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使用半自动化方法提高 Omop 词汇表中疫苗概念图的质量
观察性医学结果伙伴关系 (OMOP) 通用数据模型 (CDM) 提供了一个统一的模型来整合不同的真实世界数据 (RWD) 源。OMOP CDM 的一个组成部分是标准化词汇表（以下称为 OMOP 词汇表），它能够组织和标准化 OMOP CDM 各个临床领域的医学概念。对于来自不同源词汇表的具有相同含义的概念，一个被指定为标准概念，而其他则被指定为非标准或源概念并映射到标准概念。然而，由于源词汇表的异构性，OMOP 词汇表中可能存在映射问题，例如错误映射和缺失映射，这可能会影响使用
利用半导体量子点高度纠缠光子的量子密码学
半导体量子点即使在最大亮度下也能发射极化纠缠光子对，且多对发射概率极低。使用保真度高达 0.987(8) 的量子点源，我们在此实现量子密钥分发，在 13 小时的时间跨度内，平均量子比特错误率低至 1.9%。为了验证原理，在两栋由 350 米长的光纤连接的建筑物之间使用 BBM92 协议执行密钥生成，在 80 MHz 的泵送速率下，平均原始（安全）密钥速率为 135 比特/秒（86 比特/秒），无需借助时间或频率过滤技术。我们的工作证明了量子点作为基于纠缠的量子密钥分发和量子网络的光源的可行性。通过提高激发速率并将量子点嵌入最先进的光子结构中，原则上可以实现每秒千兆比特范围内的密钥生成速率。
一种采用半波精密整流器的新架构方案
摘要：本文提出了一种基于第二代电压传送器 (VCII) 的半波整流器电路架构方案。该方案可产生电压信号形式的反相和非反相输出。所提出的电路是文献中介绍的第一种使用 VCII 的半波整流器架构。它由一个 VCII、两个二极管和一个接地电阻组成。输入信号为电流形式，整流输出电压信号在同一 VCII 的低阻抗 Z 端口提供。因此，产生的输出信号可直接使用，无需添加额外的电压缓冲器。此外，电路增益由接地电阻值设置，可以进行调整。所提出的电路采用简单的晶体管级结构，仅使用 21 个晶体管。本文介绍并解释了整流器的架构以及可能的 VCII 拓扑。还给出了初步的模拟结果，突出了其功能。它的简单性和多功能性使其适用于传感器接口和传感器网络的处理电路，其中模拟处理部分的低功耗至关重要。
利用半胱氨酸反应探针进行基于活性的蛋白质组学筛选，发现非半胱氨酸靶向共价抑制剂
摘要：酶的共价抑制剂作为药物种子越来越受到重视，但发现非半胱氨酸靶向抑制剂仍然具有挑战性。在此，我们报告了在基于活性的 1601 个反应性小分子蛋白质组学筛选过程中的一次有趣经历，其中我们监测了库分子与半胱氨酸反应性碘乙酰胺探针竞争的能力。一种环氧分子 F8 表现出对限速糖酵解酶甘油醛-3-磷酸脱氢酶 (GAPDH) 的探针反应性的意外增强。深入的机制分析表明，F8 与活性位点的天冬氨酸形成共价加合物以取代酶的辅因子 NAD + ，同时增强了探针与催化半胱氨酸的反应。机制基础使我们能够识别优化的天冬氨酸反应性 GAPDH 抑制剂。我们的研究结果表明，利用半胱氨酸反应探针进行基于活性的蛋白质组学筛选可用于发现与非半胱氨酸残基反应的共价抑制剂。
使用半合成训练实现快速深度神经对应，用于追踪和识别秀丽隐杆线虫中的神经元
摘要 我们提出了一种基于 Transformer 网络架构的自动化方法来追踪和识别秀丽隐杆线虫中的神经元，称为“快速深度神经对应”或 fDNC。该模型在经验得出的半合成数据上训练一次，然后预测保留的真实动物之间的神经对应关系。相同的预训练模型既可以跨时间追踪神经元，也可以识别不同个体之间的对应神经元。性能是针对手工注释的数据集进行评估的，包括 NeuroPAL（Yemini 等人，2021 年）。仅使用位置信息，该方法在追踪个体内神经元方面的准确率达到 79.1%，在识别个体间神经元方面的准确率达到 64.1%。当将该模型应用于另一个研究组发布的数据集时（Chaudhary 等人，2021 年），识别个体间神经元的准确率甚至更高（78.2%）。当使用 NeuroPAL 中的颜色信息时，我们的数据集上的准确率达到 74.7%。与之前的方法不同，fDNC 不需要将动物拉直或变换到标准坐标系中。该方法速度很快，可在 10 毫秒内预测对应关系，适合未来的实时应用。
量子应用半导体中的颜色中心
半导体中的点缺陷已经并且将继续与应用有关。浅缺陷实现了晶体管的晶体管，这些晶体管在现代的信息时代以及在不太遥远的未来中，深层缺陷可以为量子信息处理的革命奠定基础。深层缺陷（特别是颜色中心）对于其他应用（例如单个光子发射极）也很感兴趣，尤其是在1550 nm处排放的一个光子发射器，这是通过光学器件进行长时间通信的最佳频率。第一原则计算可以预测点缺陷的能量和光学特性。i对磁光能进行了广泛的收敛测试，例如零声子线，高细胞耦合参数和4H-SIC中DivaCration的四个不同配置的零曲线分裂。将收敛结果与实验测量结果进行比较，对不同的配置进行了清晰的识别。使用这种方法，我还确定了4H-SIC中的硅空缺以及6H-SIC中的硅和硅空置方面的所有配置。进一步使用了相同的方法来识别4H-SIC中3C堆叠断层包含在3C堆叠断层中存在的两种额外的配置。i扩展了计算的属性，以包括提供零声子线的极化，强度和寿命的过渡偶极矩。在计算过渡偶极矩时，我表明，由于几何形状弛豫，将电子轨道的自一致变化包括在激发状态下至关重要。i测试了4H-SIC中除疾病的方法，从而进一步加强了先前的识别，并提供了准确的光致发光强度和寿命。在给定应用程序中找到具有正确属性的稳定点缺陷是一项具有挑战性的任务。由于散装半导体材料中存在的大量可能的缺陷，我设计并实施了一系列自动工作流，以系统地研究任何点缺陷。此集合称为ADAQ（自动缺陷分析和资格术），并自动化理论过程的每个步骤，从创建缺陷到预测其属性。使用ADAQ，我在4H-SIC中筛选了约8000个固有点缺陷簇。本文概述了这些单点和双点缺陷的地层能量和最相关的光学特性。这些结果显示出适合各种量子应用的新颜色中心的巨大希望。