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兽医病毒学的高级生物信息学方法
在开创性研究和高吞吐测序的驱动的兽医病毒学进展中，显着扩展了我们对影响动物的病毒的理解，从家族到野生物种。通过高级测序技术的新型病毒数据积累已经揭示了以前未知的病毒，提供了大量的遗传信息。，尽管取得了这些进步，但仍然需要深入和广泛的基于分子的分析来充分理解这些病毒基因组的复杂性。兽医病毒学家面临的主要挑战之一是从大量收集的病毒基因组和测序数据中提取有意义的信息。这包括识别可能与这些病毒致病性有关的遗传元素。寻求理解致病性的遗传基础对于制定有效的策略来诊断，预防和治疗动物病毒感染。为了应对这些挑战，实验研究以及先进的生物信息学方法论起着关键作用。这些研究扩展到了简单的鉴定和病毒的分类；他们深入研究病毒基因组的分子复杂性。生物信息学工具有助于解读遗传密码，识别潜在的毒力因素，并了解这些病毒与宿主生物相互作用的机制。兽医病毒学中实验研究和晚期生物信息学的整合不仅增强了我们检测和表征病毒的能力，而且还为发现病毒发病机理的新方面开放了途径。这种整体方法有助于发展兽医医学中更具针对性和有效的干预措施，最终改善动物的健康和福祉。随着领域的不断发展，实验研究和生物信息学之间的协同作用可能会揭示出对动物病毒多样性，进化和致病机制的新见解。因此，该研究主题发表了四本原始研究文章，涉及来自包括中国和美国在内的两个国家的22位作者。该主题的研究涵盖的四个领域包括：（i）病毒宏基因组学在兽医病毒学中的应用； （ii）兽医病毒学中病毒基因的比较分析； （iii）兽医病毒学的分子流行病学和进化分析以及（iv）在研究新出现或重新出现牲畜中新的或重新出现的最新进步生物信息学。
本期内容
作者是纳扎尔巴耶夫大学医学院 (NUSOM) 分子医学硕士副教授兼主任 Luca Vangelista 博士。在这个人类被致命呼吸道病毒袭击的特殊时期，我们都在经历着疫情、生活方式和经济之间的联系。作为一名分子病毒学家，Luca Vangelista 自发地感到有义务传播尽可能多的信息，尤其是在哈萨克斯坦。他参与 COVID-19 研究的范围包括为 NUSOM 课程（如医学博士 (MD)、公共卫生硕士 (MPH) 和最深入的分子医学硕士 (MMM)）的各种讲座添加与冠状病毒发病机制和医疗干预相关的几个概念，以及为三门 MMM 课程重新准备专注于冠状病毒的讲座。其他承诺包括担任 NU COVID-19 专家委员会和卫生部 COVID-19 咨询委员会成员，通过意大利大使馆媒体向哈萨克斯坦的意大利社区发送视频信息，为 NU 社区制作视频播客并举办 NU 十周年网络研讨会。最近，Luca Vangelista 与米兰（意大利）的合作者 Massimiliano Secchi 共同撰写了一篇观点文章，发表在《分子生物科学前沿》（Q1 期刊）上（文章可在此处访问）。这篇观点文章的主题涉及设计生物医学干预措施所需的科学进步，旨在最有效地应对未来的大流行，即发现广泛中和抗体 (bnAbs) 和开发针对人类流行冠状病毒的通用疫苗。Bnabs 具有中和大多数（有时是所有）已知病毒株的独特能力，因此在这种情况下是极其重要的分子。目前，bnAbs 在对抗 HIV-1、流感和埃博拉病毒感染方面发挥了巨大作用。事实上，bnAbs 在治疗中可以有多种用途：它们可以开发为针对病毒生命周期进入步骤的抗病毒药物，但它们也可以用于被动免疫，这通常是一种挽救生命的干预措施。最后，bnAbs 在疫苗的合理开发中非常有用，这些疫苗旨在引发类似的抗体，以对大多数病毒株（包括尚未在进化场景中出现的未来病毒株）提供普遍保护。这些 bnAbs 在哪里可以找到？极少数人能够产生这些强效抗体并将其循环到恢复期血液中，他们是致命病毒感染的幸存者。
成人高品质血症的管理 - 2023年10月
肾脏疾病响应麻疹病例的目前响应于2023年底以来麻疹病例的增加，英国卫生安全局（UKHSA）发布了有关保护脆弱患者群体的策略的高级指南。UKKA现在将此指南应用于肾脏疾病患者护理期间发生的特定情况。针对具有固体器官移植的人的应用指南和准备接收固体器官移植的人是由我们在此处复制的BTS编写的。针对其他团体的应用指南由UKKA编写。 该指南是由前UKKA COVID委员会*的一个子组创建的。 迫切需要生成和传播该指南，这排除了正式指南方法的使用。 UKKA承认该领域缺乏证据，并且肾脏疾病患者可能产生的结果持续不确定性。 因此，这是务实的指导，在与他们及其家人，照料者或监护人协商时，不覆盖临床医生有责任做出适合个人情况的决定。 诸如“推荐”，“建议”或“建议”之类的词不赋予有关支持证据实力的特殊含义。 随着证据的发展，本指南的进一步版本可能可以使用。 麻疹病毒具有很大的传染性。 麻疹的R-number（繁殖数）为15-20，这意味着在未接种人群中，每种情况中的15-20个次级（新）病例。 相比之下，非免疫种群中的SARS-COV-2的R-NUMBER约为3。 UKKA推荐针对其他团体的应用指南由UKKA编写。该指南是由前UKKA COVID委员会*的一个子组创建的。迫切需要生成和传播该指南，这排除了正式指南方法的使用。UKKA承认该领域缺乏证据，并且肾脏疾病患者可能产生的结果持续不确定性。因此，这是务实的指导，在与他们及其家人，照料者或监护人协商时，不覆盖临床医生有责任做出适合个人情况的决定。诸如“推荐”，“建议”或“建议”之类的词不赋予有关支持证据实力的特殊含义。随着证据的发展，本指南的进一步版本可能可以使用。麻疹病毒具有很大的传染性。麻疹的R-number（繁殖数）为15-20，这意味着在未接种人群中，每种情况中的15-20个次级（新）病例。相比之下，非免疫种群中的SARS-COV-2的R-NUMBER约为3。UKKA推荐因此，如果您的患者群体发生麻疹病例，尤其是在与肾脏服务接触时，我们鼓励肾脏临床医生与当地病毒学家完全互动（例如，在面对面的门诊诊所，透析中心或住院设置）。
在生命科学中共享敏感数据：集中和联合方法的概述
玛丽亚·鲁贾诺（Maria A. Rujano），格罗宁根大学医学科学博士学位，在埃克林（Ecrin）担任项目经理，为欧盟医疗保健数据研究倡议做出了贡献。凭借细胞和神经发育生物学的专业知识，她曾在著名的研究中心工作，包括Curie Institute和Institute Pasteur。化学博士学位Jan-Willem Boiten是Lygaturation的高级计划经理。 拥有超过20年的跨生命科学合作经验，他正在协调荷兰和欧洲一级的大规模生物医学数据基础设施计划。 克里斯蒂安·奥曼（Christian Ohmann）拥有数学博士学位，医学临时检查和“理论手术”领域的关联。 他是德国海因里希海因大学杜塞尔多夫医学院临床试验中心（KKS）的负责人（1999- 2014年），目前与ECRIN有关临床试验数据共享和ECRIN网络委员会的咨询。 ECRIN的高级数据经理Steve Canham具有18年的临床试验数据系统和管理方面的专业知识。 以前，他领导伦敦癌症研究所的IT团队（2002-11）。 Sergio Contrino是ECRIN数据项目的负责人。 是培训的电子工程师，曾在剑桥大学，遗传学系和欧洲生物信息学研究所（EBI）担任高级软件开发人员。 Romain David，海洋学和数据挖掘博士学位，是Erinha的研究人员和数据管家。 他是研究数据联盟（RDA）的共同主席（例如，化学博士学位Jan-Willem Boiten是Lygaturation的高级计划经理。拥有超过20年的跨生命科学合作经验，他正在协调荷兰和欧洲一级的大规模生物医学数据基础设施计划。克里斯蒂安·奥曼（Christian Ohmann）拥有数学博士学位，医学临时检查和“理论手术”领域的关联。他是德国海因里希海因大学杜塞尔多夫医学院临床试验中心（KKS）的负责人（1999- 2014年），目前与ECRIN有关临床试验数据共享和ECRIN网络委员会的咨询。ECRIN的高级数据经理Steve Canham具有18年的临床试验数据系统和管理方面的专业知识。以前，他领导伦敦癌症研究所的IT团队（2002-11）。Sergio Contrino是ECRIN数据项目的负责人。是培训的电子工程师，曾在剑桥大学，遗传学系和欧洲生物信息学研究所（EBI）担任高级软件开发人员。Romain David，海洋学和数据挖掘博士学位，是Erinha的研究人员和数据管家。他是研究数据联盟（RDA）的共同主席（例如，拥有20年的环境信息系统专业知识，他专门研究数据挖掘，图形方法和合适的数据管理。敏感数据）。Jonathan Ewbank于2021年加入Erinha担任总干事，在担任Marseille-Luminy免疫学中心（法国）25年后。Claudia Filippone是一名病毒学家，在Erinha担任高级科学计划经理。她的研究经验着重于欧洲和非洲的病毒出现和人畜共患病。Erinha的欧洲项目经理Claire Connellan专注于传染病爆发研究（Isidore）项目的综合服务，旨在增强大流行的准备。拥有项目管理和政策制定方面的专业知识，她拥有伦敦国王学院的国际和平与安全硕士学位。Ilse Custers是一名药物化学家（VU阿姆斯特丹）和卫生经济学家（庞贝·法布拉大学）。她目前正在担任Lygature的项目经理，管理项目建立基础架构的健康和基因组数据共享。Rick Van Nuland博士是专注于卫生研究基础设施的Lygature计划经理，并在UTRECHT大学医学中心和斯坦福大学接受了分子癌生物学家的培训。 Michaela Th。 Mayrhofer是培训的社会科学家。 她的博士学位研究了生物库治理的模式。 她的研究重点在于GDPR的合规性，人工智能道德规范以及建立和促进生物医学研究中的ELSI最佳实践。 自2019年以来，她一直领导BBMRI-ERIC的ELSI服务与研究部门。Rick Van Nuland博士是专注于卫生研究基础设施的Lygature计划经理，并在UTRECHT大学医学中心和斯坦福大学接受了分子癌生物学家的培训。Michaela Th。 Mayrhofer是培训的社会科学家。 她的博士学位研究了生物库治理的模式。 她的研究重点在于GDPR的合规性，人工智能道德规范以及建立和促进生物医学研究中的ELSI最佳实践。 自2019年以来，她一直领导BBMRI-ERIC的ELSI服务与研究部门。Michaela Th。Mayrhofer是培训的社会科学家。她的博士学位研究了生物库治理的模式。她的研究重点在于GDPR的合规性，人工智能道德规范以及建立和促进生物医学研究中的ELSI最佳实践。自2019年以来，她一直领导BBMRI-ERIC的ELSI服务与研究部门。Petr Holub是Masaryk大学计算机科学副教授。自2015年以来，他已成为BBMri-Eric的首席IT官。他具有科学的背景（2001年计算量子化学专业的MSC）和计算机科学（2005年的博士学位，专门研究计算机网络，自组织和多媒体处理）。evaGarcíaálvarez在BBMRI-ERIC担任IT科学家和项目经理。她从圣地亚哥大学（De Santiago de Costela）获得了分子医学博士学位，在那里她研究了癌症中体细胞病毒整合的基因组景观。Emmanuel Bacry毕业于écoleNormaleSupérieure（ENS），并拥有数学博士学位。他目前是巴黎 - 杜普大学的CNRS研究主任，也是法国健康数据中心的科学总监。他领导了Ecole Polytechnique的大数据与数据科学计划超过4年（2016-19）。收到：2024年2月6日。修订：2024年4月19日©作者2024。牛津大学出版社出版。这是根据Creative Commons Attribution许可条款（https://creativecommons.org/licenses/4.0/）分发的一篇开放访问文章，该文章允许在任何媒介中不受限制地重复使用，分发和再现，前提是适当地引用了原始工作。
分子生物学在进化分类中的作用
人工智能彻底改变了生命科学研究 人工智能技术已广泛应用于包括生命科学在内的各个领域。人工智能生成的摘要进化分类最近取得突破，主要通过 DNA 技术的进步，将表型学和分支学结合起来，以更准确地对生物进行分类。DNA 分析与传统形态特征的结合提供了识别生物（尤其是微生物）的客观方法。这种方法有可能增强疾病识别并增加对生物多样性的了解。据分子生物学专家介绍，将基因组特征与传统特征一起使用可以实现更精确的分类系统。可以分析各种物种的基因组成，以确定它们的进化历史和谱系。最近的研究表明，现代分子技术大大提高了确定遗传变异水平的精度。这对于理解生物之间的关系和识别新物种具有重要意义。DNA 技术的使用还使科学家能够开发出更准确的分类方案。通过研究 DNA 的结构，研究人员可以轻松识别生物之间的进化关系并确定它们分别进化了多长时间。例如，科学家比较不同生物的 DNA 序列以发现新物种。这是通过测量变化（突变）的数量和它们之间的相似性来实现的。然后使用结果将新发现的生物体归类为相似的组或类。人工智能生成的抽象进化分类对进化生物学未来的影响是巨大的。通过将DNA技术与传统分类系统相结合，研究人员可以更全面地了解生物体关系并改善疾病识别。生物体的进化分类带来了重大挑战，特别是在处理密切相关的分类群时。DNA重组的使用有时会导致不准确的分类。此外，随着新的基因组相关生物体被添加到数据集中，现有的代码需要重新评估以适应它们的系统发育关系。这个过程需要大量的计算能力。未来，分子生物学将在破译不同物种的进化中发挥关键作用。基于遗传变异的物种分类极大地受益于DNA和分子生物学技术。这些进步大大提高了我们对生物间进化关系的理解。现代基于DNA的分子技术的使用彻底改变了进化分类领域。通过分析基因组成，科学家可以识别相似物种的共同祖先并重建它们的进化历史。PhyloCode 为描述和分类系统发育树提供了一个标准化的框架。此外，分子生物学使人们能够研究包括蜉蝣在内的各种生物的分类学、生态学和进化。这项研究强调了 DNA 技术在理解进化关系和促进分类方面的重要性。DNA 的四种核苷酸碱基（包括胞嘧啶、胸腺嘧啶、腺嘌呤和鸟嘌呤）对其功能至关重要。科学家从这些碱基收集数据，通过将实验室序列与既定标准进行比较来创建可靠的分类系统（El-Gebali，2014 年）。通过使用 DNA 技术，研究人员可以优化标准 DNA 序列以获得实验室的预期结果，从而简化比较并确保结果准确。DNA 和分子生物学在对生物体进行分类和识别方面发挥着重要作用。根据 Makarova 等人 (2018) 的说法，了解分类的历史背景对于理解其对 DNA 和分子生物学的未来影响至关重要。通过利用通过 DNA 技术开发的各种 DNA 代码，科学家改进了标本分类，并用它来评估物种之间的进化差异和相似性。DNA 分子中独特的核苷酸序列允许在生物体的基因组中添加或删除不同的基因，从而修改它们的分类。此外，同时进行的基因改组展示了 DNA 操纵如何改善当前的分子生物学应用（Mi, H., Ebert, 2021）。病毒学家将利用 DNA 改组进行未来的疫苗开发和基因治疗。科学家使用 DNA 代码来确定生物体的相关性，从而帮助对它们进行进化分类。DNA 和分子生物学影响了物种的进化分类，促进了准确的分类系统，并加速了疫苗生产和基因工程。DNA 核苷酸代码中包含的信息揭示了生物体之间的进化关系，从而实现了对它们的分类。如果您的作业没有达到预期，或者责任阻碍了您按时提交作业，我们会为您提供帮助！也许您只是太累了，无法完成最后一刻的任务，或者您最近的成绩不稳定。无论出于何种原因，请相信这是合理的，我们可以通过学生作业服务为您提供帮助。我们的专业作家将确保您按时提交所有作业，同时获得优异的成绩。我们以实惠的价格提供一流的学术帮助，这要归功于我们拥有各自领域不同学位的专业作家团队。当您分配任务时，我们会将作家与您的专业领域相关的专业知识进行匹配。我们涵盖从护理和心理学到文学和计算机科学等一系列学科。我们的优势包括：- 独一无二的无抄袭论文 - 及时交付 - 卓越品质 - 24/7 全天候提供熟练的作家 - 提供折扣的合理价格 - 严格遵守说明 我们的流程很简单： 1. 下订单，确保您填写作家所需的所有必要详细信息。 2. 安全付款，我们将指派符合您主题要求的作家。 3. 通过直接与您指定的作家沟通并上传任何额外材料或讲师的说明来跟踪进度。 4. 完成后，下载您的论文以及抄袭报告。 在我们这里，您可以始终获得优异的成绩，我们致力于 100% 的隐私、合法运营和一流的客户满意度。 您是否在为作业而苦苦挣扎或担心无法达到分数？也许您正在忙于应付各种责任，以至于很难按时提交，或者也许您只是筋疲力尽。无论出于什么原因，我们都知道这是合理的！我们的学术写作服务可帮助您以实惠的价格获得专业帮助。我们拥有一支经验丰富的作家团队，可以轻松处理您的所有作业。为什么选择我们的服务？首先，我们提供： - 无抄袭的论文 - 及时交付 - 任何截止日期 - 熟练且经验丰富的作家 - 与主题相关的专业知识 - 关注细节并遵守指示 - 能够处理大量作业 - 合理的价格 - 24/7 客户支持我们迎合不同学科的学生，包括： - 文学：当我们可以为您撰写文学论文或书评时，无需阅读整本书。 - 金融：财务困难？我们的专家也可以提供帮助！ - 计算机科学：我们的计算机科学专家将轻松解决您所有的 python、java、ruby、JavaScript、php 和 C + 作业。 - 心理学：在我们的专业心理学作家的帮助下获得完美的成绩和一致的结果。 - 工程：不要让工程压力影响到您；我们会及时交付并遵守指示。 - 护理：我们的护理作业作者将以低廉的价格负责文献综述、带注释的参考书目、批判性论文等。 - 社会学：借助我们的社会学论文帮助，告别疲劳、压力和压力。 - 商业：拥有业内最好的商业作家之一，可以处理任何主题、长度、截止日期或难度的论文！ - 统计：我们拥有经验丰富的统计专家，他们可以使用各种软件轻松完成任何任务。 - 法律：不要让写法律论文成为难以逾越的障碍；我们在这里帮助你！我们为你提供保障！需要立法框架方面的专家指导吗？我们一流的法律专家团队将为您提供卓越的支持，并确保您取得优异的成绩。我们迎合各种主题，包括上面列出的主题。然而，我们的专业知识不仅限于这些重点领域，因为我们的作者来自不同的学术背景。凭借如此广泛的专业知识，我们可以自信地处理您交给我们的任何任务。我们的作者有资格处理您的任务吗？我们的团队由拥有不同学科的学士、硕士、博士和博士学位的毕业生组成。每位作者至少有两年的学术写作经验。我们制定了严格的招聘流程，以确保我们只雇用最有能力的作者。此外，我们的作者都是以英语为母语的人，保证语言流利无可挑剔。如果您对论文不满意怎么办？可能性很小，但如果需要，我们的质量保证团队会在提交前审查论文。如果您不满意，我们会修改它，直到您满意为止。您可以要求无限次修改，所有更改均免费进行。作为最后的手段，如果上述步骤不符合您的期望，我们将全额退款。您的教授会怀疑您没有写论文吗？绝对不会！每篇论文都是从头开始撰写的，确保您的导师或辅导员永远不会怀疑。我们建议使用我们的服务以获得一致的结果。我们如何确保您作品的原创性？我们使用 SafeAssign、LopesWrite 和 Turnitin 等功能强大的软件彻底检查所有论文是否存在抄袭。您甚至会收到一份抄袭报告以供审查。我们了解学术诚信的重要性，绝不会通过提交抄袭作品来损害学术诚信。我们根据您下订单时指定的截止日期从头开始制作论文。我们所有的论文都在预定时间之前提交。在我们这样一个快节奏的行业中，我们实施了安全措施，以确保及时交付作业，不会因延迟提交而扣分。我们的系统使我们能够在截止日期前获得相当大的利润，为客户提供充足的时间来审查他们的工作。我们通过制定严格的隐私政策来保持机密性。您的个人信息将保持安全，并受到保护，以防止未经授权的访问。我们会不断修改，直到您满意为止。您可以要求无限次修改，所有修改均免费。作为最后的手段，如果上述步骤不符合您的期望，我们将全额退款。您的教授会怀疑您没有写这篇论文吗？绝对不会！每篇论文都是从头开始撰写的，确保您的导师或导师永远不会怀疑。我们建议使用我们的服务以获得一致的结果。我们如何确保您作品的原创性？我们使用 SafeAssign、LopesWrite 和 Turnitin 等功能强大的软件彻底检查所有论文是否存在抄袭。您甚至会收到一份抄袭报告以供审查。我们了解学术诚信的重要性，绝不会通过提交抄袭作品来损害学术诚信。我们根据您下订单时指定的截止日期从头开始制作论文。我们所有的论文都在预定时间之前提交。在我们这样一个快节奏的行业中，我们已经实施了安全措施，以确保及时交付作业，不会因延迟提交而扣分。我们的系统使我们能够在截止日期前完成大量工作，为客户提供充足的时间来审查他们的工作。我们制定了严格的隐私政策，以保证机密性。您的个人信息将保持安全，并受到保护，以防止未经授权的访问。我们会不断修改，直到您满意为止。您可以要求无限次修改，所有修改均免费。作为最后的手段，如果上述步骤不符合您的期望，我们将全额退款。您的教授会怀疑您没有写这篇论文吗？绝对不会！每篇论文都是从头开始撰写的，确保您的导师或导师永远不会怀疑。我们建议使用我们的服务以获得一致的结果。我们如何确保您作品的原创性？我们使用 SafeAssign、LopesWrite 和 Turnitin 等功能强大的软件彻底检查所有论文是否存在抄袭。您甚至会收到一份抄袭报告以供审查。我们了解学术诚信的重要性，绝不会通过提交抄袭作品来损害学术诚信。我们根据您下订单时指定的截止日期从头开始制作论文。我们所有的论文都在预定时间之前提交。在我们这样一个快节奏的行业中，我们已经实施了安全措施，以确保及时交付作业，不会因延迟提交而扣分。我们的系统使我们能够在截止日期前完成大量工作，为客户提供充足的时间来审查他们的工作。我们制定了严格的隐私政策，以保证机密性。您的个人信息将保持安全，并受到保护，以防止未经授权的访问。