CédricCannard 1,2,HelanéWahbeh2,Arnaud Delorme 1,2,3 1 Cent de Recherche Cerveau et Cognition(CERCO),CNRS,Toulouse III大学,法国2号大学2 Noetic Sciences(Ions)3 Swartz计算神经科学中心(SCCN),INC,UCSD,LA JOLLA,美国关键字:开放源代码,EEGLAB,EEG,EEG,ECG,ECG,PPG,PPG,HRV,QEEG,QEEG,特征分析,Hep/Hep/hep/hep/heo,hep/heo,brain heart Interplay,Heart Artifact,Heart Artifact,Heart Artifact,Heart Artifact。摘要:BrainBeats工具箱是一个开源EEGLAB插件,旨在共同分析EEG和心血管(ECG/PPG)信号。它提供了三个主要协议:心跳诱发的潜力评估,基于特征的分析和心脏伪像从EEG信号中提取。它应该帮助研究人员和临床医生研究脑力相互作用,并具有增强的可重复性和可及性。摘要:皮质和心血管系统之间的联系正在引起人们的关注,因为它们有可能对大脑和心脏功能耦合提供宝贵的见解。EEG和ECG/PPG提供了无创,具有成本效益和便携式解决方案,用于捕获实验室,临床或现实世界中的大脑心脏相互作用。但是,由于技术挑战和缺乏准则,该域中的可扩展应用程序受到限制。现有工具通常缺乏统计方法,易于使用的用户界面或大型数据集的自动功能,对于可重复性至关重要。在标准化定量脑电图(QEEG)和心率变异性(HRV)特征提取方法中进一步存在,破坏了临床诊断或机器学习的鲁棒性(ML)模型。应对这些挑战,我们介绍了Brainbeats工具箱,该工具箱是作为开源EEGLAB插件实现的,提供了一套信号处理和功能突出功能。工具箱集成了三个主要协议:1)心跳诱发电位(HEP)和振荡(HEO),用于以毫秒精度评估时锁的脑心脏相互作用; 2)QEEG和HRV功能提取,用于检查各种大脑和心脏指标之间的关联或构建基于功能的ML模型; 3)从EEG信号中自动提取心脏伪像,以消除进行EEG分析的任何潜在的心血管污染。我们提供了一个分步教程,用于在包含同时64通道EEG,ECG和PPG的开源数据集上执行这三种方法。可以通过图形用户界面(GUI)或命令行调整一系列参数以量身定制独特的研究需求。Brainbeats应该使大脑心脏的相互作用研究更容易访问和重现。
FCC语句:根据FCC规则的第15部分,已经对该设备进行了测试并符合B类数字设备的限制。这些限制旨在提供合理的保护,以防止住宅安装中有害干扰。此设备会生成,用途并可以辐射射频能量,如果未按照说明进行安装和使用,可能会对无线电通信产生有害的干扰。但是,不能保证在特定安装中不会发生干扰。如果此设备确实会对广播或电视接收造成有害干扰,这可以通过打开设备和开机来确定,则鼓励用户尝试通过以下一项或多项措施来纠正干扰:
。cc-by-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2023年12月5日。 https://doi.org/10.1101/2023.09.25.559321 doi:Biorxiv Preprint
随着公开的方式,一种计算工具促进在数字映射中使用ML技术,可以帮助地理信息系统(GIS)软件的用户。在这些软件中,QGIS [QGIS开发团队2018]是开源的,具有友好的界面和一个由开发人员和用户组成的积极社区。免费的计算机程序可用于普通克里格,例如Vesper [Whelan等,2002],Sgars [Remy等,2009]和Krigme [Valente等,2012]。但是,它们都不可作为QGIS补充(插件)可用。鉴于ML的潜在应用以及将QGI集成到土壤属性数字映射系统中的需求,这项工作旨在开发集成工具(插件)到QGIS软件,用于使用OK和ML作为插值方法进行数字映射。开发的数字映射插件称为智能图。
NORGEN的纯化技术纯化基于自旋色谱柱色谱法。噬菌体DNA优先纯化从其他细胞成分(例如蛋白质)中纯化,而无需使用苯酚,氯仿或氯化葡萄球菌。此过程的起始材料被阐明了噬菌体上清液,该噬菌体上清液已与液体培养物中的细菌碎片分离。最初,噬菌体颗粒通过提供的裂解缓冲液B通过热和化学裂解过程裂解(请参阅第4页的流程图)。异丙醇被添加到裂解物中,并将溶液加载到自旋柱上。Norgen的自旋柱以取决于离子浓度的方式结合核酸,因此只有DNA才能与柱结合,而大多数RNA和蛋白质在流潮中除去。然后用提供的洗涤溶液A洗涤结合的DNA,以去除剩余的杂质,并用洗脱缓冲液洗脱纯化的总DNA。纯化的总噬菌体DNA是最高的完整性,可用于许多下游应用。
NORGEN的纯化技术纯化基于自旋色谱柱色谱法。优先从其他细胞成分(例如基因组DNA和RNA)中纯化质粒DNA。该过程涉及首先颗粒的隔夜细菌培养物具有质粒DNA(请参阅第3页的流程图)。然后,使用提供的重悬溶液AZ重悬细菌颗粒,并使用裂解缓冲液N进行细菌。然后添加缓冲液。然后添加缓冲液TN,从而导致溶液中存在的基因组DNA和蛋白质。然后通过离心阐明裂解物,以去除含有质粒DNA的裂解物中的沉淀蛋白和基因组DNA。然后将澄清的裂解物加载到自旋柱上。Norgen的柱以取决于离子浓度的方式结合DNA,因此,只有质粒DNA才能与柱结合,而大多数消化的RNA和蛋白质将在流动中除去或保留在柱床的顶部。然后用提供的洗涤溶液J洗涤结合的DNA,以去除剩余的杂质。最后,无内毒素纯化的质粒DNA用洗脱缓冲液洗脱。纯化的DNA是最高质量的,可用于许多下游应用,包括测序,克隆和转染。
NORGEN的纯化技术纯化基于自旋色谱柱色谱法。DNA优先从其他细胞成分(例如蛋白质)中纯化,而无需使用苯酚或氯仿。该过程涉及用液氮(或替代均质化设备)在砂浆中磨碎植物组织。裂解缓冲液L和RNase A,然后在65°C处进行短孵育,接下来,结合缓冲液I将添加到裂解物中,然后在冰上进行另一个短孵育。然后通过提供的过滤柱旋转裂解物,以清除任何碎屑。然后将乙醇添加到澄清的裂解物中,并将溶液加载到自旋柱上。Norgen的树脂以取决于离子浓度的方式结合核酸,因此只有DNA才能与色谱柱结合,而大多数RNA和蛋白质在流潮中除去。然后用提供的溶液WN洗涤结合的DNA并洗涤溶液A以去除剩余的杂质,并用洗脱缓冲液洗脱纯化的总DNA。纯化的DNA具有最高的完整性,可用于许多下游应用。
D-WAVE 在线资源:探索高管和开发人员的资源。视频、白皮书等。https://www.dwavesys.com/learn/resource-library
血液DNA分离最大套件产品插入产品#31200 NORGEN的血液DNA分离最大试剂盒设计用于快速制备基因组DNA,从3 mL到10 ml全血。纯化基于自旋柱色谱作为分离矩阵。NORGEN的色谱柱在优化的盐浓度下结合DNA,并在低盐和略微碱条件下释放结合的DNA。纯化的基因组DNA在所有测试的限制酶中完全消化,并且与下游应用完全兼容,包括PCR,实时PCR,远程PCR,用于亲子关系测试和Southern印迹分析的RFLP分析。NORGEN的血液基因组DNA分离最大试剂盒可从包括人类在内的各种物种的血液中分离基因组DNA。基因组DNA优先从其他细胞蛋白质成分中纯化。基因组DNA的典型产率将根据血液样本的细胞密度而变化。单个样品的准备时间小于55分钟,每个套件都有足够的材料进行12种制剂。套件组件