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国家现状和采样与分析方法...
3.2.3.1.3.现场收集变化............................................... I.26 3.2.3.2.包装 .............................................................................. I.27 3.2.3.2.1.东海岸和西海岸 ........................................................ I.27 3.2.3.2.1.1.有机样品............................................. I.27 3.2.3.2.1.2.主要和微量元素样品 ......... I.27 3.2.3.2.2.墨西哥湾沿岸............................................................. I.27 3.2.4.辅助测量......................................................................... I.28 3.2.4.1.潮汐水平线...................................................................... I.28 3.2.4.2.深度............................................................................... I.29 3.2.4.3.海洋帕金斯虫............................................................. I.29 3.2.4.4.贝壳大小....................................................................... I.29 3.2.4.5.放射性核素样本....................................................... I.29 3.2.4.6.粪甾烷醇和产气荚膜梭菌............................................. I.29 3.2.4.7.性腺指数....................................................................... I.29 3.2.4.8.温度....................................................................... I.30 3.2.4.9.盐度 ................................................................................ I.30 4.质量保证 ................................................................................................ I.30 4.1.方法............................................................................................. I.30 4.1.1.方法论 .................................................................................... I.30 4.1.2.标准参考和控制材料............................................................. I.30 4.1.3.程序和标准............................................................................. I.31 4.1.4.仪器校准............................................................................. I.31 4.1.5.样品定量 ............................................................................. I.31 4.1.6.方法检测限................................................................................. I.31 4.1.7.精度............................................................................................... I.31 4.1.8.准确性................................................................................................ I.32 4.2.对照样品............................................................................................... I.32 4.3.数据可接受性标准和存档........................................................................ I.33 4.4.比对练习............................................................................................. I.33 4.5.质量保证研讨会......................................................................................... I.33 4.6.标准参考材料的开发............................................................................. I.33 4.7.NIST 痕量有机练习............................................................................. I.33 4.8.NRC 痕量元素练习............................................................................. I.34 5.分析程序............................................................................................. I.34 5.1.介绍................................................................................................................ I.34 5.1.1.痕量有机物............................................................................................... I.34 5.1.2.常量和痕量元素............................................................................... I.34 5.2.分析物限制讨论................................................................................. I.34 5.2.1.有机分析物....................................................................................... I.34 5.2.1.1.PCB............................................................................. I.34 5.2.1.1.1.PCB 定量....................................................... I.34 5.2.1.1.2.PCB 选择............................................................. I.35 5.2.1.1.3.PCB 共洗脱物............................................................... I.36 5.2.1.2.PAHs............................................................................... I.36 5.2.2.无机分析物............................................................................... I.39 5.2.2.1.铊 ............................................................................. I.39 5.2.2.2.锑............................................................................. I.39 5.2.2.3.硒............................................................................. I.40 5.2.2.4.NEFSC 沉积物元素分析............................. I.41锡 .................................................................................... I.40 5.3.分析物添加............................................................................................... I.40 5.4.国家底栖生物监测项目分析方法............................................... I.41 5.4.1.无机分析................................................................................. I.41 5.4.1.1 沉积物............................................................................... I.41 5.4.1.1.1.
胰岛素抵抗和2型糖尿病的个性化分子特征
图1。人类骨骼肌的蛋白质组和磷蛋白组是全身胰岛素敏感性的关键决定因素。研究设计示意图：我们招募了77个患有正常葡萄糖耐受性（NGT）（n = 43; 21雄性和22位女性）或2型糖尿病（T2D）（n = 34; 21雄性和13雌性和13个雌性）的个体，并收集了胰岛素前的30分钟。还招募了46个NGT（n = 12; 7名男性和5位女性）或T2D（n = 34; 21雄性和13个女性）的验证队列（a）。在夹具的稳态周期内的葡萄糖灌注速率的箱形图，其中水平线表示中位数（b）。排名的条图显示了所有个体的胰岛素灵敏度异质性（C）。可再现和高通量（Phospho）蛋白质组学在翠鸟机器人和Evoseop-timstofpro液相色谱量表质谱法设置上的蛋白质组学工作流程。样品以DIA-PASEF模式测量，并在Spectronaut软件（D）中进行量化。在至少5个样品中定量的蛋白质，磷酸蛋白，肽和位点的数量。丝氨酸，苏氨酸和酪氨酸残基上的位点磷酸化分布（E）。对蛋白质组（基线，禁食条件）和磷酸蛋白质组（基线和胰岛素）（F）的所有个体的变异系数计算的受试者间变异。蛋白质组（蓝色）和磷酸蛋白质组（基线=红色，胰岛素=紫色）与血糖临床指标的关联。Venn图描绘了M-Value与HOMA1-IR（G）之间关联的重叠。gir =葡萄糖输注率。T2D = 2型糖尿病。主成分分析M值对蛋白质组和磷酸蛋白质组有色。热图展示了Z尺寸的PC负载贡献跨性别，性别和夹具（H-I）。胰岛素灵敏度关联是基于Kendall与Benjamini-Hochberg校正的P值<0.05被认为是显着的。ngt =正常的葡萄糖耐受性。p <0.001 = ***。图1中显示的所有数据均来自发现队列。
从印度移民和印度 - 加拿大人中的非西方化向西方化肠道微生物组的过渡与饮食适应性有关
alpha多样性 - 使用16S扩增子序列，向前消失，反向读数在251个基础上被截断。框表示第一四分位数和第三四分位数之间的四分位间范围（IQR），水平线表示中位数，晶须是IQR的1.5倍以内的上和下值。alpha多样性。（a）Pielou的均匀度显示出显着差异（H = 85.7，P = 1.07E-17）。成对比较表明，印第安人的均匀均高于欧洲加拿大人（H = 56.2，Q = 6.51E-13），欧洲移民（H = 17.0，Q = 7.32e-05）和印度 - 加拿大人（H = 10.8，Q = 10.69e-03）。欧洲 - 加拿大的控制也比印度移民（H = 41.4，Q = 6.09e-10）和印度加拿大人（H = 21.7，Q = 8.10E-06）高得多。（b）香农的多样性显示出显着差异（H = 79.8，p = 1.89e-16）。成对比较表明，印第安人的多样性明显低于欧洲加拿大人（H = 56.7，Q = 3.91e-12），欧洲移民（H = 32.9，Q = 4.94E-08），印度 - 加拿大人，H = 14.3，Q = 14.3，Q = 2.59e-04）和Indo-Indo-Indo-Mignmants（H = 6. H = 17）6.66，6.66。欧洲 - 加拿大对照组的得分也明显高于印度移民（h = 20.0，q = 2.62e-05）和印度 - 加拿大人（h = 14.4，q = 2.59e-04）。beta多样性 - 使用shot弹枪序列，向前的反复读取和反向读数以10个碱基对修剪，固定最大长度为120个碱基对。使用Bray Curtis差异和加权Unifrac探索了Beta多样性，并使用成对的置换式多元方差分析（PermanOva）来测试组之间的差异。（c）Bray Curtis原理坐标分析（PCOA）图显示，在前两个轴上捕获了45.3％的变异。与Bonferroni校正的成对比较显示，大多数群体之间存在显着差异，印第安人和西方同类群的印第安人和印度移民的明显聚类。（d）加权unifrac PCOA图显示，在前两个轴上捕获了61.8％的变化，还检测到显着差异。成对比较结果可以在附录E中找到。印度的肠道表现出了杆菌和蛋白质细菌的占主导地位，欧洲加拿大人表现出很高的富公司。印度移民的消失（挥发性和/或与人类工业化社会有效）相关的大量分类单元，包括Eubacterium和Erysipelotrichaceae。印度 - 加拿大人拥有诸如Collinsella等消失的分类单元，以及Blossum（Bloom或在城市化/现代化社会中被选中）的大量丰富，例如Anaerostipes和Blautia。