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用于 CRISPR 应用的 gRNA 和核糖核蛋白的表征
‒ 例如，(0.99) 99 = 37% 粗产量 ‒ 杂质更多，色谱分离更困难 ‒ pegRNA（基于 Cas9 sgRNA 进行主要编辑）甚至更长（~140 聚体）
用于基因组编辑的 Cas9 核糖核蛋白的制备
通过递送预组装的 Cas9 核糖核蛋白 (Cas9 RNP) 进行基因组编辑是一种越来越流行的方法，适用于难以通过传统质粒和病毒方法进行遗传操作的细胞类型。Cas9 RNP 编辑稳健、精确、能够多路复用且不含遗传物质。它在细胞中的短暂存在限制了残留的编辑活性。该方案描述了通过异源表达和从大肠杆菌纯化来制备重组化脓性链球菌 Cas9 (SpCas9) 蛋白，以及通过体外转录和 PAGE 纯化合成 CRISPR 向导 RNA。SpCas9 是第一个发现的 CRISPR Cas9（Jinek 等人，2012 年），也是基因组编辑应用中最典型的 Cas 酶之一。使用这种 Cas9 RNP 配方，我们已证明通过电穿孔在原代人类 T 细胞和自然杀伤 (NK) 细胞中以及通过聚乙二醇介导的转化在真菌和植物中实现了高效的基因组编辑。我们的 Cas9 RNP 制备协议是一致且简单的，可用于其他细胞类型和生物体的基因组编辑。
前列腺癌中的聚（ADP-核糖）聚合酶抑制剂
摘要 基因组不稳定性是癌症的标志之一。在癌症进展过程中，同源重组修复基因的遗传变异发生率增加，20% 的前列腺癌 (PCas) 存在 DNA 修复基因缺陷。几种体细胞和种系基因变异驱动前列腺癌肿瘤发生，其中最重要的是 BRCA2、BRCA1、ATM 和 CHEK2。有一组 BRCAness 肿瘤与经典 BRCA 突变肿瘤具有相同的表型和基因型特性。聚（ADP-核糖）聚合酶抑制剂 (PARPis) 在同源重组基因受损的癌细胞中表现出合成致死性，具有这些变异的患者是 PARPi 治疗的候选人。雄激素剥夺疗法是 PCa 治疗的主要手段。PARPis 通过与雄激素核复合物的分子机制相互作用来降低雄激素信号传导。 PROFOUND III 期试验比较了奥拉帕尼和恩杂鲁胺/阿比特龙疗法，结果显示，在携带 BRCA1、BRCA2 或 ATM 突变的转移性去势抵抗性前列腺癌 (mCRPC) 患者中，放射学无进展生存期 (rPFS) 和总生存期 (OS) 均有所增加。PARPis 的临床疗效已在卵巢癌、乳腺癌、胰腺癌以及最近在前列腺癌亚组中得到证实。越来越多的证据表明，分子肿瘤委员会是前列腺癌肿瘤治疗方法的未来。在这篇综述中，我们总结了有关 PARPis 在前列腺癌中的分子机制以及临床前和临床数据。
核糖开关作为治疗靶标：抗生素新时代的承诺
摘要简介：细菌病原体中抗生素耐药性的生长是一种即将来临的全球威胁，只能通过开发新的抗菌药物来避免。有希望的答案可能是核糖开关的靶向，几乎完全在细菌中发现的结构化RNA元素。涵盖的区域：本综述将核糖开关作为新型抗菌药物靶标的潜力。总结了当前可用抗生素的作用机理，然后划定了核糖开关的功能机理。然后，我们讨论了开发新方法的潜力，这些方法在其细菌基因表达的背景下靶向范式核糖开关。专家意见：我们重点介绍了以其功能形式靶向核糖开关的潜在优势，该功能形式嵌入了基因表达中，对细菌存活至关重要。我们强调了这种方法的好处，包括潜在的较高的物种特异性和较低的副作用。
DNA中的核糖核苷单磷酸盐数据库
抽象动机：核糖核苷单磷酸盐（RNMP）是嵌入基因组DNA中的最丰富的非标准核定体。如果无法控制DNA中RNMP的存在，则可能导致基因组不稳定性。DNA中RNMP的实际正函数主要未知。考虑到RNMP嵌入与各种疾病和癌症之间的关联，近年来，DNA中RNMP的嵌入现象已成为近年来的重要研究领域。结果：我们介绍了RNMPID数据库，这是第一个揭示RNMP插入特征，链偏置和首选掺入模式的数据库，这些数据库是来自不同遗传背景的细菌至人类细胞的基因组DNA中的首选掺入模式。RNMPID数据库使用不同RNMP映射技术的数据集。它为研究人员提供了坚实的基础，以阐明多种来源的基因组DNA中嵌入的RNMP的特征及其与细胞功能的关联，以及将来的疾病。它还显着使研究人员在遗传学和基因组学领域的研究人员旨在将研究与RNMP嵌入数据融为一体。可用性：RNMPID可以在网络上自由访问，网址为https://www.rnmpid.org。联系人：xph6113@gmail.com或storici@gatech.edu
卵巢癌中的聚（ADP-核糖）聚合酶抑制剂的抗性
卵巢癌（OC）是最常见的妇科恶性肿瘤之一。OC的预后最差和死亡率最高。根据美国癌症协会（Siegel等，2022年）的数据，仅在2022年，仅在2022年就估计了超过19,000例新的OC和12,000例死亡。oc是女性中第七种最常见的恶性肿瘤类型，也是全球死亡率的第八个原因（Gaona-Luviano等，2020）。早期患者的预后更好，但大多数患者在晚期阶段被诊断出来。上皮OC在晚期患者中约为80％。手术伪造和基于铂的化学疗法（例如卡铂和紫杉醇）是一线治疗方案。然而，这些治疗的长期结果并不令人满意。DNA损伤修复缺陷存在于各种肿瘤细胞中。这是肿瘤起始和肿瘤疗法的机制之一。由BRCA基因编码的蛋白质与通过同源重组（HR）途径的DNA双链损伤有关。乳腺癌1/2基因（BRCA1/2）以及其他参与同源重组修复（HRR）基因突变或功能可能会导致同源重组率（HRD），从而导致细胞中的恶性转化（Chiappa等，2021）。parpi已成为OC的分子靶向治疗策略。研究表明，Parpis可以显着改善OC的自由生存（PFS）和总生存率（OS），尤其是在新诊断和通过“综合杀伤力”机制，聚（ADP-核糖）聚合酶抑制剂（PARPI）阻止HRD肿瘤细胞中DNA单链断裂的修复，积累了大量DNA双链链破裂（DSB）（DSB），导致肿瘤细胞的死亡，从而表现出肿瘤的死亡，从而表现出抗肿瘤的死亡。 Al。，2021）。
高效与CRISPR相关的蛋白9核糖核蛋白基于Euglena Gracilis
euglena gracilis是一种单细胞的光养生者，是一种有前途的食物，饲料和生物燃料的材料。但是，该物种中有针对性的诱变方法的发展一直是长期的挑战。在当前的遗传操纵技术中，通过RNP的直接递送进行基因组编辑具有各种优势，包括时间效率，低细胞毒性，高效率和降低距离效应（Jeon等，2017）。在我们的方法，插入和/或缺失（INDEL）突变率为77.7％–90.1％的突变率中，通过在Eggsl2基因中的两个不同靶序列中进行了扩增子测序（Nomura等，2019）。因此，我们在大肠杆菌中开发的基于RNP的基因组编辑开辟了新的途径以揭示基因的功能。
CRISPR-CAS9核糖核蛋白的包装递送加速基因组编辑
图1：用荧光相关光谱（FCS）量化CAS9 RNP核浓度a）工作流的实验示意图，以量化编辑所需的CAS9 RNP核浓度。b）Cas9 rnp或gRNA的扩散时间，在每个细胞中，在Hela细胞中传递，并在24小时（2.0 vs 1.0 ms，p值= 0.0004）时测量每个点，代表用两种组件扩散拟合模拟的单个细胞中平均扩散时间（图。s1）。fcs在MS中提供的扩散时间，每个FCS条件中提供至少两个生物学重复（平均值±SEM）。c）用Cas9 RNP电穿孔的HeLa细胞的FCS分析。Cas9 RNP的核浓度是剂量的函数（每个细胞Cas9）。 每个点表示单个细胞中的浓度。 fcs值在NM中提供，每个FCS条件至少有两个生物学重复（平均值±SEM）。 通过将FCS跟踪与两个组件3D扩散方程拟合（有关详细信息，请参见方法），从而得出了所有浓度值和扩散时间。 d）（左轴）CAS9 RNP与剂量的平均核浓度显示出很强的线性相关性。 （r 2 = 0.96）。 （右轴）由FCS计算出的核浓度值和HeLa核的体积（690μm3）估计的Cas9数量（46）。 e）HELA，U2OS和HEK293T细胞的核浓度的FCS分析。 fcs值在NM中提供，每个FCS条件至少有两个生物学重复（平均值±SEM）。Cas9 RNP的核浓度是剂量的函数（每个细胞Cas9）。每个点表示单个细胞中的浓度。fcs值在NM中提供，每个FCS条件至少有两个生物学重复（平均值±SEM）。通过将FCS跟踪与两个组件3D扩散方程拟合（有关详细信息，请参见方法），从而得出了所有浓度值和扩散时间。d）（左轴）CAS9 RNP与剂量的平均核浓度显示出很强的线性相关性。（r 2 = 0.96）。（右轴）由FCS计算出的核浓度值和HeLa核的体积（690μm3）估计的Cas9数量（46）。e）HELA，U2OS和HEK293T细胞的核浓度的FCS分析。fcs值在NM中提供，每个FCS条件至少有两个生物学重复（平均值±SEM）。在补充表2中报告了FC的精确值，包括实验和生物学重复，平均值和SEM
BRE-063-核糖列米 - 氨基芳香族抑制剂V3。 ...
•病毒学筛查：所有引用全身性抗癌治疗的新患者均应针对乙型肝炎和C进行筛查，并在治疗开始前进行了审查。先前未测试的患者也应筛查丙型肝炎和C。在个人风险评估和临床医生酌情下，将进行进一步的病毒学筛查。•在每个周期开始时，在基线时监视FBC，U＆E和LFT。如果记录了等级>/= 2个肝异常（请参见下面的表2），建议进行更频繁的监测。•在开始治疗之前，正确的钾，钙，磷和镁的异常。•如果neuts>/= 1且PLT>/= 100进行治疗。•如果NEUTS <1或PLT <100扣留Ribociclib和警报顾问。•心脏监测和指导：•ECG开始治疗前，然后在周期1的第1天和第2周期之前的第14天，然后如临床上所示。•仅在QTCF值小于450毫秒的患者中才能开始治疗。•如果治疗期间QTCF延长，建议进行更频繁的ECG监测。应避免使用核糖核酸杆菌的使用，患有QTC延长的患者或有重大风险的患者，包括：长期QT综合征，患有不受控制或严重心脏疾病的患者，包括最近的心肌梗塞，充血性心力衰竭，不稳定的心绞痛和心律不齐，以及电解质异常的患者。•修改剂量：首先将剂量降低至400毫克/天，第二剂量减少至200mg/天。如果需要进一步减少剂量，请停止治疗•与顾问讨论血小板减少症的血小板细胞减少症讨论，请参见下表，请参见下表。