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World File Search System糖苷
自动驾驶的自动驾驶机器，以设计新型酶
一个人可以设计并自动化一个计算和实验平台，以便每个平台迭代指导并驱动另一个平台以实现预定的目标？Rapp及其同事（2024）在论文中仅描述了这种可能性，该论文详细介绍了一个自动驱动实验室的原型，该实验室可以自动导航，以产生具有所需属性的工程酶。这个实验室，而不是自动化协议，用缩写词来提及。这是指用于蛋白质景观探索的自动驾驶自动驾驶机器。本文描述了一个原型，涉及糖苷水解酶的工程，以增强热稳定性。“大脑”是该自动化系统背后的计算组件，旨在从策划的数据集学习蛋白质序列 - 功能关系。然后，通过一个全自动的机器人系统评估了这些设计蛋白，该蛋白可以合成并实验表征设计的蛋白质，并向代理（即计算成分）提供反馈，以填补其对系统的理解。因此，设计样品剂是通过在搜索过程中积极获取信息来不断地重新理解对蛋白质景观的理解。由于该智能代理从一个精心策划的，多样化的数据集中学习蛋白质序列 - 功能关系，因此根据更新的假设，这种反馈对于重新景观探索和新蛋白质的设计至关重要。在此原型中，将四个样品剂的任务承担了此目标。单个药物的搜索行为差异主要是由实验测量噪声引起的。这些药物的目标是导航糖苷水解酶景观，并以增强的热耐受性鉴定酶。然而，尽管他们的搜索行为有所不同，但所有四个代理都可以在热稳定糖苷水解酶上融合 - 这是显着的壮举，因为它显然不需要任何人类干预。为了启动迭代设计过程，Rapp及其同事用糖苷水解酶序列喂养样品，具有工程热耐受性的靶标。使用在可抑制和热固醇糖苷水解酶进行的实验中的非常最小的信息，以蛋白质耐受景观呈现样品（Romero and Arnold 2009）。蛋白质富度景观描述了从序列到类似于峰，山谷和山脊的陆地景观的映射，该目标是达到拟合度更高的自适应峰。至关重要的输入来自一个反馈周期，其中代理查询环境以收集信息，从而改善了内部对景观的看法。从这个意义上讲，蛋白质工程代理的任务是贝叶斯优化的任务，其中未知的目标函数与探索和开发之间的有效平衡（作者称为权衡）相息。样品以部署高斯工艺（GP）模型，以探索景观并提取可以描述序列水平上的可热稳定蛋白与中序蛋白有何不同的信息（Romero等2013）。使用贝叶斯优化（BO）技术，此信息启用了迭代设计蛋白质序列的样品。作者还设计了几种BO方法，以说明缺乏丰富的实验数据。这方面通常至关重要，因为人工工程/机器学习（AI/ML）工具需要一个大型，多样化的数据集有效。首先使用基于GP模型的分类器来识别功能序列，然后采用了上层信心结合算法来选择实验验证的顶级序列（Dauparas等人。2022）。使用预先合成的基因片段组装了新型工程酶，即设计的序列。该策略本身在合成生物学的高通量平台中很普遍。
综合转录组和代谢组分析揭示了orychophragmus vileaceus
结果和讨论：基于代谢组数据，总共鉴定了152个氟代谢物，其中大多数是槲皮素和kaempferol。对三个氟样品中代谢产物的比较分析表明，两种花色苷，peonidin-3-葡萄糖苷和delphinidin 3-（6'' - malonyl-葡萄糖苷）是颜料最有可能造成O. Violeaceus的花瓣的颜色。随后的转录组分析显示，在三组流量中，有5,918个差异表达的基因，其中87个编码了花青素生物合成途径中的13个关键酶。在紫色流中，两个转录因子OVMYB和OVBHHH的高表达表明它们在花青素生物合成的调节中的作用。通过整合代谢组和转录组数据，编码花青素合酶的卵子在紫色流中显着上调。卵形是负责将无色白细胞蛋白酶转化为彩色花青素的酶。这项研究提供了对O. violaceus颜色发育的分子机制的新见解，为浅色颜色育种奠定了基础。
番茄中组成性甾体糖苷生物碱的生物合成受 IIIe 分支碱性螺旋-环-螺旋转录因子 MYC1 和 MYC2 调控
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2020 年 1 月 28 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.01.27.921833 doi：bioRxiv preprint
植物化学和生理化学筛选...
Osmania University，海得拉巴，Telangana50007。 摘要：Gymnanthemum Amygdalinum（velile）sch.bip。 ex walp。 （Asteraceae），以其以前的名字Vernonia Amygdalina差异而闻名，是一种具有广泛药用特性的小灌木。 这项工作的目的是筛选植物学和生理化学构图的体育膜杏仁核叶子的提取物，主要是为了确定其早些时候声称的传统和现代医学的用法。 对乙醇和石油醚提取物的初步植物化学分析表明，单宁，类黄酮，生物碱，萜类化合物和碳水化合物存在。 在叶子的PET醚和乙醇提取物中都检测到植物化合物，特别是生物碱，类黄酮，单宁，皂苷，糖苷和碳水化合物。 在树的树皮和叶子中发现的植物化合物的定量确定表明，提取物的生物碱，类黄酮和糖苷的值明显高于树皮。 皂苷和蒽醌在树皮中比在叶片中要多得多。 叶片中的总灰分，水溶性，酸不溶和硫化灰的测量分别为12.14％，5.53％，2.04％和14.02％。 获得的结果非常明显，可以在治疗氧化应激和其他相关疾病的治疗中进一步探索该植物。 索引术语 - 体操运动物杏仁核，植物化学组成，生理化学组成，定量分析，生物碱，萜类化合物和类黄酮。 I. 简介Osmania University，海得拉巴，Telangana50007。摘要：Gymnanthemum Amygdalinum（velile）sch.bip。ex walp。（Asteraceae），以其以前的名字Vernonia Amygdalina差异而闻名，是一种具有广泛药用特性的小灌木。这项工作的目的是筛选植物学和生理化学构图的体育膜杏仁核叶子的提取物，主要是为了确定其早些时候声称的传统和现代医学的用法。对乙醇和石油醚提取物的初步植物化学分析表明，单宁，类黄酮，生物碱，萜类化合物和碳水化合物存在。在叶子的PET醚和乙醇提取物中都检测到植物化合物，特别是生物碱，类黄酮，单宁，皂苷，糖苷和碳水化合物。在树的树皮和叶子中发现的植物化合物的定量确定表明，提取物的生物碱，类黄酮和糖苷的值明显高于树皮。皂苷和蒽醌在树皮中比在叶片中要多得多。叶片中的总灰分，水溶性，酸不溶和硫化灰的测量分别为12.14％，5.53％，2.04％和14.02％。获得的结果非常明显，可以在治疗氧化应激和其他相关疾病的治疗中进一步探索该植物。索引术语 - 体操运动物杏仁核，植物化学组成，生理化学组成，定量分析，生物碱，萜类化合物和类黄酮。I.简介
AndréZiegler博士，Roche Diagnostics 对HeartQol健康相关的生活质量问卷的验证提出了14个项目问卷的验证概述，旨在成为我们 2023 ESC指南的基本消息 Ola Vedin博士，阿斯利康 心血管基因疗法 Bettina Kraus博士，Boehringer-ingelheim 申请人符合Dora的简历模板 2024 ESC指南的基本消息 2024 ESC外周动脉和主动脉疾病管理指南 Andreas Giannopoulos，医学博士，博士学位 EAPCI奖学金赠款2024-规章制度 - ... 心血管和呼吸系统头部负责人 心血管基因疗法：道德考虑因素
•IE的抗生素治疗有两个阶段。第一阶段由院内静脉内2周组成治疗。在此初始阶段，应进行心脏手术，如果指示，应去除感染的异物，并应排干心脏以及心脏外脓肿。在第二阶段，在选定的患者中，可以在门诊或口服抗生素计划中完成抗生素治疗长达6周。•葡萄球菌NVE不建议氨基糖苷，因为尚未证明其临床益处。在IE中是由其他微生物引起的，其中指示氨基糖苷，应以每日剂量处方以降低肾毒性。•利福平在3-5天的有效抗生素治疗后，仅在涉及异物（例如PVE）的IE中使用。•当指示达托霉素时，必须以高剂量（每天10 mg/kg一次）给予，并与第二种抗生素（β-内酰胺或β-内酰基过敏患者中的β-内酰胺或fosfymycin）结合，以增加活性并避免耐药性的发展。•OPAT只能在脚趾显示出局部进展和并发症的情况下才开始（例如严重的瓣膜功能障碍）。•在OPAT计划中，如果可能的话，患者继续使用急性期使用相同的抗生素。
木聚糖酶对石油烃污染土壤的生物修复
汽油范围碳氢化合物 (GRH) 有两种：汽油范围 GRH 和柴油范围 GRH。DRH (PHC) 包括多环芳烃和长链烷烃等。GRH 包括甲苯、苯、二甲苯和乙苯等碳氢化合物 [3]。糖苷水解酶（称为木聚糖酶 (EC 3.2.1.x)）可催化木聚糖中 1,4-D-木糖苷键的内水解。包括细菌、藻类、真菌、原生动物、腹足类和人足类在内的多种生物都会产生这种普遍存在的酶组，这些酶参与木糖的形成（木糖是细胞代谢的关键碳源）以及植物病原体对植物细胞的感染 [4]。木聚糖是自然界中第二常见的多糖，是植物细胞的主要结构成分，约占整个地球可再生有机碳的三分之一。半纤维素、木葡聚糖、葡甘露聚糖、半乳葡甘露聚糖和阿拉伯半乳聚糖的主要成分是木聚糖 [4, 5]。在酿造过程中，木聚糖酶可以提高麦芽汁的过滤性并减少最终产品的浑浊度。它们还可用于咖啡提取和速溶咖啡的制备、洗涤剂、植物细胞的原生质体化、生产用作抗菌剂或抗氧化剂的药理活性多糖，以及生产用作表面活性剂的烷基糖苷 [6]。
制药和医学领域的生物技术
抗生素的作用机制按抗生素种类分为抑制或抑制剂类，：1.抑制细菌细胞壁：青霉素、多西环素、氨苄青霉素；2.抑制转录和复制：喹诺酮类、甲硝唑；3.抑制蛋白质合成：大环内酯类、氨基糖苷类；4.抑制细胞膜功能：离子霉素、缬氨霉素；5.抑制其他机制，如抗代谢物：磺胺类、甲硝唑
抗菌药物的模型信息开发：转化PK和PK/PD建模，以预测APRAMYCIN的有效人剂量
apramycin代表了氨基糖苷抗生素的一个亚类，该类别已证明可以逃避几乎所有与临床相关的氨基糖苷耐药性的机制。模型的药物发育可能有助于其从临床前阶段过渡到临床阶段。这项研究探讨了药代动力学/药效学（PK/PD）建模的潜力，以最大程度地利用体外时间杀伤和体内临床前数据来预测APRAMYCIN的人体有效剂量（HED）。PK模型参数来自四种不同物种（小鼠，大鼠，豚鼠和狗）的 pk模型参数。 从四个大肠杆菌菌株的丰富体外数据中开发了一种半机械PK/PD模型，随后集成了相同菌株的稀疏体内疗效数据。 通过PK/PD模型预测了有效的人剂量，并将其与经典的PK/PD指数方法和氨基糖苷剂量相似性进行了比较。 一个门交模型描述了清除率和分布量的PK数据和人类价值，分别为7.07 l/小时和26.8 L。 在大腿模型中，所需的F AUC/MIC（在未结合的药物浓度时曲线与MIC比率下的面积相比MIC比率）分别为34.5和76.2。 开发的PK/PD模型可以很好地预测疗效数据，其易感性，最大细菌负荷和耐药性发展的菌株特异性差异。 所有三种剂量预测方法均支持典型的成年患者的APRAMYCIN每日剂量为30 mg/kg。pk模型参数。从四个大肠杆菌菌株的丰富体外数据中开发了一种半机械PK/PD模型，随后集成了相同菌株的稀疏体内疗效数据。通过PK/PD模型预测了有效的人剂量，并将其与经典的PK/PD指数方法和氨基糖苷剂量相似性进行了比较。一个门交模型描述了清除率和分布量的PK数据和人类价值，分别为7.07 l/小时和26.8 L。在大腿模型中，所需的F AUC/MIC（在未结合的药物浓度时曲线与MIC比率下的面积相比MIC比率）分别为34.5和76.2。开发的PK/PD模型可以很好地预测疗效数据，其易感性，最大细菌负荷和耐药性发展的菌株特异性差异。所有三种剂量预测方法均支持典型的成年患者的APRAMYCIN每日剂量为30 mg/kg。结果表明，机械PK/PD建模方法可以适用于HED预测，并有效地整合了所有可用的效力数据，并有可能提高预测能力。
评估napoleona imperionis茎皮的定性和定量植物化学成分
这项研究的目的是确定Napoleona Imperialis茎皮的定性和定量植物化学物质。方法：使用标准程序进行了拿破仑帝国茎皮的提取和植物化学分析。结果：napoleona帝国茎皮树皮提取物的产量为76.9g（7.69％）和甲醇napoleona imperionis茎皮树皮提取物，当使用1000G粉状时，也产生了58.5g（5.85％）的产量。该提取物的定性植物化学分析在水提取物中表现出中等量的生物碱，类固醇和萜类化学分析，而甲醇提取物的含有类黄酮，皂苷和单宁也适量。少量的类黄酮，皂苷，心脏糖苷和单宁，因此，在甲醇提取物中也可以看到少量的生物碱，类固醇，萜类化合物和心脏糖苷。对植物化学物质的定量分析进行了两次和平均值。Phenol had a concentration of 1.173mg/kg, Steroids had 0.623mg/kg, Terpenoid had 3.031mg/kg, Flavonoid showed 58.240mg/kg, Saponin had 13.190mg/kg, Alkaloid had 13.530mg/kg, Cardiac glycoside with 3.910mg/kg,植酸盐显示2.320mg/kg，单宁的含量为52.500mg/kg，氰化氢的含量为13.500mg/kg。这项研究证明，Napoleona Imperialis含有一些对人类有用的植物化学物质，并且该植物提取物的一部分也表现出药用特性。
最初发表于：洛雷（Lorè），尼古拉·伊万（Nicola Ivan）；萨利，法比奥； Spitaleri，Andrea； Schäfle，丹尼尔；尼古拉（Nicola），弗朗西斯卡（Francesca）； Cirillo，Daniela Maria；桑德，彼得
1个新兴的细菌病原体单元，Ditid-Irccs Ospedale San Raffaele，米兰，意大利米兰2号医学微生物学研究所，苏黎世大学，苏黎世，瑞士，瑞士3国家菌群国家中心肺部疾病患者（如支气管扩张或囊性纤维化）的肺定植后感染。它已成为有关感染严重程度和对抗生素治疗的反应不佳的最临床相关的无结局（REF）之一。M.腹肌配合物（MABSC）由三个亚种超腹，骨和质量组成。MABSC肺部疾病的特征是存在ATS/ESCMID/ESS/IDSA共识陈述（REF）中描述的特定微生物，临床和放射学特征。感染。用于治疗MABSC肺部感染的抗生素方案通常结合了3至4种抗生素，包括克拉霉素，amikacin，头孢辛蛋白，imipenem或Tigecycline，共12-24个月。尽管有毒性，但氨基糖苷氨基甲胺仍然是该方案中的关键组成部分。对氨基糖苷的耐药性主要是通过修饰酶（例如AAC（2'），APH（3''）和EIS2赋予的。在最近的一项工作中，脱氧于腹肌分枝杆菌的基因上的删除，编码杂交的N-乙酰基转移酶，增加了体外易感性对capreomycin，kanamycin和amikacin的敏感性。发现，通过提高细菌对特定的，有执照的抗生素的敏感性，可能会改善治疗结果，从而提高了细菌易感性，从而可以提供新的互补治疗靶标，从而提供新的互补治疗靶标。