EMBL澳大利亚合作伙伴实验室网络,约翰·科廷医学研究院,澳大利亚国立大学,澳大利亚堪培拉,澳大利亚b shine-dalgarno RNA创新中心,约翰·科廷医学研究院,澳大利亚国立大学,澳大利亚澳大利亚国立大学,澳大利亚堪培拉C计算机研究中心NHMRC研究卓越研究中心,澳大利亚E澳大利亚E澳大利亚州澳大利亚国立大学医学研究中心,澳大利亚澳大利亚国立大学,澳大利亚国立大学,澳大利亚法案第2601号法案,澳大利亚法案第2601号法案,堪培拉医院,堪培拉医院,堪培拉医院,堪培拉,堪培拉,第2605号法案,澳大利亚ACT 2605堪培拉,澳大利亚H堪培拉H基因组学和个性化健康中心,昆士兰昆士兰技术大学生物医学科学学院
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该预印本版的版权持有人于2024年4月15日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.04.12.589171 doi:Biorxiv Preprint
细胞导致相关分子丧失,并最终导致细胞裂解或死亡。具有内腔直径在顺式入口的2.9 nm之间,内部腔内为4.1 nm,内部收缩处为1.3 nm,在β-贝尔的反式入口处有2 nm,[27]αHL是第一个使用DNA和RNA Polimers的电流转移的纳米孔[27]αHl是第一个纳米孔和RNA Polimers的电流变化。其他用于感应的蛋白质孔包括smegmatis porin A(MSPA)[29]和细菌外膜通道CSGG [26,30],后者用于牛津纳米孔技术的商业设备中,用于纳米孔基于基于纳米孔的DNA和RNA序列。Sensing has also been explored with the PA 63 channel of anthrax toxin, [31] the potassium channel KscA, [32] the toxin aerolysin, [7,33] the mechanosensitive channel MscL, [34] the bacterial transporter FhuA, [9,35] the bacterial toxin ClyA, [36] and the bacteriophage phi29 DNA packaging motor.[37]生物纳米孔对商业产物是有利的,因为生物蛋白表达能够以精确且一致的几何形状对纳米孔进行大规模制造。一致的几何形状是必不可少的,当纳米孔被用作单分子传感器,其中读出密切取决于纳米孔的结构。适应许多传感应用的纳米孔需要在天然存在的蛋白质纳米孔中较少丰富的结构特征。蛋白质纳米孔已被广泛突变[38],以获取特定的感测,例如尺寸选择性或特定的分子相互作用。例如,报告了一个基于MSPA的纳米孔传感平台[39],其中将理性设计的聚合物链束缚在MSPA孔中。这使得对广泛的分析物,化学反应监测以及对映异构体的歧视启用了单分子检测。[40]可以通过更换,[41]删除,[42,43]或添加氨基酸[44]来引入蛋白质孔的修饰,从而更改表面电荷,[45] functional oft oft off inctional [46]和疏水性[47]和孔的疏水性[47],如Soskine等人所示。clya孔。[48]这些特异性突变会因pH [49]或盐浓度的变化而改变孔的稳定性。[50]然而,引入了几种化学修饰,使可预测结构的毛孔的制造变得困难。小尺寸的肽孔可以通过简单地包含在L-氨基酸的常规寄存之外的氨基酸残基来更高的设计多功能性。[51,52]肽还促进了非蛋白质生成氨基酸的高度可调设计器毛孔的完整设计。[53,54]受到天然存在的抗生素gr米核酸孔的结构的启发,合成肽孔的
它的快速分析和超长读数,纳米孔测序改变了基因组学,转录和表观基因组学。现在,由于纳米孔设计和蛋白质工程的进步,使用该技术的蛋白质肛门可能正在追赶。“所有碎片都从那里开始进行单分子蛋白质组学,并使用纳米含量来识别蛋白质及其修饰。这不是确切的测序,但可以帮助您确定存在哪些蛋白质。“您可以通过多种不同的方式识别蛋白质,这些蛋白质实际上并不需要所有20种氨基酸的确切识别,”他指的是蛋白质中通常的数字。在纳米孔DNA测序中,单链DNA通过电流通过蛋白质孔驱动。作为DNA残基横穿孔,它破坏了电流以产生可以将其解码为DNA碱基的特征信号。
摘要:水上的摩擦 - 碳界面仍然是一个主要难题,理论和模拟无法解释纳米级水流的实验趋势。最近的理论框架量子摩擦(QF)提议通过考虑在水和石墨表面中的介电波动之间的非绝热耦合来解决这些实验观察。在这里,使用一个经典模型,该模型能够对固体的介电谱进行微调,我们提供了模拟的证据,以一般支持QF。尤其是,随着固体介电光谱的特征开始与Water的图书馆和Debye模式重叠,我们发现摩擦的增加与QF提出的摩擦相符。在微观水平上,我们发现对摩擦的贡献在固体电荷密度的动力学中比水的动力学更为明显。我们的发现表明,QF的实验性特征可能在固体的反应而不是液态水中更为明显。关键字:液体 - 固体摩擦,纳米级水,液体 - 固体界面,石墨烯,分子动力学
实验室中的实验进化有助于研究人员了解特定条件下适应的遗传和表型背景。同时,代表复杂自然生态位某些方面的简化环境允许剖析选择背后的相关参数,包括温度、氧气供应、营养物质和生物因素。其他微生物或宿主的存在对微生物进化有重大影响,而这种影响通常不同于在非生物条件下观察到的适应路径。在最新一期的 ISME 期刊中,Cosetta 和同事揭示了代表奶酪微生物组演替的跨界相互作用如何促进与食物和动物相关的细菌木糖葡萄球菌的独特进化。作者还发现了一种全球调节器依赖性适应,这种适应导致进化的衍生物表现出色素产生和菌落形态减少,以及分化表型改变,这可能有助于提高适应性。
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