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World File Search System病原体
基于 CRISPR-Cas 和适体的病原体诊断系统：综述
病原体感染会导致人类和动物出现严重的临床疾病。人与动物接触的增多和环境的不断变化加剧了人畜共患传染病的传播。最近，世界卫生组织已将一些人畜共患流行病宣布为国际关注的突发公共卫生事件。因此，快速准确地检测致病病原体对于对抗新发和再发传染病尤为重要。传统的病原体检测工具耗时、成本高，并且需要熟练的人员，这极大地阻碍了快速诊断测试的发展，特别是在资源受限的地区。基于成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR-)-Cas 和适体的平台已经取代了传统的病原体检测方法。本文我们回顾了两种用于临床和食源性病原微生物的新型下一代核心病原体检测平台：基于 CRISPR-Cas 的系统，包括 dCas9、Cas12a/b、Cas13 和 Cas14；以及基于适体的生物传感器检测工具。我们重点介绍了基于 CRISPR-Cas 和适体的技术，并比较了它们的优缺点。基于 CRISPR-Cas 的工具需要繁琐的程序，例如核酸扩增和提取，而基于适体的工具则需要提高灵敏度。我们回顾了 CRISPR-Cas 和适体技术的结合，作为克服这些缺陷的一种有前途的方法。最后，我们讨论了基于 Cas14 的工具作为功能更强大的平台，用于检测非核酸靶标。关键词：成簇的规律间隔的短回文重复序列-Cas、适体、病原体检测、诊断工具
多物种感染期间细菌病原体动态
软腐果杆菌（SRP）收集了30多种细菌物种，通过产生和分泌大量的植物细胞壁降级酶（PCWDES），共同腐烂了广泛的植物。全球马铃薯领域调查在有症状的植物和块茎上确定了15种不同的SRP物种。在空间和时间上观察到的每种物种的丰度都会有所不同，而在爆发过程中驱动物种转移的机制尚不清楚。此外，经常观察到多种物种感染，并且这些共同感染的动力学不充分理解。要了解共同感染的含义，我们建立了16个不同的合成群落的6个SRP菌株的合成群落。每个经过测试的社区中存在的细菌代表了2种不同的物种，每个物种有3种菌株。这些群落被接种在马铃薯块茎或合成介质中，其结果随后进行了扩增和散发性管家基因GAP A GAP A的分化和光明测序。我们还比较了混合物种感染和单物种感染期间马铃薯块茎中疾病的发病率和细菌繁殖。一种无法诱导马铃薯散发性的物种有效地维护，并最终在某些测试的社区中占主导地位，表明作弊可以塑造主导物种。建模表明，PCWDES生产和分泌的成本，马铃薯降解的速度以及降级底物的差异率可能有利于作弊者物种。拮抗相互作用是特定的菌株，而不是物种。在马铃薯块茎和合成培养基之间存在差异的结果，突出了环境条件的驱动效应，在马铃薯块茎中产生了较高的拮抗相互作用。在某些社区中也观察到毒性干扰，从而使菌株保持对有毒化合物的敏感。总体而言，结果表明，次级竞争，通过营养相互作用和毒性干扰的合作有助于维持SRP多样性。讨论了这些过程对流行病学监测的含义。
细菌病原体在自身免疫性疾病中的作用
自身免疫性疾病（AD）当免疫系统错误地攻击自我组织时会出现，这通常是由于自我耐受性的崩溃。受遗传和环境因素影响的这些条件越来越多地与细菌感染作为重要触发因素有关。健康的免疫系统可保护人体免受感染。但是，当免疫系统出现故障时，它会攻击健康的细胞，组织和人体器官。这种故障或功能障碍称为自身免疫性疾病，可能影响身体的任何部位，损害心理功能并可能致命。本评论探讨了细菌病原体（例如幽门螺杆菌，弯曲杆菌的空肠杆菌和结核分枝杆菌）如何通过分子模拟物，旁观者活化和表位散布等机制来促进自身免疫性。这些过程会引起交叉反应性免疫反应，放大免疫失调并加剧组织损伤。流行病学和实验研究揭示了细菌感染与诸如Guillain-Barré综合征，类风湿关节炎和结节病之间的疾病之间的密切关联。通过分析这些病原体与免疫机制之间的相互作用，综述突出了细菌在破坏免疫耐受性和驱动自身免疫性疾病进展中的关键作用。此外，针对细菌诱导的自身免疫性的抗生素，免疫调节剂和疫苗等治疗策略为预防和治疗提供了有希望的途径。关键字：自身免疫性疾病；自我耐受；细菌感染；免疫反应了解细菌作用的机制为有效诊断，预防措施和疗法的发展提供了宝贵的见解。这篇综述强调了对自身免疫性细菌发病机理的持续研究，尤其是在遗传易感人群中，以完善有针对性的临床方法并改善这些复杂疾病的结果。
植物病原体的生物控制：全球视角
1个植物病理学单元，植物保护厂，国立农业学院，KM10，Rte Haj Kaddour，BP S/40，Menches 50001，摩洛哥； say.ezrari@usmba.a。）;新闻）; jihane.com-tionsmba.ac.a（J.K。）;2 框2202，图像路线，事实30000，摩洛哥3财务复活和大保护-EA 4707-USC INRAE1488，环球香槟-Ardenne； 4个农业保护植物，穆罕默德VI，BP428 Oujda，Oujda 60000，摩洛哥； ）; ea.barka@un-reims.fr（E.A.B. ）;电话 ： +212-55-30-02-39（R.L. ）; +33-3-2691-3441（E.A.B。）框2202，图像路线，事实30000，摩洛哥3财务复活和大保护-EA 4707-USC INRAE1488，环球香槟-Ardenne； 4个农业保护植物，穆罕默德VI，BP428 Oujda，Oujda 60000，摩洛哥；）; ea.barka@un-reims.fr（E.A.B.）;电话： +212-55-30-02-39（R.L.）; +33-3-2691-3441（E.A.B。）
人工智能在病原体基因组学中的新兴应用
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常见真菌病原体相关危险因素评估
耳真菌病是世界热带和亚热带地区外耳道最常见的真菌病之一。许多环境和宿主因素都可能使人面临耳真菌病的风险。这项横断面研究是在获得机构人类伦理委员会 (IHEC) 批准后在南印度一家三级医院进行的，为期一年，因为近期关于我们所在地区临床真菌学特征及其与各种风险因素的关联的数据有限。90 份来自临床诊断为耳真菌病患者的耳拭子被从耳鼻喉 (ENT) 门诊送到实验室进行真菌学检查。他们的临床数据使用自填问卷进行评估。真菌学检查产生了 63 种真菌分离株，其中黑曲霉为主要生物，其次是其他真菌；常见的危险因素包括糖尿病（92%）、使用类固醇滴剂的 CSOM 患者（91.6%）、游泳（80%）、使用抗生素滴剂的 CSOM 患者（75%），上述危险因素与耳真菌病之间存在显著关联（p<0.05）。本研究强调，即使患者的耳镜检查结果和临床表现强烈表明有真菌感染，也必须正确识别病原体以防止并发症和复发。与其他浅表真菌感染相比，耳真菌病并不构成生命威胁。然而，及时进行微生物学鉴定对于及时有效的治疗至关重要，以避免耳真菌病引起的重大问题。
模型血源性病原体暴露控制计划
血液或其他潜在感染材料的标本放在容器中，该容器可防止在收集，处理，加工，储存，运输或运输中泄漏。除非在整个过程中使用通用预防措施，并且样品和容器保留在设施中，否则容器标记为生物危害标签。血液的标本和其他潜在的传染性物质或液体通常在医院，医生办公室，诊所或实验室环境中收集。这些标本的标记应根据组织的标本收集程序进行。此过程应解决将样品放在容器中，这可以防止在收集，处理，处理，存储，运输，运输或运输过程中泄漏。在将样品容器发送到其他设施或在整个过程中不使用通用预防措施的设施中，应将生物危害标签固定在容器的外部。
细菌病原体的发病机制、毒力因素
微生物学讲座 日期：2023 年 10 月 18 日 细菌病原体的发病机制、毒力因子 如果一种微生物能够引起疾病，它就被称为病原体。幸运的是，自然界中众多微生物中只有少数是致病的。有些生物具有高毒性，即使接种量很少也会导致健康个体患病，而有些生物只会在防御力较弱的受损个体中致病。后者被称为机会性生物，因为它们利用宿主防御力下降的机会引起疾病。这些机会主义者通常是人体正常菌群的成员。 感染的一般方面 毒力 毒力是致病性的定量测量，与生物体的产毒潜力和侵袭性有关。毒力可以通过引起疾病所需的微生物数量来衡量，并被指定为 LD50 或 ID50：LD50（50% 致死量）是杀死一半宿主所需的微生物数量，而 ID50（50% 感染量）是导致一半宿主感染所需的微生物数量。这些值是通过接种实验动物确定的。 传染病 如果感染在宿主之间传播，则被称为“传染病”。许多感染（但不是全部）都是传染性的；例如，结核病是传染性的，因为它通过咳嗽产生的空气飞沫传播，但葡萄球菌食物中毒不是，因为微生物产生的并存在于受污染食物中的外毒素只会影响食用该食物的人。如果一种疾病具有高度传染性，则被称为“传染病”（例如水痘）。根据社区中传染病的发病率和流行程度，传染病可称为地方性传染病、流行病或大流行性传染病： • 地方性传染病在特定人群中持续低水平存在（例如，某些非洲国家的地方性疟疾）。 • 如果传染病发生频率远高于正常水平（例如，冬季的流感流行），则该传染病为流行病。
病原体感知和欺骗激酶融合蛋白
植物是世界各地食物，衣服和庇护所的主要来源。在气候变化和外部投入（例如水，肥料和耕地）下，喂养不断增长的世界人口是人类面临的最紧迫的挑战之一。小麦是一种主要的粮食作物，在人类饮食中提供超过20％的卡路里和蛋白质，以及维生素，饮食纤维和植物化学物质1。病原体和害虫每年导致面包小麦的全球产量损失20％。要实施有效的遗传和生物技术方法来减少由于疾病而导致的损失，科学家需要对植物限制病原体的基本理解。然而，由于它们的大且重复的富含基因组，植物部落triticeae（包括小麦，大麦和黑麦）中抗病基因（R-Genes）的克隆仍然具有挑战性。基于基因组学基因克隆方法的最新发展促进了在Triticeae 3中发现非规范R-Gene家族的发现。在本期《自然遗传学》中，Wang等人的论文。4和Yu等。5描述了两个小麦抗病基因的鉴定，这些基因具有源自小麦野生亲戚的新型结构，均包含激酶与其他结构域的融合，此处指定为激酶融合蛋白（KFPS）（图。1）。
血源性病原体暴露控制计划 (ECP)
防腐剂 - 一种用于皮肤的化学杀菌剂。防腐剂不能用作消毒剂。生物安全 - 安全处理传染性或潜在传染性生物危害材料的良好程序的实践。生物危害 - 能够增强生物危害的材料。血液 - 人类血液、人体成分和由人类血液制成的产品。血源性病原体 - 人类血液中可导致人类疾病的传染性微生物。根据 OSHA 的定义，这些病原体包括但不限于乙型肝炎 (HBV)、丙型肝炎 (HCV) 和人类免疫缺陷病毒 (HIV)。污染 - 物品或表面上存在或合理预期存在血液或潜在传染性物质。污染衣物 - 被血液或其他潜在传染性物质弄脏的衣物。污染锐器 - 任何可刺入皮肤的受污染物体，包括但不限于针头、手术刀、碎玻璃、破损毛细管和牙科线的裸露末端。净化 - 使用物理或化学方法去除、灭活或破坏表面或物品上的血源性病原体，使它们不再能够传播传染性颗粒，并使表面或物品可以安全地进行处理、使用或处置。消毒剂 - 一种旨在不可逆地灭活或破坏无生命表面（大多数消毒剂不能有效消毒）的特定微生物（不包括其孢子）的药剂。消毒 - 一种杀死病原微生物但不一定杀死其孢子的程序。化学消毒剂用于无生命表面（医疗设备、台面等），不应用于皮肤或组织。