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World File Search System标记间隔
映射定量性状基因座
摘要现在可以使用完整的遗传连锁图来定位染色体区域上的主要定量性状基因座（QTL）。QTL映射的当前方法（例如，一次使用一对或两对侧翼标记时进行映射的间隔映射）可能会受到其他链接的QTL对染色体的影响，因为遗传背景不受控制。结果，QTL的映射可能是偏差的，并且映射的分辨率不是很高。理想情况下，当我们测试QTL标记间隔时，我们希望我们的测试统计量独立于染色体其他区域可能的QTL的影响，以便可以将QTL的效果分开。可以通过使用一对标记来定位测试位置，同时使用其他标记来通过多个回归分析来控制遗传背景。理论是在本文中开发的，旨在通过多元回归分析探讨条件测试的概念。研究了有关QTL图的多种回归分析的各种概述。理论分析表明，构建用于映射QTL的测试程序是有利的，并且这种测试可能会大大提高QTL映射的精度。
使用ddrad-seq的高密度SNP遗传图构建和芝麻胶囊粉碎特征的映射
芝麻的含种子胶囊在收获时破碎。这种野性的特征使该作物不适合机械化收获，并通过限制无法获得低成本劳动的国家的耕种来限制其商业潜力。因此，为了开发可持续的芝麻农业的机械化品种，囊囊破碎特征的基本遗传基础非常重要。在本研究中，我们产生了芝麻F 2种群，这些种群源自胶囊粉碎品种（Muganli-57）和非惊人突变体（PI 599446）之间的交叉，该杂种用于基于基于双重数量的限制性站点 - 相关的DNA测序的遗传图。所得的高密度遗传图包含782个单核苷酸多态性（SNP），并跨度为697.3厘米，平均标记间隔为0.89 cm。基于参考基因组，将囊破碎特性映射到SNP标记物S8_5062843（78.9厘米）附近LG8（染色体8）附近。为了揭示可能控制破碎特征的基因，检查了标记区域（S8_5062843），并确定了包括六个CDSS的候选基因。注释表明，该基因编码具有440个氨基酸的蛋白质，与转录抑制剂KAN1共享约99％的同源性。与胶囊粉碎等位基因相比，SNP在S8_5062843的空气区域中发生变化和改变的剪接，导致mRNA中的移码突变，从而导致突变父母中该基因的功能丧失，从而导致在不受破坏的囊囊和叶片卷曲中。使用基因组数据，开发了Indel和CAPS标记，以区分标记辅助选择研究中的破碎和非惊人的胶囊基因型。在研究中获得的结果在育种计划中可能是有益的，以提高破碎的性状并提高芝麻的生产力。