组蛋白 H3K36 残基 (H3K36me3) 的三甲基化通过抑制染色质中不需要的隐蔽转录,在确保转录保真度方面起着不可或缺的作用。H3K36me3 修饰是在 RNA 聚合酶 II 延伸复合物 (EC) 的转录延伸过程中由 Set2/SETD2 完成的。在这里我们发现 Set2 介导的 H3K36me3 沉积主要发生在 EC 后面的核小体重组上。与 Set2 复合的转录 EC 和重组核小体的低温电子显微镜结构表明,Set2 由 EC 的 Spt6 亚基锚定并捕获核小体的 H3 N 端尾部。Set2-Spt6 相互作用的消除导致转录偶联的 H3K36me3 沉积缺陷。这些见解阐明了转录偶联 H3K36me3 在染色质中沉积的结构机制。
DNA 靶向药物可能会损伤 DNA 或染色质。许多抗癌药物会同时损伤 DNA 和染色质,因此很难理解它们的作用机制。我们使用导致 DNA 断裂但不改变核小体结构的分子(博来霉素)或使核小体不稳定但不损伤 DNA 的分子(curaxin),研究了 DNA 或染色质损伤对正常细胞和肿瘤细胞的影响。正如预期的那样,DNA 损伤导致 p53 依赖性生长停滞,随后衰老。染色质损伤导致的 p53 积累高于 DNA 损伤;然而,生长停滞与 p53 无关,不会导致衰老。染色质损伤以 p53 非依赖性方式激活了多个基因的转录,包括经典的 p53 靶标。尽管这些基因在基础条件下表达不高,但它们具有围绕转录起始位点 (TSS) 的染色质组织,这是大多数高表达基因的特征,并且 RNA 聚合酶暂停水平最高。我们假设这些基因 TSS 周围的核小体对染色质损伤最为敏感。因此,curaxin 处理后核小体丢失将使转录无需序列特异性转录因子的协助即可进行。我们证实了这一假设,结果显示 curaxin 处理后这些基因 TSS 周围的核小体丢失较多,染色质损伤剂而非 DNA 损伤剂可激活 p53 缺陷细胞中的 p53 特异性报告基因。
Michael L. Nosella, 1 , 2 , 7 Tae Hun Kim, 1 , 2 , 3 , 4 , 7 , 8 Shuya Kate Huang, 1 , 2 , 3 , 4 Robert W. Harkness, 1 , 2 , 3 , 4 Monica Goncalves, 5 Alisia Pan, 1 Maria Tereshchenko, 2 Siavash Vahidi, 5 John L. Rubinstein, 1 , 2 , 6 Hyun O. Lee,2 Julie D. Forman-kay,1,2 *和Lewis E. Kay 1,2,2,2,2,3,4,9,9, * 1分子医学计划,生病儿童医院,多伦多,多伦多,M5G 0A4,加拿大2,加拿大2,多伦多,多伦多大学,多伦多大学,M5S 1A8,M5S 1A8,CANACE 3,MI5 STRON,MI5 SORICL STRONT,ME5 ME5 STRONICK MIRECTO 1A8, Canada 4 Department of Chemistry, University of Toronto, Toronto, ON M5S 1A8, Canada 5 Department of Molecular and Cellular Biology, University of Guelph, Guelph, ON N1G 2W1, Canada 6 Department of Medical Biophysics, University of Toronto, Toronto, ON M5S 1A8, Canada 7 These authors contributed equally 8 Present address: Department of Biochemistry, School of Medicine, Case Western Reserve University,克利夫兰,俄亥俄州44106,美国9铅联系 *通信:forman@sickkids.ca(j.d.f.-k.),lewiskay@utoronto.ca(l.e.k.)https://doi.org/10.1016/j.molcel.2023.12.019
掠夺性狩猎在动物生存中起着至关重要的作用。与运动相关的振动体感信号传导对于小鼠的猎物检测和狩猎至关重要。然而,关于转化振动体感知提示以触发掠食性狩猎的神经回路知之甚少。在这里,我们报告了雄性小鼠振动区域的机械力是掠夺性狩猎的关键刺激。机械诱发的掠食性狩猎是通过脊柱三叉神经核(SP5I)中胆囊基蛋白阳性(CCK +)神经元的化学灭活消除的。CCK + SP5I神经元对机械刺激的强度做出了反应,并将神经信号发送到了与刻板印象捕食狩猎运动作用相关的上丘。突触失活了CCK + SP5I神经元到上丘的投影,机械诱发的掠夺性攻击受损。一起,这些数据揭示了脊柱三叉神经回路,该回路特定于翻译振动的体感提示来引发掠夺性狩猎。
组蛋白是基本的核蛋白,负责真核生物中染色体纤维的核小体结构。核小体由大约146 bp的DNA包裹在组蛋白八聚体周围,该组蛋白八聚体由四个核心组蛋白(H2A,H2B,H3和H4)组成。通过接头组蛋白H1与核小体之间的DNA的相互作用进一步压实染色质纤维,以形成高阶染色质结构。该基因是无固有的,并且编码是组蛋白H3家族成员的复制依赖性组蛋白。该基因的转录本缺乏Polya尾巴;取而代之的是,它们包含一个终止终止元素。 该基因与6p22-p21.3染色体基因簇中的其他H3基因分开。该基因的转录本缺乏Polya尾巴;取而代之的是,它们包含一个终止终止元素。该基因与6p22-p21.3染色体基因簇中的其他H3基因分开。
果蝇GAGA因子(GAF)是一种多功能蛋白,与核小体组织有关,并重塑基因表达,长距离增强子促进剂通信,高阶染色体结构和有丝分裂。这种广泛的活动提出了有关单个蛋白质如何执行许多看似与众不同和无关的功能的问题。当前的研究认为,GAF充当“先驱”因子,为不同类别的调节元素产生染色质的无核小体区域。从调节元件中去除核小体反过来使其他因素可以与这些元素结合并执行其专业功能。与这种观点一致,GAF与染色质重塑剂的集合相关联,并与与不同调节功能有关的蛋白质相互作用。在这篇综述中,我们总结了GAF的已知活动及其蛋白质伙伴的功能。
魔术 - 晶体:在异质样品中稀缺大分子的结构性确定Yasuhiro arimura 1,2*,hide A. Konishi 1,Hironori funabiki 1* 1* 1 1* 1 1* 1个伪装体和细胞生物学实验室,纽约州纽约州立大学,纽约州纽约州立大学。中心,美国华盛顿州西雅图市,98109-1024 *通信:funabih@rockefeller.edu,yarimura@rockefeller.edu或yarimura@fredhutch.org摘要冷冻冷冻级单 - 单点分析通常需要在0.05〜5.5.5.0 mg/ml上达到目标Macromolecule浓度,以下是iSMACromolecule浓度。在这里,我们设计了磁隔离和浓度(魔术)-cryo-em,这是一种能够对磁珠上捕获的靶标的直接结构分析,从而将目标的浓度需求降低到<0.0005 mg/ml。将魔术 - 晶体EM适应染色质免疫沉淀方案,我们表征了连接器组蛋白H1.8相关的核小体的结构变化,这些核小体是从异叶鸡蛋提取物中的相间和中期染色体分离出来的。将重复的选择组合以排除垃圾颗粒(Duster),这是一种去除低信噪比粒子颗粒的粒子策划方法,我们还解决了H1.8结合的核纤维蛋白NPM2的3D冷冻EM结构与与跨相染色体和露出不同的敞开和封闭的结构变体的3D冷冻EM结构。我们的研究表明,魔术 - 晶体EM对异质样品中稀缺的大分子的结构分析的实用性,并为H1.8与核小体关联的细胞周期调节提供了结构见解。关键字冷冻EM,磁珠,Xenopus鸡蛋提取物,核小体,接头组蛋白H1,核纤维蛋白
NOD 样受体家族含吡啶结构域 3 (NLRP3) 炎症小体是一种寡聚复合物,可响应病原体感染的外源信号和非微生物来源的内源性危险信号而组装。当 NLRP3 炎症小体组装激活 caspase-1 时,它会促进炎症细胞因子白细胞介素-1B 和 IL-18 的成熟和释放。NLRP3 炎症小体的异常激活与各种疾病有关,包括慢性炎症、代谢和心血管疾病。NLRP3 炎症小体可以通过几种主要机制激活,包括 K + 外排、溶酶体损伤和线粒体活性氧的产生。有趣的是,代谢危险信号会激活 NLRP3 炎症小体以诱发代谢疾病。 NLRP3 包含三个关键结构域:N 端吡啶结构域、中央核苷酸结合结构域和 C 端富含亮氨酸重复结构域。蛋白质-蛋白质相互作用充当“踏板或刹车”,控制 NLRP3 炎症小体的激活。在这篇综述中,我们介绍了代谢危险信号诱导后或通过与 NLRP3 的蛋白质-蛋白质相互作用(可能发生在代谢疾病中)激活 NLRP3 炎症小体的潜在机制。了解这些机制将有助于开发治疗 NLRP3 相关代谢疾病的特定抑制剂。
近年来,人们对磁场对生物系统的影响的研究兴趣浓厚,尤其是与磁感应有关的研究——磁感应是生物体感知地球地磁场以进行导航的能力。目前,有三种公认的主要理论来解释这一有趣的现象。例如,一种假设认为,一些候鸟可能依靠喙中的微小磁性沉积物来定位。然而,由于缺乏确凿的证据,这一想法仍然是研究人员争论的话题。1 另一种有趣的理论认为,某些光敏蛋白(称为隐花色素)存在于选择性动物的眼睛中,可能充当地球磁场的化学探测器。这一想法近年来得到了广泛的关注,但与磁性沉积物假设一样,它也等待进一步的实验验证。磁感应的一个有趣的替代理论围绕磁趋化细菌 (MTB) 展开,这是一种沿着地磁场线定位的微生物。磁感应假说认为,这些与动物共生的细菌可能成为动物磁感应的潜在机制。”2,3 该理论提出,MTB 是长期存在的磁感应之谜的答案。
几代人满足自己的需求(https://www.un.org/sustainabledevelvement/development-agenda)。第四代国际论坛于2009年提出的以下围绕可持续性:核能系统将提供可持续的能源产生,以符合清洁的空气目标,并为全球能源生产提供系统的长期可用性和有效的燃料利用。They will minimise and manage their nuclear waste and notably reduce the long-term management burden, thereby improving protection for the public health and the environment (https://www.gen-4.org/gif/jcms/c_9502/generation-iv-goals) 8 In September 2018, the US Department of Energy (DOE) and the Department for Business, Energy, and Industrial Strategy (BEIS) signed the Civil Nuclear Energy Research