1 亚琛工业大学亥姆霍兹研究所应用医学工程研究所生物混合与医用纺织品系 (BioTex),D-52074 亚琛,德国; el-maachi@ame.rwth-aachen.de (IEM); kyriakou@ame.rwth-aachen.de (SK) 2 电子显微镜设备,Uniklinik RWTH Aachen,D-52074 Aachen,德国; sruetten@ukaachen.de 3 Fibrothelium GmbH,D-52068 亚琛,德国; alexander.kopp@fibrothelium.com(AK); marius.koepf@fibrothelium.com (MK) 4 AMIBM-亚琛-马斯特里赫特生物材料研究所,科学与工程学院,Brightlands Chemelot Campus, Maastricht University, 6167 RD Geleen, The Dutch * 通讯作者:jockenhoevel@ame.rwth-aachen.de (SJ); fernandez@ame.rwth-aachen.de (AF-C.);电话:+49-241-80-47478(新加坡); +49-241-80-47470 (AF-C.)
图 2 富集具有低细胞表面岩藻糖基化的细胞。(A)Fut8 和对照池以及富集池和克隆的 AAL-FITC 染色。仅对生成的三个对照池和 Fut8 池中的一个进行染色并用于进一步富集。每个组中选择用于进一步评估的克隆都标有星号(参见图 S3 中仅选定的克隆)。(B)对来自 a) 的 FITC 信号的 MFI 进行量化。点表示每个染色池或克隆的测量值。(C)对对照和 Fut8 池以及在 6 天批次中培养的选定富集池和克隆中的 Fut8 基因表达进行 qPCR 量化。所有三个未富集的对照和 Fut8 池都进行了培养。点表示池(条 1、2、4、5)或单个克隆(3 和 6)的生物学重复。误差线表示池或单个克隆的生物学重复的 SEM。使用非配对 t 检验来计算对照和 Fut8 富集克隆之间的统计学意义
动机:通过将有向无环图 (DAG) 模型应用于蛋白质组数据推断出的有向基因/蛋白质调控网络已被证明可有效检测临床结果的因果生物标志物。然而,在 DAG 学习中仍然存在尚未解决的挑战,即联合建模临床结果变量(通常采用二进制值)和生物标志物测量值(通常是连续变量)。因此,在本文中,我们提出了一种新工具 DAGBagM,用于学习具有连续和二进制节点的 DAG。通过为连续和二进制变量使用适当的模型,DAGBagM 允许任一类型的节点在学习图中成为父节点或子节点。DAGBagM 还采用了引导聚合策略来减少误报并实现更好的估计精度。此外,聚合过程提供了一个灵活的框架,可以稳健地整合边缘上的先验信息以进行 DAG 重建。结果:模拟研究表明,与常用的将二进制变量视为连续变量或离散化连续变量的策略相比,DAGBagM 在识别连续节点和二进制节点之间的边方面表现更好。此外,DAGBagM 的表现优于几种流行的 DAG
摘要 目的:本研究旨在研究托法替尼抑制 Janus 激酶/信号转导和转录激活因子 (JAK/STAT) 通路对成纤维细胞培养中胶原生物合成的影响。材料和方法:BJ-CRL-1474®(皮肤)和 BRL3A®(肝脏)成纤维细胞培养物在合适的培养基中增殖。将托法替尼以 25、50、100、200、400 和 800 nM 的浓度施用于 96 孔烧瓶中增殖的成纤维细胞。使用酶联免疫吸附测定法测量金属蛋白酶组织抑制剂 1 (TIMP-1)、基质金属蛋白酶 3 (MMP-3)、转化生长因子 β 1 (TGF-β1) 和羟脯氨酸水平。结果:托法替尼对皮肤和肝细胞培养物有细胞毒性作用。托法替尼的细胞毒性作用始于 100 nM(p<0.05)。在 800 nM 时效果最强。托法替尼的时间依赖性细胞毒性作用在所有浓度下 72 小时后均显著高于 24 和 48 小时(p<0.05)。即使在 25 nM 的托法替尼浓度下,TGF-β1 水平也显著降低(p<0.05)。托法替尼给药后,MMP-3、TIMP-1 和羟脯氨酸水平显著下降(p<0.05)。结论:托法替尼以浓度依赖性方式抑制成纤维细胞培养物中的成纤维细胞增殖。然而,需要进一步进行广泛的动物和人体研究以确定这种影响的临床意义。
