摘要:肽和蛋白质聚集涉及寡聚物种的形成,但是不同构象的低聚物和大小之间的复杂相互作用使它们的结构阐明变得复杂。使用离子迁移率质谱法(IMMS),我们旨在揭示与tau蛋白的Ac-PHF6-NH 2肽段聚集的早期步骤,从而区分不同的寡聚物种并获得聚集途径的不足。通常被忽略但可以改变肽的聚集倾向的重要因素是末端上限组。在这里,我们证明了IM-MS的使用来探测AC-PHF6-NH 2,AC-PHF6,PHF6-NH 2和未映射的PHF6肽段的骨料形成的早期阶段。使用硫酸氟T荧光测定法和透射电子显微镜确定了四个PHF6段的聚集倾向。开发了一种基于IM后片段化和四极杆选择的新方法 - 开发了QQ-TOF(捕获的离子迁移率)光谱仪,以增强低聚物分配,尤其是对于高阶聚集体。这种方法推动了同种物种的IM识别限制,它们的签名显得彼此近距离,并随着越来越多的低聚物大小而近距离,并为IM-MS数据的解释提供了新的见解。此外,将TIMS碰撞横截面值与波动波离子迁移率(TWIMS)数据进行比较,以评估被困离子迁移率结果中潜在的仪器偏置。这两个IM-MS仪器平台基于不同的离子迁移率原则,并具有不同的配置,从而为我们提供了对保存弱界生物分子复合物(如肽聚集体)的宝贵见解。
deta nonoates¼二乙烯胺N-二核酸酯; gsh¼谷胱甘肽; gsno¼s -Nitrosoglutathione; HASMC¼人主动脉平滑肌细胞; Huasmc¼人脐动脉平滑肌细胞; HUVEC¼人脐静脉内皮细胞; MOF¼金属有机框架;无¼一氧化氮; NP¼Nanoparpicle; pCl¼Poly(ε-丙二酮); pCl/pk¼poly(ε -caprolactone)/phos -phobetaination phobetaination jeratin; poss-pcu;多面体寡聚西锡烷烷烷基聚氨酯氨基甲酸酯; rsno¼s-亚硝基硫醇; SMC¼平滑肌细胞; Snap¼s-硝基 - N-乙酰苯胺胺; VSMC¼血管平滑肌细胞。
寡核苷酸耦合的dynabeads™磁珠用于从生物样品中特异性捕获核酸靶标(图3)。在等离子体(400 µL最终体积)中峰于M13噬菌体的已知量(1.4x10^5 pfu)后,样品被液化,并通过杂交在寡聚偶联的珠子偶联物上捕获的释放的核酸靶标。然后从珠子中洗脱核酸靶标,并通过qPCR定量。当裂解/结合步骤仅在室温下长2分钟时,回收率约为25%,但是当裂解/结合时间增加到10分钟并在55ºC处发生时,恢复速率达到70%,表明根据捕获效率要求,测定条件可以调节(图4)。
在图1中,将阻塞寡聚和COT DNA添加到您的准备库中。阻滞剂对于大幅度降低非特异性适配器相互作用和COT DNA很重要,可在杂交过程中降低非编码重复序列的非特异性结合。如果您的反应中不存在阻滞剂和/或COT DNA,则样品的目标较低。在杂交期间,将5'生物素寡核苷酸与靶标杂交。通常,这是一个四个小时的孵化,但可以扩展到一夜之间,以改善小面板性能甚至适应的实验室时间表。杂交完成后,将磁链霉亲和素珠添加到反应中以捕获探针。探针被磁分离架和一系列洗涤以洗去任何脱靶分子。
特异性和注释DC-SIGN是一种跨膜受体,在树突状细胞和巨噬细胞表面表达。它参与了先天的免疫系统,并认识到从寄生虫到病毒的许多进化发散的病原体。蛋白质被组织成三个不同的结构域:N末端跨膜结构域,串联重复的颈域和C型凝集素碳水化合物碳水化合物识别结构域。由C型凝集素和颈部结构域组成的细胞外区域具有双重功能,是病原体识别受体和细胞粘附受体,通过结合微生物和内源细胞表面上的碳水化合物配体。颈部区域对于同型寡聚很重要,这使受体能够结合较高亲和力的多价配体。
Oligomerix Announces First-in-Human Dosing of Tau Self-Association Inhibitor OLX-07010 -- Phase 1a study will evaluate the safety and tolerability of OLX-07010 in healthy volunteers -- WHITE PLAINS, N.Y., Feb. 2, 2023 - Oligomerix, Inc., a privately held company pioneering the development of small molecule therapeutics targeting tau for rare NeuroDegenerative和Alzheimer的疾病今天宣布,在公司的1A期临床试验中评估铅候选人OLX-07010的第一批受试者。该铅化合物是一种新型的口服小分子抑制剂,以评估tau自我关联的治疗,以治疗阿尔茨海默氏病和其他神经退行性疾病。第1A期研究的目的是评估健康志愿者中OLX-07010在单上升和多级剂量方案中的安全性和耐受性,然后在健康的老年志愿者队列中进行评估,预期人群。“凭借其针对性的安全性和功效概况,OLX-07010有可能为患有毁灭性神经退行性疾病的患者填补治疗选择的重要空隙,” MBBA博士,MBA博士,Oligomerix的发现与策略的首席执行官兼首席执行官兼策略负责人。“我为整个寡聚团队感到自豪,并为我们开始首次人类临床试验而成为这一主要里程碑的一部分感到兴奋。”在非临床,药效研究中,OLX-07010在两种不同的小鼠神经变性模型中表现出强大的效力。来自OLX-07010非临床研究的数据已在世界一流的会议上介绍,并在领先的同行评审的神经病学期刊上发表。有关更多信息,请访问clinicaltrials.gov。在临床前,指导研究中,OLX-07010被证明是临床研究的出色候选者。“至关重要的是,神经科学社区继续努力为严重的神经系统疾病制定更好的治疗策略,”寡聚莫里克斯(Eligomerix)总裁兼开发与运营主管William Erhardt说。“在过去的两年中,寡聚体在证明抑制tau自我关联如何在AD和神经退行性条件的临床前模型中产生显着影响。在本研究1A阶段的开始开始时,我们期待与利益相关者密切合作,从患者到护理人员再到监管官员,因为我们表征了OLX-07010的临床特征。”该出版物中报道的研究得到了美国国立卫生研究院衰老研究所的支持,该奖项是1R01AG076565-01内容仅是作者的责任,并不一定代表美国国立卫生研究院的官方观点。是一种口服的小分子抑制剂,靶向TAU聚集级联的开始,该过程被认为与阿尔茨海默氏病和其他神经退行性疾病的发展有关。寡聚物的主要候选者在多种tau介导的神经变性的动物模型中表现出功效。OLX-07010目前正在健康受试者的1A期临床试验中进行评估。
先天性心脏病(CHD)在多达1%的活产中观察到,这是出生缺陷导致死亡的主要原因之一。虽然数百个基因已经与冠心病的遗传病因有关,但它们在CHD发病机理中的作用仍然很少了解。这在很大程度上是对冠心病的零星性质的反映,及其可变的表现性和不完整的渗透率。我们审查了冠心病的寡聚病因的单基因原因和证据,以及从头突变,常见变体和遗传修饰剂的作用。为了进一步的机械洞察力,我们利用跨物种的单细胞数据研究了与冠心病有关的基因和小鼠胚胎心脏中涉及的基因的细胞表达特征。了解冠心病的遗传病因可能会实现精密医学和产前诊断,从而促进早期干预措施,以改善CHD患者的预后。
为了解决这个问题,并促进了对改良的寡核的快速,简单,高产的,荧光团的附件,我们在这里证明了固定的T4 DNA连接酶(IM T4 DNA连接酶,NEB#M0569)的易于有效使用。目标寡聚包含一个昂贵且难以合同的环嘧啶二聚体(CPD)(2)我们附加了5´FAM荧光团以可视化相应酶促反应的修饰(图2,第2页)。采用相应片段的适当化学计量比,可以立即通过毛细管电泳进行筛查,从而可以立即进行纯化的无连接反应。重要的是要注意连接酶反应中3´的寡磷酸成分中5´磷酸盐的要求。可以化学引入磷酸盐或使用T4多核苷酸激酶(NEB#M0201)添加。
为了解决这个问题,并促进了对改良的寡核的快速,简单,高产的,荧光团的附件,我们在这里证明了固定的T4 DNA连接酶(IM T4 DNA连接酶,NEB#M0569)的易于有效使用。目标寡聚包含一个昂贵且难以合同的环嘧啶二聚体(CPD)(2)我们附加了5´FAM荧光团以可视化相应酶促反应的修饰(图2,第2页)。采用相应片段的适当化学计量比,可以立即通过毛细管电泳进行筛查,从而可以立即进行纯化的无连接反应。重要的是要注意连接酶反应中3´的寡磷酸成分中5´磷酸盐的要求。可以化学引入磷酸盐或使用T4多核苷酸激酶(NEB#M0201)添加。