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肥胖的遗传学和表观遗传学
首先，肥胖是遗传学问题，它在富裕国家的粮食可用性和久坐生活的条件下会更好地发展。能量平衡的控制（进气>积累>分散体）连接到相关的信号分子系统，该系统将下丘脑，脂肪细胞，肌肉组织和肾上腺相关联。到现在为止，已经在小鼠或大鼠中鉴定出了7种单基因肥胖症，但男性几乎没有同源对应。但是，可以说“常见”肥胖是多基因，即由于许多具有定量效应的基因（基因qTL-定量性状基因座）。此外，已经描述了“ common”肥胖与单核苷酸多义（SNP）之间的关系。在遗传变异中，特殊作用归因于最近鉴定的基因的多孔症，即FTO（脂肪质量和肥胖相关）。此外，众所周知，怀孕期间（尤其是在早产儿中）的限制以及过量的热量摄入量，出生后的快速蓬勃增长会导致表观疾病的重排，这将在成年早期的早期肥胖表型中引起一种主要与新代谢综合征相关的肥胖表型。
果蝇 Nab2 RNA 结合蛋白抑制 m6A...
摘要 果蝇多聚腺苷酸 RNA 结合蛋白 Nab2 与一种因遗传性智力障碍而丢失的人类蛋白质同源，它通过一组基本上未定义的靶 RNA 控制成年运动、轴突投射、树突树枝化和记忆。在本文中，我们展示了 Nab2 在调节头部转录组中约 150 个外显子/内含子的剪接方面的特殊作用，并重点研究了在雌性神经元中富集的性别决定因子 Sex-lethal ( Sxl ) 中雄性特异性外显子的保留。先前的研究表明，这种剪接事件在雌性中受 Mettl3 复合物对 N6-甲基腺苷 (m 6 A) 的修饰调控。在分子水平上，Nab2 与神经元中的 Sxl 前 mRNA 结合并限制特定位点的 Sxl m 6 A 甲基化。同时，降低 Mettl3、Mettl3 复合物成分或 m 6 A 读取器 Ythdc1 的表达可挽救 Nab2 果蝇的突变表型。总体而言，这些数据表明 Nab2 是 m 6 A 甲基化的抑制剂，并意味着神经组织中 Nab2 和 Mettl3 调节的 RNA 之间存在显著重叠。
免疫细胞中的蛋白酶体组成意味着特殊的免疫细胞特异性免疫蛋白酶体功能
免疫蛋白酶体是一类特殊的蛋白酶体，可以在炎症环境中用IFN-γ诱导。近年来，很明显某些免疫细胞类型组成型表达高水平的免疫蛋白酶体。然而，关于不同类型的免疫细胞中蛋白水解的免疫蛋白酶体亚基的基础表达的信息仍然很少见。Hence, we quantified standard protea- some subunits ( β 1c, β 2c, β 5c) and immunoproteasome subunits (LMP2, MECL-1, LMP7) in the major murine (CD4 + T cells, CD8 + T cells, CD19 + B cells, CD11c + dendritic cells, CD49d + natural killer cells, Ly-6G + neutrophils) and human免疫细胞（CD4 + T细胞，CD8 + T细胞，CD19 + B细胞，CD1C + CD141 +髓样树突状细胞，CD56 +天然杀伤细胞，粒细胞）子群。从外周血和脾脏的鼠免疫细胞亚群中分离出不同的人类免疫细胞类型。我们发现，大多数免疫细胞子集的促性疾病主要由免疫蛋白酶体亚基组成。我们的数据将作为免疫蛋白酶体表达的参考和指南，这意味着免疫蛋白酶体在免疫细胞中的特殊作用。
顶复门寄生虫中的微管蛋白超家族
摘要：微管和含有特殊微管的结构由微管蛋白组装而成，微管蛋白是真核生物必需蛋白的一个古老超家族。在这里，我们使用生物信息学方法来分析来自顶复门的生物体中微管蛋白的特征。顶复门是原生动物寄生虫，可引起多种人类和动物传染病。单个物种分别含有 1 到 4 个 α - 和 β - 微管蛋白同型基因。这些基因可能指定高度相似的蛋白质，表明功能冗余，或表现出与特殊作用相一致的关键差异。一些（但不是全部）顶复门含有 δ - 和 ε - 微管蛋白基因，这些基因存在于构建含有附属物的基体的生物体中。顶复门 δ - 和 ε - 微管蛋白的关键作用可能仅限于微配子，这与单个发育阶段对鞭毛的有限要求相一致。其他顶复门的序列分化或 δ - 和 ε - 微管蛋白基因的丢失似乎与中心粒、基体和轴丝的需求减少有关。最后，由于纺锤体微管和鞭毛结构已被提议作为抗寄生虫疗法和传播阻断策略的目标，我们将在基于微管蛋白的结构和微管蛋白超家族特性的背景下讨论这些想法。
前额皮质在意识感知中的作用
近年来，前额叶皮层 (PFC) 在意识感知中的作用引起了人们的极大兴趣，因为它已成为区分人类意识主流神经理论的关键问题。关于这一作用，人们可以发现三种主要且相互矛盾的观点。全球主义观点认为，PFC 是全球工作空间的主要枢纽，其激活是任何意识体验的关键组成部分。高阶思维理论认为，PFC 具有更专业的作用，它支持高阶反思或评估，而高阶反思或评估被认为是意识的基本要素。相比之下，局部主义观点认为，意识内容与内容特定皮层区域的局部激活有关，而前额叶皮层在一般意识体验中并没有特殊作用。根据局部主义观点，正如后皮层区域是视觉感知意识体验的基础一样，前额叶皮层也是特定类别意识内容（如报告、思考、言语和内省）意识体验的基础。在这里，我将回顾从人类成像和记录、皮层损伤和清醒患者的直接电刺激中获得的实验证据。这三种方法的发现共同支持了局部主义观点和共同的基本原则，即每个皮层区域都专注于特定且独特的意识内容类别。
3D多尺度移动边界方法
摘要：与大脑相关的实验受自然的限制，因此生物学见解通常受到限制或不存在。这在脑癌的背景下尤其有问题，这些脑癌的存活率较差。为了生成和检验新的生物学假设，研究人员开始使用可以模拟肿瘤进化的数学模型。但是，这些模型中的大多数都集中在单尺度的2D细胞动力学上，并且无法捕获3D大脑中复杂的多尺度肿瘤侵袭模式。在这些入侵模式中的特殊作用可能是通过微纤维的分布来发挥的。为了明确研究脑微纤维在3D入侵肿瘤中的作用，在这项研究中，我们扩展了先前引入的2D多尺度移动边界框架，以考虑3D多尺度肿瘤动力学。T1加权和DTI扫描用作我们模型的初始条件，并参数扩散张量。数值结果表明，包括各向异性扩散项在某些情况下（对于特定的微生物分布）可能导致肿瘤形态的显着变化，而在其他情况下则没有影响。这可能是由潜在的大脑结构及其显微镜表示引起的，它似乎通过基本的细胞粘附过程影响了癌症的侵袭模式，从而使扩散过程黯然失色。
人类 DHFR2 基因的差异翻译能力表明存在低丰度的发育和组织特异性内源性蛋白质
根据预测翻译蛋白的重组版本的酶活性，人类二氢叶酸还原酶 2 ( DHFR2 ) 基因已被归因于功能性作用。然而，其体内功能仍不清楚。DHFR2 与其亲本同源物 DHFR 之间的高氨基酸序列同一性 (92%) 使内源性蛋白质的分析具有挑战性。本文介绍了一种针对几种人类细胞系和组织类型的靶向质谱蛋白质组学方法，以识别 DHFR2 特异性肽作为其翻译的证据。我们提供了确凿的证据，表明线粒体中的 DHFR2 活性实际上是由 DHFR 而不是 DHFR2 介导的。 Ribo-seq 数据分析和使用蔗糖垫进行的核糖体关联实验评估表明，Ensembl 注释的 DHFR2 的两个主要 mRNA 异构体 201 和 202 与核糖体存在不同的关联。这表明它在 RNA 和蛋白质水平上都发挥着功能性作用。然而，尽管 DHFR2 的各种 RNA 异构体相对丰富，但我们无法在大多数细胞类型中检测到可检测水平的 DHFR2 蛋白。我们确实在胚胎心脏中检测到了 DHFR2 特异性肽，这表明该蛋白质可能在胚胎发生过程中发挥特殊作用。我们认为 DHFR2 基因在成体细胞中的主要功能很可能出现在 RNA 水平上。
DNA 修复环境与靶序列的相互作用可预测地导致 Cas9 产生的突变
CRISPR/Cas9 产生的双链断裂的致突变结果取决于切割两侧的序列和细胞 DNA 损伤修复。这些特征之间的相互作用在很大程度上尚未得到探索，这限制了我们理解和操纵结果的能力。在这里，我们测量了 18 个修复基因的缺失如何改变小鼠胚胎干细胞中 2,838 个合成靶序列中 Cas9 双链断裂产生的 83,680 个独特突变结果的频率。这项大规模调查使我们能够以无偏见的方式对结果进行分类，从而产生有关双链断裂修复新模式的假设。我们的数据表明，Prkdc（DNA-PKcs 蛋白）和 Polm（Polμ）在创建与 Cas9 切口近端核苷酸（相对于原间隔区相邻基序 (PAM)）相匹配的 1bp 插入方面发挥着特殊作用，Nbn（NBN）和 Polq（Polθ）在创建不同的删除结果方面发挥着不同的作用，并且存在一类独特的单向删除结果，这些结果既依赖于末端保护基因 Xrcc5（Ku80），也依赖于切除基因 Nbn（NBN）。我们利用修复环境中可重复变异的知识，建立了 Cas9 断裂诱变结果的预测模型，该模型优于当前标准。这项工作提高了我们对 DNA 修复基因功能的理解，并为更精确地调节 CRISPR/Cas9 产生的突变提供了途径。
分层混合有机
摘要在广阔的杂化有机金属卤化物钙钛矿（HOIP）的材料综合和表征中的持续进展已被主要在光电应用中的非凡特性所推动。这些作品强调了晶格振动的特殊作用，该作用与电子强烈相互作用，从而导致影响光学性质的耦合态。在这些材料中，分层（2D）HOIP已成为一个有前途的材料平台，以解决其三维对应物的某些问题，例如环境稳定性和离子迁移。分层HOIP由由金属卤化物八面体制成的无机层组成，这些层由由有机阳离子组成的层分隔。他们不仅对应用吸引了很大的兴趣，而且由于其晶体结构可调性而引起了丰富的现象学。在这里，我们概述了通过拉曼光谱以几种配置和设置来实现的主要实验发现，以及它们如何促进这些迷人材料的复杂结构性质。我们关注声子频谱如何来自几个因素的相互作用。首先，无机和有机部位的运动是耦合的，其典型模式在能量上截然不同。尽管如此，它们之间的相互作用是相关的，因为它导致低对称性晶体结构。然后，外部刺激的作用，例如温度和压力，它们通过改变晶格的对称性，八面体倾斜和分子的排列而诱导相变的相变。最后，强调了电荷载体和光子声子之间耦合的相关作用。
比较量子引力模型：弦理论、圈量子引力和纠缠引力与 SU()-QGR
摘要：在之前的文章中，我们提出了一种新的量子引力 (QGR) 和宇宙学模型，称为 SU ( ∞ ) -QGR。该模型的公理之一是宇宙及其子系统的希尔伯特空间表示 SU ( ∞ ) 对称群。在这个框架中，经典时空被解释为表征代表希尔伯特空间的 SU ( ∞ ) 状态的参数空间。利用量子不确定性关系，可以证明参数空间（即时空）具有 3+1 维洛伦兹几何。本文在回顾了 SU ( ∞ ) -QGR（包括证明其经典极限是爱因斯坦引力）之后，将其与几个 QGR 提案进行了比较，包括：弦理论和 M 理论、圈量子引力和相关模型以及受全息原理和量子纠缠启发的 QGR 提案。目的是找到它们的共同和类似特征，即使它们似乎具有不同的作用和解释。希望这项练习能让人们更好地理解引力作为一种普遍的量子力，并阐明时空的物理性质。我们在所研究的模型中发现了几个共同的特征：二维结构的重要性；张量积的代数分解；SU ( 2 ) 群在其公式中的特殊作用；量子时间作为关系可观测量的必要性。我们讨论了如何在不同的模型中将这些特征视为类似。我们还表明它们在 SU ( ∞ ) -QGR 中出现，无需微调、额外假设或限制。