组织或胸膜液中鉴定出这些生物可以报告为PVAP病原体（在胸腔穿刺期间或胸管放置后的24小时内获得样品；在胸部管放置后的24小时内获得样品；在胸管后收集的胸膜液样品被重新放置或从胸管重新放置，或者是从胸管重新放置> 24小时> 24小时> 24小时不符合PVAP的资格）。此外，由于属于以下属的生物通常是社区相关的呼吸道感染的原因，很少或不知道是与医疗保健相关的感染的原因，因此也被排除在外，不能用来与任何合格的标本类型隔离时（包括Lung tymer andma thrma thrma thrman commerty commerty comment offly flos flos flus flus flos flos flus flos flos flos flos flos flos flos flos flos flos comply comply）：球球菌，副菌菌，加密球菌和肺炎藻。8。可以使用三个标准来满足PVAP定义：
使用靶向等温扩增和纳米孔测序的结核分枝杆菌快速耐药基因分型工作流程
摘要 结核病 (TB) 的表型药物敏感性测试 (DST) 需要数周才能产生结果。虽然分子测试可以快速检测出耐药相关突变 (DRM)，但它们无法扩展到覆盖整个基因组和可以预测耐药性的许多 DRM。全基因组测序 (WGS) 方法是可扩展的，但如果直接在痰液上进行，通常需要目标富集步骤，例如核酸扩增。我们开发了一种靶向等温扩增-纳米孔测序工作流程，用于快速预测结核病分离株的耐药性。我们使用重组酶聚合酶扩增 (RPA) 对结核分枝杆菌基因组内的三个区域进行靶向等温扩增（37°C，90 分钟），然后在 MinION 上进行纳米孔测序。我们检测了 29 种耐药性 (DR) 结核病患者的分枝杆菌基因组 DNA 提取物，并将我们的结果与 Illumina 的 WGS 和表型 DST 的结果进行比较，以评估对利福平和异烟肼耐药性的预测准确性。RPA 扩增的保真度与高保真度 PCR 相当（100% 一致）。纳米孔测序产生的 DRM 预测与 WGS 相同，测序运行时间明显更快，只需几分钟而不是几天。我们工作流程对利福平耐药性预测的灵敏度和特异性分别为 96.3%（95% 置信区间 [CI]，81.0 至 99.9%）和 100.0%（95% CI，15.8 至 100.0%）。对于异烟肼耐药性预测，敏感性和特异性分别为 100.0%（95% CI，86.3 至 100.0%）和 100.0%（95% CI，39.8 至 100.0%）。每个样本的工作流程耗材成本不到 100 英镑。我们快速且低成本的药物耐药性基因分型工作流程可准确预测利福平和异烟肼耐药性，适合在资源有限的环境中使用。
2025 NHSN肺炎（PNEU）清单
•根据体征，症状和单个确定的胸部成像测试结果，与医疗保健相关的肺炎的诊断可能很清楚。因此，在没有潜在肺部或心脏病的患者中，并且只有一个成像测试可用时，如果成像发现是合格且确定的发现，则可以满足成像测试证据的要求。•在没有潜在疾病的患者中，如果有多个成像测试可用，则还必须评估串行成像测试结果（在7天的时间内），并且必须证明合格和确定的发现的持久性。•在潜在的肺或心脏病患者中（例如间质性肺部疾病，充血性心力衰竭等。），肺炎的诊断可能特别困难。例如，来自代偿充血性心力衰竭的肺水肿的成像发现可能会模拟肺炎的表现。因此，在潜在疾病的患者中，必须检查串行胸部成像测试结果（在7天的时间内），并且必须证明合格和确定的发现的持久性，以帮助将传染性与非感染性肺部过程分开。2。请注意，有许多描述肺炎成像外观的方法。示例包括但不限于“空间疾病”，“局灶性渗透”，“密度增加的斑点区域”。虽然也许不是被放射科医生专门描述为肺炎，但在适当的临床环境中，应认真将这些替代性描述性措辞视为潜在的积极发现。3。如果提供的结果，则没有记录结果，因为另一个问题（例如，肺水肿，慢性肺病），他们有资格满足肺炎的成像测试证据。脓性痰定义为含有≥25个嗜中性粒细胞的肺，支气管或气管的分泌物，每个低功率场≤10个鳞状上皮细胞（x100）。请参阅下表，如果您的实验室报告这些数据半量化或使用其他格式报告革兰氏染色或直接检查结果（例如，“许多WBC”或“少数鳞状上皮细胞”）。需要此实验室确认，因为纯度的书面临床描述是高度可变的。
包装插页 - ZYNTEGLO
* 包括与白消安清髓性预处理相关的不良事件。# 涵盖多个系统器官类别。a 粘膜炎包括肛门炎症、粘膜炎症、口腔粘膜剥落、口腔粘膜粗糙、咽部炎症、口腔炎。b 腹痛包括腹痛、下腹痛、腹部不适、上腹痛。c 病毒感染包括BK病毒感染、人鼻病毒检测阳性、流感、流感样疾病、副流感病毒感染、鼻病毒感染、SARS-CoV-2检测阳性、病毒感染。d 上呼吸道感染包括上呼吸道咳嗽综合征、上呼吸道感染、病毒性上呼吸道感染、咽炎、链球菌性咽炎。e 脓毒症包括细菌性脓毒症、中性粒细胞减少性脓毒症、真菌性脓毒症、脓毒症。 f 肌肉骨骼疼痛包括肌肉骨骼疼痛、肌肉骨骼性胸痛、骨痛、肌肉骨骼不适、胸痛、肌痛、颈痛、非心源性胸痛、四肢疼痛、脊椎痛、肌腱痛、背痛。g 头痛包括头痛、偏头痛。h 咳嗽包括咳嗽、上呼吸道咳嗽综合征、咳嗽有痰。i 口咽痛包括口咽痛、口腔痛、口咽不适、下颌痛。j 鼻炎包括鼻炎、流鼻涕、过敏性鼻炎。k 皮疹包括痤疮、痤疮样皮炎、特应性皮炎、斑疹、瘀点、皮疹、毛囊性皮疹、斑状皮疹、斑丘疹性皮疹、瘙痒性皮疹、脓疱性皮疹、水疱性皮疹。 l 色素沉着症包括口腔色素沉着、色素沉着障碍、皮肤色素沉着过度、皮肤色素减退。
原创文章 无缝护理策略减少纤维支气管镜检查及外科手术患者术前焦虑及术后不良反应
摘要：目的：评价无缝隙护理模式在纤维支气管镜检查(FB)中的应用效果。方法：选取2017年6月1日至2019年5月31日我院呼吸科行FB检查的患者200例作为研究对象，随机分为无缝隙护理(SN)组100例和常规护理(RN)组100例。RN组给予常规护理，SN组在常规护理模式基础上融入无缝隙护理。对比2组患者焦虑自评量表(SAS)评分、血清炎性因子水平、术后不良反应、诺丁汉健康量表(NHP)评分及护理满意度。结果：根据SAS评分系统结果显示，2组患者入院时焦虑程度相似(P>0.05)；术前SN组焦虑水平显著低于入院时（P<0.001）及同期RN组（P<0.001）；SN组痰中带血、咳嗽、低氧血症、心律失常发生率显著低于RN组（P分别为0.027、0.009、0.037、0.030）。FB前RN组与SN组血清IL-6、IL-17、TNF-α、IL-10水平比较，差异均有统计学意义（P分别为0.006、0.320、0.410、0.025）。无缝隙护理后，SN组体力活动、疼痛、睡眠、情绪反应、精力等NHP评分与RN组比较，差异均有统计学意义（P<0.001）。 SN组患者满意度为91.0%，RN组患者满意度为71.0%，差异有统计学意义（P<0.001）。结论：全程无缝隙护理策略可降低FB术前焦虑水平，减少术后不良事件发生，提高FB术后生活质量和满意度，具有较高的实用价值和推广价值。
2023 NHSN肺炎（PNEU）清单
•根据体征，症状和单个确定的胸部成像测试结果，与医疗保健相关的肺炎的诊断可能很清楚。因此，在没有潜在肺部或心脏病的患者中，并且只有一个成像测试可用时，如果成像发现是合格且确定的发现，则可以满足成像测试证据的要求。•在没有潜在疾病的患者中，如果有多个成像测试可用，则还必须评估串行成像测试结果，并且必须证明合格和确定的发现的持久性。•在潜在的肺或心脏病患者中（例如间质性肺部疾病，充血性心力衰竭等。），肺炎的诊断可能特别困难。例如，来自代偿充血性心力衰竭的肺水肿的成像发现可能会模拟肺炎的表现。因此，在潜在疾病的患者中，必须检查串行胸部成像测试结果，并且必须证明合格和确定的发现的持久性，以帮助将传染性与非感染性肺部过程分开。2。请注意，有许多描述肺炎成像外观的方法。示例包括但不限于“空间疾病”，“局灶性渗透”，“密度增加的斑点区域”。虽然也许不是被放射科医生专门描述为肺炎，但在适当的临床环境中，应认真将这些替代性描述性措辞视为潜在的积极发现。3。如果提供的结果，则没有记录结果，因为另一个问题（例如，肺水肿，慢性肺病），他们有资格满足肺炎的成像测试证据。脓性痰定义为含有≥25个嗜中性粒细胞的肺，支气管或气管的分泌物，每个低功率场≤10个鳞状上皮细胞（x100）。请参阅下表，如果您的实验室报告这些数据半量化或使用其他格式报告革兰氏染色或直接检查结果（例如，“许多WBC”或“少数鳞状上皮细胞”）。需要此实验室确认，因为纯度的书面临床描述是高度可变的。
在定量聚合酶链反应中优化DNA扩增温度，用于鉴定结核分枝杆菌抗co骨的抗抑郁剂
结核病（TB）是由结核分枝杆菌引起的疾病，对全球健康是严重威胁。可用于检测和鉴定引起TB的细菌的方法是定量聚合酶链反应（QPCR）。在这种方法中，变性和延长温度是需要优化成功的决定因素之一。这项研究旨在优化DNA M.结核病的扩增中的变性和延长温度。使用准实验设计的研究。最优化的温度为93、94、95、96和97°C，用于扩展为58、59、60、61和62°C。测试样品是从结核分枝杆菌的患者收集的痰液样本，对异念珠菌具有抗性。优化是使用七个测试引物，即S315T，S315N，S315I，S315R，S315G，S315G，S315L和R463B，具有KATG基因的靶标。优化数据通过MS Excel处理最低的CT值。结果表明，使用的每个引物的最佳变性温度各不相同。主要的S315T，S315R和S315G在96°C的变性温度下最佳，最佳S315N在94°C时，主要S315i和R463B在93°C下最佳的R463B，最佳的S315L引物在95°C，最佳的S315L引物，最佳使用的温度为96°C. 96°C. 在58°C下的最佳延伸温度，用于原代S315N，S315N，S315I和R463B，初级S315R和S315G在60°C下，初级S315L在61°C下为61°C。 可以得出结论，变性研究的最佳温度为96°C，延伸为58°C。。在58°C下的最佳延伸温度，用于原代S315N，S315N，S315I和R463B，初级S315R和S315G在60°C下，初级S315L在61°C下为61°C。可以得出结论，变性研究的最佳温度为96°C，延伸为58°C。