桃子

基因组变异和LTR-RT分析的古老桃子兰德拉斯揭示了血液果实形成和果实成熟日期的机制

桃（Perrunus persica）Landrace具有典型的区域特征，强大的环境适应性，并包含许多有价值的基因，为繁殖优秀品种奠定了基础。因此，有必要组装特定陆地的基因组，以促进这些基因的定位和利用。在这里，我们从头组装了一个来自中国北平原的古老血液中国兰德·舒伊米（TJSM）的高质量基因组。组装的基因组大小为243.5 MB，重叠元素N50为23.7 MB，支架N50为28.6 MB。与报道的桃基因组相比，我们组装的TJSM基因组具有最大数量的特定结构变体（SVS）和长时间重复返回转树（LTR-RTS）。有可能调节其宿主基因的潜力，我们在NAC转录因子编码PPBL的启动子中鉴定了6688 bp ltr-rt（命名为IT血液TE），这是一种调节乳头的基因PPBL。血液不仅与血液表型共分离，而且还与果实成熟日期的进步和血液形成的不同强度有关。我们的发现提供了有关血液颜色发展和确定水果成熟日期的基础机制的新见解，并突出了TJSM基因组对桃子水果中的农艺性状相关的更多变化的潜力。