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橙皮苷通过细胞凋亡和炎症信号介导机制抑制口腔癌细胞生长：体外和计算机模拟分析的证据
利用 MTT 测定法，揭示了橙皮苷的剂量依赖性细胞毒作用，显著的 IC50 值表明其对细胞增殖具有强效抑制作用。与这些发现 (p<0.05) 相辅相成的是，qRT-PCR 分析证明了橙皮苷对 KB 细胞系内关键分子靶标的调节影响。橙皮苷治疗导致 TNF- α 、白细胞介素-1β (IL-1- β )、IL- 6、活化 B 细胞的核因子 κ 轻链增强子 (NF- κ B) 和 B 细胞淋巴瘤 2 (Bcl-2) mRNA 表达水平显著降低 (p<0.05)，突出了其在细胞增殖、迁移和炎症过程中的抑制作用。同时，橙皮苷促进了 BAX mRNA 的表达 (p<0.05)，表明细胞死亡增加。分子对接模拟进一步揭示了橙皮苷和靶蛋白之间强大的结合亲和力，表明其有可能破坏口腔癌细胞的细胞功能和炎症信号通路。
通过计算机模拟分析 admet 特性和抑制...
1 犹他大学生物化学系，犹他州，美国 2 拉各斯州立大学理学院化学系，拉各斯，尼日利亚 3 拉各斯州立大学理学院生物化学系，拉各斯，尼日利亚 *通讯作者电子邮件地址：zechariaholuwadamilola@gmail.com 摘要：不同类别的生物碱已证明具有抗癌治疗功效。干扰素诱导的四肽重复序列 5 蛋白 (IFIT5) 与肾细胞癌 (RCC) 的发病机制有关。人们对这些药理相关类别的生物碱对 IFIT5 的抑制作用知之甚少。因此，我们确定了这些生物碱的 ADMET 特性，以及它们对 IFIT5 的抑制潜力。从 PubChem 中检索到 50 种生物碱。IFIT5 的结构是从蛋白质数据库中获得的，并使用 Biovia Discovery Studio 进行处理以消除非标准分子。使用 PyRx 进行分子对接以评估蛋白质-配体复合物的结合亲和力，而使用 AdmetSAR 和 swissADME 进行 ADMET 分析。对接结果显示，所有 50 种选定的生物碱均表现出较高的 IFIT5 结合效果，范围从 -7.1 到 -11.0 kcal/mol，超过二（羟乙基）醚共结晶配体（-3.9 kcal/mol），其中 nortopsentin A 成为最有希望的候选药物。此外，前五种 IFIT5 结合生物碱中的四种（nortopsentin A、stylopine、氧化苦参碱和脱氧微管蛋白）表现出良好的类药物特性。这些生物碱（尤其是 nortopsentin A）表现出的良好类药物特性和强大的 IFIT5 结合影响凸显了它们在开发用于靶向 RCC 治疗的选择性 IFIT5 抑制剂的临床前/临床试验中的潜力。关键词：肾细胞癌，IFIT5，生物碱，结合亲和力，药代动力学，毒性介绍肾细胞癌 (RCC) 是一种隐匿性肿瘤，约占全球癌症诊断和死亡的 2% (Padala 等人，2020 年)。RCC 的一个独特特征是许多患者通常无症状；据估计，超过 50% 的患者在因无关问题进行影像学检查时被偶然诊断出患有 RCC (Rosner 等人，2021 年)。与 RCC 相关的几个主要风险因素包括吸烟、体重过重、饮酒、高血压、糖尿病、慢性肾病，以及遗传因素，例如 von Hippel-Lindau (VHL) 肿瘤抑制基因突变 (Al-Bayati 等人，2019 年)。大多数肾细胞癌发生在肾脏皮质，由肾小球、肾小管和集合管组成（El-Zaatari 等人，2020 年）。发达国家的肾细胞癌病例通常通过影像学诊断，只有 10% 的患者出现经典的三联症状，包括血尿、腰痛、可触及的肿块、发热、体重减轻和白细胞增多（Satwikananda 等人，2023 年）。
基于结构的多靶点分子对接及分子动力学模拟分析筛选卵巢癌潜在抑制剂
卵巢癌 (OC) 是女性最常见的癌症之一。OC 是最致命和预后最差的疾病之一。目前，尚无获批的 OC 筛查测试或早期检测方法。因此，仍然迫切需要新的筛查、预防和早期检测策略。植物化合物最近在开发新的、有效的和负担得起的抗癌药物方面变得越来越重要。为了研究蛋白质-配体相互作用，使用分子对接和分子操作环境 (MOE) 工具来寻找目标蛋白的最佳抑制剂。使用分子对接计算化合物对 NY-ESO-1、RUNX3 和 UBE2Q1 蛋白活性位点的空间亲和力。使用 ADMET 分析来确定所选化合物的药物相似性，而使用 MD 模拟和 MMGBSA/MMPBSA 实验来进一步了解结合行为。临床前测试可以帮助确认我们的计算机研究的有效性，并确定该化合物是否可以用作治疗 OC 的抗癌药物。关键词：卵巢癌，抗癌药物，NY-ESO-1，RUNX3，UBE2Q1
分子动力学模拟分析人工智能系统应用研究
图 1：由 intDesc-MD 确定的配体-蛋白质相互作用。 （a）细分为 10 种类型。相互作用类型描述中显示L：配体、S1：水、Pro：蛋白质，在两个#符号之间的部分描述了连接它们的以下相互作用类型。 vdW：范达华尔兹相互作用，HB_OH_O：氢键（OH-O），HB_NH_O：氢键（NH-O），CH_O：CH-O相互作用，Elec_NH_O：静电相互作用（NH-O）。（a）观察到的 10 种最丰富的相互作用类型总和随时间的变化。
在真实的人类左心模型中对 MitraClip 进行计算机模拟分析
摘要：二尖瓣反流是一种常见的心脏瓣膜疾病，与高发病率和死亡率相关。使用 MitraClip 装置进行经导管二尖瓣修复已成为不适合常规手术的患者的一种安全有效的替代方法。然而，MitraClip 植入左心室的结构和血流动力学影响尚未得到广泛探索。本研究旨在使用高精度人体心脏模型评估 MitraClip 装置的结构和血流动力学性能，特别关注健康的二尖瓣几何形状。使用有限元法进行结构分析和使用格子波尔兹曼法进行计算流分析，模拟了 MitraClip 装置的植入。MitraClip 植入会引起二尖瓣的几何变化，导致受该装置约束的瓣叶区域主应力的局部最大值。血流动力学评估显示左心室壁附近有缓慢移动的嵌套螺旋流，心尖区域有高流速。涡流分析表明，在植入 MitraClip 后，二尖瓣的双孔面积配置会引起异常血流动力学状况。通过以患者特定的方式预测可能的不良事件和并发症，计算建模支持循证决策，并提高经导管二尖瓣修复的整体有效性和安全性。
使用价值聚焦思维和蒙特卡罗模拟分析 UH-60 黑鹰安全控制
过去几年，陆军航空事故不断增加，这主要是由于任务频率和复杂性增加以及资源减少。由此造成的损失（人员伤亡、金钱、设备）的严重性促使陆军安全中心指挥官要求全面审查安全隐患和后续安全控制的评估和选择方式。该项目通过开发和使用有效识别和评估控制组合的方法，将价值导向思维、蒙特卡罗模拟和整数规划相结合，以满足这一需求。整数规划生成控制组合，以最大程度地减少导致陆军航空事故的危险。使用引导方法的蒙特卡罗模拟用于模拟 100,000 个 UH-60 飞行小时内发生的事故造成的损失数量和类型。已经开发了一个价值模型来量化这些损失的严重程度。控制组合的预期绩效计算为实施这些控制措施所导致的损失严重程度的预期下降。
使用价值聚焦思维和蒙特卡罗模拟分析 UH-60 黑鹰安全控制
过去几年，陆军航空事故不断增加，这主要是由于任务频率和复杂性增加以及资源减少。由此造成的损失（人员伤亡、金钱、设备）的严重性促使陆军安全中心指挥官要求全面审查安全隐患和后续安全控制的评估和选择方式。该项目通过开发和使用有效识别和评估控制组合的方法，将价值导向思维、蒙特卡罗模拟和整数规划相结合，以满足这一需求。整数规划生成控制组合，以最大程度地减少导致陆军航空事故的危险。使用引导方法的蒙特卡罗模拟用于模拟 100,000 个 UH-60 飞行小时内发生的事故造成的损失数量和类型。已经开发了一个价值模型来量化这些损失的严重程度。控制组合的预期绩效计算为实施这些控制措施所导致的损失严重程度的预期下降。
脑动脉组织区域血流及选择性药物颗粒靶向肿瘤输送的模拟分析
脑瘤被认定为脑内生长异常的细胞。大多数脑瘤都是恶性脑瘤，每天约有 650 人被确诊为这种类型的脑瘤。1 脑瘤发展迅速、预后不良，对人类健康影响较大。治疗脑瘤的方法有很多，例如化疗、靶向治疗。血脑屏障 (BBB) 是保护大脑的屏障，它将循环血液与脑细胞外液隔开，并且该屏障只允许某些抗生素通过。血脑屏障 (BBB) 的存在阻碍了肿瘤的治疗，并阻碍了大多数现有的有效药物的治疗。纳米技术是一种很有前途的方法，其中不同类型的纳米粒子可用于生物医学用途，它们具有不同的特性和应用，能够将药物输送到目标区域。
跨介质飞行器水气两相流气动数值模拟分析
摘要：跨介质飞行器是一种既能在水中潜航，又能在空中飞行的新型概念飞行器。本文基于多旋翼无人机入出水结构模型，设计了一种新型水空多介质跨介质飞行器。基于设计的跨介质飞行器结构模型，利用OpenFOAM开源数值平台进行单介质气动特性分析和多介质跨介质流动分析。采用滑移网格计算单介质空气旋翼和水下螺旋桨的旋转流动特性。为防止网格运动变形引起的数值发散，采用重叠网格法和多相流技术对跨介质飞行器入出水进行数值模拟。通过以上分析，验证了跨介质车辆在不同介质中的流场特性，并得到了跨介质过程中不同入水角度下车体载荷及姿态的变化情况。
通过计算机模拟分析确认胰岛素受体是已报道的 GLUT4 抗糖尿病天然化合物的靶点
1 尼日利亚贡贝州 Kaltungo-770117 联邦理工学院理学院实验室技术系。2 印度科学教育与研究学院生物科学系，Berhampur，Odisha-760010。3 印度马哈拉施特拉邦 Pune-411038，Vishwanath Karad 博士世界和平大学药学院。4 印度加尔各答大学生物物理学、分子生物学和生物信息学系，加尔各答-700073。5 印度喀拉拉邦 Marampally Aluva MES 学院生物科学系，683107。6 济南大学化学化工学院，济南-250022，中国。7 菲律宾马尼拉 Sampaloc，圣托马斯大学药学院生物化学系，1008。 8 菲律宾马尼拉桑帕洛克圣托马斯大学自然与应用科学研究中心，邮编 1008。9 Bioshack India Pvt. Ltd.，印度新德里 110001。10 英国朴茨茅斯大学生物科学学院，邮编 朴茨茅斯街 PO1 2DY。