组织稳态取决于更新和分化之间命运选择的精确平衡,这在肿瘤开始期间失调。近年来已经取得了很多进展,以表征单细胞水平的细胞命运选择的动力学,但它们的潜在机械基础通常仍不清楚。特别是,尽管物理力越来越被视为细胞行为的调节剂,但对全球组织力学如何与局部细胞命运选择相互作用的统一描述。专注于皮肤表皮作为具有复杂命运选择的多层组织的范式,我们开发了一个基于3D顶点的模型,其基础层中受到限制的增殖,表明空间的力学和竞争自然会引起体内平衡和中性漂移动态,实验可以看到。然后,我们探索引入机械不均匀性的效果,从而使亚群具有不同的张力。我们发现,相对较小的机械差异可以足以使细胞倾斜到对称的更新和指数生长。重要的是,模拟预测,这种机械不均匀性是通过单细胞形状的不同形态变化反映的。这使我们得出了两个非常不同的实验可测量参数,细胞形状和长期克隆动力学之间的主关系,我们使用基本细胞癌(BCC)模型验证了这些基础细胞癌(BCC),这些模型由小鼠尾部表皮中的克隆平滑过表达组成。总的来说,我们提出了一个理论框架,以将机械力,定量的细胞形态和复杂组织中的细胞命运结局联系起来。
三菱电气公司prd.gnews@nk.mitsubishielectric.co.co.jpeng。)kiwa@okayama-u.ac.jp https://www.okayama-u.ac.jp/user/eng_aemt/index/index.html评估和宣传科,Osaka Universition of Engineering,Osaka University kou-soumu-soumu-soumu-hyoukakouhou@osaka.osaka.osaka-akaaka-akaaka-saka.jp worder&diveriie.jp wordies rigrige&diveriie.jp risies rimiese.jp risies rimie>
Izza Usman Bajwa 1 , Samuel Sigaud 1* 1 Accumol Inc.,加拿大艾伯塔省卡尔加里 * samuel.sigaud@accumol.com 摘要 磁性粒子通常用于从血液样本中分离特定类型的细胞。从这些细胞中提取的基因组 DNA 中的残留粒子会干扰紫外吸收分光光度法的浓度测量。在本研究中,我们在谱系特异性嵌合体分析工作流程中确定了紫外分光光度法 DNA 定量的不准确程度。我们发现残留磁性粒子和 RNA 的存在会导致对 DNA 浓度的估计过高。简介使用磁性粒子从血液样本中分离特定类型细胞是诊断或免疫遗传学实验室的常用技术。例如,谱系特异性嵌合体分析的典型工作流程包括从血液样本中分离 T 淋巴细胞、髓细胞或其他细胞类型,然后提取基因组 DNA,然后进行 PCR 或 qPCR 1 。提取后通常会检查 DNA 浓度和质量,以确保下游 PCR 反应在最佳条件下进行。根据 DNA 提取方法,在最终 DNA 样本中可能会发现用于细胞分离步骤的残留磁性粒子。虽然这些粒子通常不会干扰后续的 PCR 反应,但它们可能会影响 DNA 定量步骤。紫外吸光度分光光度法是评估 DNA 浓度和纯度最广泛的方法。它速度快,不需要使用标准曲线或特殊试剂。它使用非常少量的 DNA,尤其是使用无比色皿分光光度计(如 NanoDrop 仪器(ThermoFisher Scientific))进行时。然而,紫外吸光度对 DNA 2 不具有选择性。浓度测量可能会受到污染物的影响,例如 RNA、蛋白质、DNA 提取过程中使用的化学品或用于细胞分离的磁性粒子。为了克服这些问题,已经开发出荧光 DNA 结合染料 3。这些化合物与双链 DNA 结合时会显著增强荧光。它们具有高度的特异性和灵敏度,现在被认为是 DNA 定量的黄金标准。然而,与紫外分光光度法相比,荧光测量更耗时,需要使用昂贵的试剂,并需要实现 DNA 标准曲线。由于这些原因,当许多样本需要快速处理时,例如在分子诊断实验室中,紫外分光光度法仍然是确定 DNA 浓度的首选方法。本研究的目的是确定在谱系特异性嵌合体分析工作流程中紫外分光光度法 DNA 定量的不准确程度。我们研究了残留磁粒子对 DNA 浓度和质量测量的影响,并提出了提高测量准确性的建议。