摘要 水平基因转移 (HGT) 可以使一种细菌物种中进化的性状转移到另一种细菌物种中。这有可能迅速促进新的适应轨迹,例如人畜共患疾病转移或抗生素耐药性。然而,要做到这一点,需要在给定的时间范围内消除重组障碍。这些障碍中最重要的是生态环境不同的物种在不同的生态位中的物理分离。在弯曲杆菌属中,存在生态环境各异的物种,从很少孤立的单宿主专化者到多宿主通化者,它们是人类细菌性胃肠炎最常见的全球病因。在这里,通过表征这些对比鲜明的生态环境,我们可以量化自然种群中同域和异域物种的 HGT。通过分析 30 种弯曲杆菌基因组中的受体和供体种群血统,我们发现在同一宿主中共存可导致物种间的 HGT 增加六倍。这占特定物种内所有 SNP 的 30%,并识别出具有宿主适应性和抗菌素耐药性等功能的高度重组基因。正如在一些动物和植物物种中所描述的那样,生态因素是细菌物种形成的主要进化力量,宿主景观的变化可以通过 HGT 促进不同物种的部分趋同。