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World File Search System富集
DNA转座子通过富集转录因子结合基序
从基因组的非编码区域通过突变依次出现。除其他外，此类突变分析转录并创建一个新的开放阅读框（ORF）。尽管ORF出现的机制有充分的文献证明，但对实现新转录事件的机制知之甚少。然而，在许多物种中，已经报道了基因组所有区域的缺乏和非常突出的转录之间的连续体。在这项研究中，我们使用新组装的基因组和七个果蝇的近交系列的转录组和转录组搜索了从头转录本，该基因组和一个来自六个欧洲和一个非洲人口的近交系列。此设置使我们能够检测Sam ple特定的从头转录本，并将其与其他样品中的同源非转录区以及遗传和基因间控制序列进行比较。我们研究了与转换元件（TES）的关联，并富集了从头开始出现的转录本上游的转录因子基序，并将其与调节元素进行了比较。我们发现，从头的成绩单与TES重叠的频率比偶然性的频率更高。新转录本的出现cor与高鸟嘌呤 - 环蛋白含量和TE表达的区域有关。此外，从头转录本的上游区域高度丰富了调节基序。这种基序在与TES（尤其是DNA TES）重叠的新转录物中更丰富，并且比上游的“非转录同源物”更保守上游。总体而言，我们的研究表明，TE插入对于转录本的出现很重要，部分是通过引入DNA te家族的新调节图案。
单分子分辨率下的直接翻转动力学和量化手性的富集
手性是自然的重要方面，并且已经开发出许多宏观方法来了解和控制手性。对于手性高等胺，它们的柔性翻转过程使得在不形成粘结和破裂的情况下实现高性能可控性。在这里，我们提出了使用石墨烯 - 分子 - 透明烯单分子连接的第三级胺形成的一种稳定的手性单分子器件。这些单分子设备允许实时，原位，并长期测量具有高时间分辨率的个体手性氮中心的翻转过程。温度和偏置电压依赖性实验以及理论研究表明多种性手性中间体，表明通过能量相关因素对翻转动力学进行调节。角度依赖性测量进一步证明了使用与对称相关因子线性极化的光线有效地富集了手性态。这种方法提供了一种可靠的手段，可以理解手性的起源，阐明微观手性调节机制，并有助于有效药物的设计。
碳磷循环模型高估了成熟的桉树林中的二氧化碳富集
磷（P）在调节生态系统对气候变化的反应中的重要性促进了陆地表面模型中的P-Cycle实施，但是尚未针对微分调查进行评估其CO 2效应预测。在这里，我们执行了数据驱动的模型评估，其中八个广泛使用P的模型的模拟与长期自由空气CO 2富集实验的观察结果面临，以成熟的P- Limited Eucalyptus森林中的观测。我们表明，大多数模型都预测了CO 2对生态系统碳（C）隔离的正确符号和幅度，但它们通常高估了对植物C摄取和生长的影响。我们确定光合作用，植物组织化学计量学，地下植物C的分配以及随后对植物 - 微生物相互作用的后果的叶片对叶片缩放量，这是可以改善生态系统C-P相互作用模型的关键领域。一起，此数据模型对比揭示了对p启用P的性能和功能的数据驱动的见解，并增加了现有的证据，表明全球CO 2驱动的碳汇被模型高估了。
Illumina DNA准备外显子组2.5富集
Illumina DNA Prep和Exome 2.5富集提供经济的人类全外观测序（WES）结果，具有出色的性能和数据质量。易于使用的库的准备和富集解决方案是从样本到报告的端到端工作流程的一部分（图1）。Illumina合格的方法可通过我们的合作伙伴提供一系列自动化平台。Illumina DNA与Exome 2.5富集的PrEP始于提取的基因组DNA（GDNA）或直接血液或唾液输入，并结合了快速的珠宝上标记文库制备化学化学，然后进行混合捕获外部体富集（图2）。1具有富集化学的Illumina DNA准备支持高质量输入DNA（≥50ng）的综合归一化，这可以实现简单的基于体积的合并进行杂交，并提供来自每个富集外来图书馆的测序输出。库在Novaseq
Illumina DNA准备富集 星座映射的阅读技术 病毒监视面板V2 病毒监视面板V2
Illumina DNA准备富集的功能是Illumina富集作品集中最快的工作流程。用户友好，兼容自动化的解决方案支持所有经验级别的用户，并为各种实验设计提供了共同的工作流程，包括固定面板，自定义面板和全外观测序。珠子上标记可以使用多种DNA输入量和各种样本类型。具有富集的Illumina DNA准备与Illumina和第三方富集探针/面板兼容，从而实现了内容可移植性。具有富集溶液结合Illumina SBS Chemistry的创新Illumina DNA Prep，提供了最佳的靶向富集和外显子组测序体验。
利用 i-GONAD 进行多次连续基因组编辑和育种富集有助于生产转基因小鼠
摘要：转基因 (GM) 小鼠是生物医学研究中必不可少的工具。传统的转基因小鼠生成方法成本高昂，需要专门的人员和设备。使用成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 结合改进的输卵管核酸递送基因组编辑 (i-GONAD) 大大提高了在研究实验室中生产转基因小鼠的可行性。然而，由于 C57BL/6 (B6) 等近交系小鼠的生育能力低且胚胎脆弱，对其进行基因改造仍然具有挑战性。我们在尝试优化 i-GONAD 的同时，已在 B6 背景下成功生成了多种新型转基因小鼠品系。我们发现 i-GONAD 减少了超排卵怀孕雌性的产仔数，但不会影响怀孕率。自然交配或低激素剂量不会增加超排卵 B6 雌性中观察到的低生育率。然而，饮食丰富对怀孕成功有积极影响。我们还通过将接受 i-GONAD 治疗的怀孕 B6 雌性与同步怀孕的 FVB/NJ 伴母共同饲养来优化繁殖条件，以提高幼崽的存活率。因此，通过丰富的饮食和与生育能力强的雌性（如 FVB/NJ）共同抚养幼崽，增加了转基因小鼠的产生。在本研究中，我们使用 CRISPR/Cas 系统同时或连续靶向单个和多个基因座，产生了 16 只转基因小鼠。我们还比较了使用不同方法插入 LoxP 以产生条件性敲除小鼠的同源定向修复效率。我们发现，两步连续 LoxP 插入（其中每个 LoxP 序列在不同的 i-GONAD 程序中单独插入）是一种低风险、高效的产生 floxed 小鼠的方法。
对细菌富集的Vermicompost的评论...
全球大量固体废物的生成是一个重大的生态和技术问题。vermicomposting可能是以环保方式处理固体废物的可行选择。vermicompost具有更高水平的可用营养素，例如碳，氮，磷和钾，钙和镁，这些营养素源自废物。许多研究人员试图通过使用earth品种来评估效率vermicompost的开发。从过去的多年中，earth在不同类型废物的降解中的使用一直在继续。这些废物包括工业，植物碎片的农业，家庭废物纸和牛粪。固定氮是大多数环境中的一种有限养分，生物圈中的氮主要储备是大气中的分子氮。分子氮不能直接被植物吸收，但是它可以通过只有核细胞才出现的生物氮固定过程获得。vermicompost是细菌生长的有效载体，因此诸如Mycorrhiza和Dyaztotor等共生细菌物种有助于植物的快速生长，而Azotobactor，Rhizobium则参与植物氮的固定和储存。本综述着重于超过作物生产的Vermicostostost和微生物富集。
可富集的微生物共生菌群落降解了 Kyphosus 鱼中的大型藻类多糖
摘要 沿海食草鱼类以大型藻类为食，这些藻类随后被其消化道中的微生物降解。然而，关于进行这种降解的微生物群的基因组信息很少。本研究通过计算机模拟研究碳水化合物活性酶和硫酸酯酶序列，探索了 Kyphosus 胃肠道微生物共生体协同降解和发酵红、绿和棕色大型藻类中的多糖的潜力。从先前描述的 Kyphosus 肠道宏基因组和新测序的生物反应器富集物中回收宏基因组组装基因组 (MAG) 揭示了 Kyphosus 肠道中主要微生物类群之间的酶活性差异。回收的 MAG 中用途最广泛的是来自拟杆菌门，其 MAG 中含有能够分解各种藻类多糖的酶集合。 Bacillota（Vallitalea 属）和 Verrucomi crobiota（Kiritimatiellales 目）基因组的独特酶和预测降解能力凸显了多个门的代谢贡献对拓宽多糖降解能力的重要性。很少有基因组含有单独完全降解任何复杂硫酸化藻类多糖所需的酶。来自不同分类群的 MAG 之间合适酶的分布，以及在候选酶中广泛检测到信号肽，与这些碳水化合物的协同细胞外降解相一致。这项研究利用基因组证据揭示了 Kyphosus 共生体在酶和菌株水平上尚未开发的多样性及其对大型藻类分解的贡献。生物反应器富集为降解和发酵过程提供了基因组基础，对于将从该系统获得的知识转化为水产养殖和生物能源领域至关重要。
Illumina 无细胞 DNA 制备与富集
血浆中的循环游离DNA（cfDNA）已被证明是癌症、心血管疾病和器官移植中重要的非侵入性可检测生物标志物。在癌症研究领域，对液体活检样本中的 cfDNA 进行测序可以提供关于肿瘤异质性的宝贵见解，实现生物标志物分析，并且在组织不易获得时可作为组织活检样本的补充或替代。由于血浆样本通常含有少量来自目标细胞的cfDNA，因此需要可靠且灵敏的检测方法来检测罕见的体细胞变异。固定基因组可用于确定变异。然而，它们对于研究新目标和检测感兴趣基因的变化的作用有限。