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模拟群落的 DNA 条形码突显了评估新热带鱼类多样性时的潜在偏差
图 1 研究框架 (a) 和所分析模拟群落的描述，包括不同物种组成和 DNA 输入、评估的标记和用于生物多样性评估的代理 (b)。所有模拟群落均使用来自圣弗朗西斯科河流域 (SFRB) 和热基蒂尼奥尼亚河流域 (JQRB) 的物种构建。 (1) 标准化圣弗朗西斯科河模拟群落 (SFmc) 包含来自 SFRB 的 23 个物种，具有相同的 DNA 浓度 (10 ng/ μ L) 和 (2) 使用不同 DNA 浓度偏斜的 SFmc。 (3) 圣弗朗西斯科和热基蒂尼奥尼亚河组合模拟群落 (SFJQmc) 使用来自标准化热基蒂尼奥尼亚河模拟群落 (JQmc) JQmc 和 SFmc 的 38 个独特物种构建。 (4) 标准化热基蒂尼奥尼亚河模拟群落 (JQmc) 由来自 JQRB 的 23 个物种组成，使用相同浓度的 DNA 构建。 （5）JQmc skewed：由来自 JQRB 的 23 个物种组成的模拟群落，采用 DNA 浓度倾斜构建。
Madden, Stephen; Cremona, Mattia; Farrelly, Angela; Low, Weng Hei; McBryan, Jean (2023): 乳腺癌细胞的蛋白质组学时间进程突显增强
为了防止内分泌耐药性乳腺癌的发展，越来越多的人尝试将额外的靶向疗法与内分泌疗法相结合。促进癌细胞在内分泌治疗期间存活的分子机制仍然未知，但可以帮助直接选择额外的靶向疗法。我们提出了一个新的蛋白质组学时间进程数据集，分析了 1 年他莫昔芬治疗期间 MCF7 细胞群中的潜在药物靶点。反相蛋白阵列分析了 30 个时间点的 70 多种蛋白质。对他莫昔芬的双相反应很明显，这与生长率的变化相吻合。他莫昔芬在前 160 天强烈阻碍细胞生长，随后逐渐恢复生长并最终产生耐药性。生长受阻期以 Stat3 (y705) 和 Src (y527) 的磷酸化为特征。接受新辅助内分泌治疗 (<4 个月) 的患者的肿瘤组织也显示出 Stat3 和 Src 信号传导增加。 Stat3（napabucasin）和 Src（达沙替尼）抑制剂可有效杀死经他莫昔芬治疗的 MCF7 和 T47D 细胞。一旦他莫昔芬诱导生长受阻阶段，对这两种药物的敏感性就会显著增强。这种新颖的蛋白质组学资源确定了在他莫昔芬治疗期间使细胞存活的关键机制。它为可能阻止内分泌耐药性发展的潜在药物组合和时机提供了宝贵的见解。