全球气候变化对陆地生态系统功能影响巨大,降水模式的波动范围从极端干旱到不适应这些条件的生态系统中的高强度降雨事件。同时,生态系统功能受到生物多样性迅速丧失的威胁(Tilman 等人,2012 年)。气候变化和生物多样性对生态系统功能产生复合影响的可能性凸显了同时考虑这两个因素的必要性。通过更好地了解生物多样性和气候变化对生态系统过程的潜在机制介质,可以更好地预测此类影响。大量研究表明土壤微生物在生态系统功能( Austin 等人, 2014 ; Dubey 等人, 2019 ; Podzikowski 等人, 2024 )和生物多样性维持( Van Der Heijden 等人, 2008 ; Bever 等人, 2015 )中发挥着关键作用,因此很可能成为调节生物多样性和气候变化对生态系统功能的联合影响的候选者。因此,了解土壤微生物组(包括功能不同的微生物群)如何应对气候扰动以及植物多样性和组成的变化至关重要。土壤微生物组已被证明对降水变化高度敏感( Barnard 等人, 2013 ; Engelhardt 等人, 2018 )。研究表明,细菌和真菌(包括真菌病原体(Coulhoun,1973 年;Talley 等人,2002 年;Delavaux 等人,2021 年 a)和丛枝菌根 (AM) 真菌(House and Bever,2018 年)和卵菌(Van West 等人,2003 年;Delavaux 等人,2021 年 a))的丰富度、丰度和组成会随着降水量的变化而变化。虽然细菌和真菌都对降水量的增加作出反应,但研究发现真菌比细菌更能耐受干旱条件(Barnard 等人,2013 年;Engelhardt 等人,2018 年)。同时,一些真菌病原体(例如锈病,Froelich 和 Snow,1986;根腐病 Wyka 等人,2018;Bevacqua 等人,2023)和腐生菌(Delavaux 等人,2021a)被发现在较潮湿的条件下繁殖。此外,陆生卵菌通常是植物病原体,它们在较潮湿的条件下多样性增加(Delavaux 等人,2021a),这可能是它们依赖水的生命周期所预期的(Thines,2018)。因此,这些对降水的不同反应对于微生物组对植物群落的反馈具有重大影响,例如在干旱条件下对 AM 真菌伙伴的依赖增加( Stahl 和 Smith,1984 ; Schultz 等人,2001 ; Auge,2001 ; Marulanda 等人,2003 )以及在潮湿条件下病原体的影响可能更大。因此,确定功能和分类学上不同的土壤微生物群对重大降水变化的相对敏感性,对于理解微生物组驱动的功能如何随着干旱期延长和降雨期加剧而发生变化至关重要。迄今为止,还没有研究测量过微生物功能群对降水实验性改变的广度。土壤微生物组对植物群落组成也高度敏感。植物物种丰富度的提高可以增加微生物多样性(Lamb 等人,2011 年;Burrill 等人,2023 年),因为植物物种的微生物组通常因根系结构(Saleem 等人,2018 年)、根系
索邦纳大学(Sorbonne Universite),巴黎脑研究所(ICM),Inserm,CNRS,CNRS,APHP,Hôpitalde la Pitie ́Salpêtrie ̀雷,47 Boulevard del'Hôpital,France Bonn and Bonn Nut and Micro Science and Micro Science and Insipmation 。 Katzenburgweg 7,53115德国B波恩C基因组统计研究所和生物信息学研究所,波恩大学和大学医院波恩,维纳斯伯格校园1,53127 BONN,德国BONN,BONN,BONNY D BONN D BONN,实验性癫痫学研究所 Boulevard de Constance, 77300 Fontainebleau, France f Lyon Neuroscience Research Center, CNRS, INSERM, Claude Bernard University Lyon 1, CH Le Vinatier - Bâtiment 462 - Neurocampus, 95 Bd Pinel, 69500 Bron, France *To whom correspondence should be addressed: Email: hilke.plassmann@insead.edu 1 Shared senior作者身份。 编辑者:Stephen Fleming。 Katzenburgweg 7,53115德国B波恩C基因组统计研究所和生物信息学研究所,波恩大学和大学医院波恩,维纳斯伯格校园1,53127 BONN,德国BONN,BONN,BONNY D BONN D BONN,实验性癫痫学研究所 Boulevard de Constance, 77300 Fontainebleau, France f Lyon Neuroscience Research Center, CNRS, INSERM, Claude Bernard University Lyon 1, CH Le Vinatier - Bâtiment 462 - Neurocampus, 95 Bd Pinel, 69500 Bron, France *To whom correspondence should be addressed: Email: hilke.plassmann@insead.edu 1 Shared senior作者身份。编辑者:Stephen Fleming
[3] 基因编辑技术的出现提供了一种更精确的方法,可以在特定的基因组位置有针对性地插入或修改调控元件。成簇的规律间隔的短回文重复序列/CRISPR 相关蛋白 9(CRISPR/Cas9)彻底改变了基因编辑领域,为研究人员提供了精确基因改造的有力工具。关键的突破出现在 2012 年,当时 Emmanuelle Charpentier 和 Jennifer Doudna 证明 CRISPR/Cas9 系统可以被编程来切割特定的 DNA 序列,为其作为基因组编辑工具的应用奠定了基础 [4] ,这一发现后来获得了 2020 年的诺贝尔化学奖。事实证明,这项技术对于研究基因功能和改良作物性状非常有价值。虽然 CRISPR/Cas9 已广泛用于基因敲除,但它在通过同源定向修复(HDR)进行基因上调方面的应用仍在发展,尤其是在水稻中 [5] 。基于 HDR 的基因编辑需要同时将 CRISPR/Cas9 表达系统和 DNA 修复模板递送到细胞中。该过程可以通过
摘要:确定房地产价格的传统(手动)方法在某些情况下容易犯错,这些错误可能是由于分心,缺乏专心或易受房地产经纪人欺诈的脆弱性。这项工作着重于使用更多最新方法评估房地产的房屋价格预测。使用诸如房屋定价指数和随机森林机器学习技术等方法的房屋定价已被讨论,提出了一种新方法,作为使用额外树回归的模型,因为它在树木建造过程中引入了额外的随机性。Kaggle波士顿壳体数据集具有506个条目,并采用了14个功能来训练和测试开发的模型,然后通过平均绝对误差和平均平方误差来确定效率。此外,在随机森林回归模型和提出的预测模型之间进行了比较,该模型表明,新的预测模型比随机森林回归产生的性能更好。
。CC-BY 4.0 国际许可(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2025 年 1 月 23 日发布。;https://doi.org/10.1101/2024.07.29.605705 doi:bioRxiv 预印本
城市固体废物 (MSW) 填埋场代表着尚未充分探索的微生物生态系统。填埋场中含有不同数量的抗生素和建筑和拆除 (C&D) 废物,这些废物有可能因杀生物剂或氧化还原活性成分而改变微生物代谢,而这些影响在很大程度上尚未得到充分探索。为了规避 MSW 异质性的挑战,我们对模拟的 MSW 微观世界进行了一项 65 天的时间序列研究,以评估微生物组的变化,使用 16S rRNA 测序来响应 1) Fe(OH) 3 和 2) Na 2 SO 4 来代表 C&D 废物的氧化还原活性成分以及 3) 抗生素。Fe(OH) 3 的添加改变了整体群落组成,增加了 Shannon 多样性和 Chao1 丰富度。添加七种抗生素的混合物(每种 1000 ng/L)会改变群落组成,而不会影响多样性指标。添加硫酸盐对微生物群落组成或多样性影响不大。这些结果表明,新鲜 MSW 中的微生物群落组成可能会受到铁废物涌入和单一抗生素应用的显著影响。
描述回归,分类,轮廓图,合成数据分布的假设测试和拟合是其中的一些功能。我们还包括百分比(或比例)的功能。此类数据的标准教科书是John Aitchison(1986)``Compotical Data的统计分析''。相关论文包括:a)Tsagris M.T.,Preston S.和Wood A.T.A.(2011)。``构图数据的基于数据的功率传输''。第四届国际国际组合数据分析研讨会。b)Tsagris M.(2014)。``用于组成数据的K-NN算法:具有和不具有零值的经修订的ap-aper''。数据科学杂志,12(3):519--534。。c)Tsagris M.(2015)。``一个基于组合数据的新颖,基于差异的回归''。2015年4月15日至18日,第28届Panhellenic统计会议会议录,希腊雅典,430--444。。d)Tsagris M.(2015)。``包含零值的组成数据回归分析''。智利统计杂志,6(2):47--57。。
结果表明,TSFP能显著降低糖尿病小鼠的空腹血糖(FBG)水平并抑制糖代谢基因的mRNA表达。此外,TSFP可以改善脂质代谢紊乱并提高抗氧化能力。此外,TSFP可以减轻糖尿病小鼠的病理损伤并阻碍炎症过程。此外,补充TSFP通过丰富有益细菌和抑制病原微生物表现出更强的塑造和优化肠道微生物组成的能力。相关性分析还显示,TSFP治疗组的功能性细菌丰度与血清参数表现出更好的相关性,这对血糖调节和炎症缓解具有积极意义。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年1月12日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.04.04.588169 doi:Biorxiv Preprint