组蛋白去乙酰化酶抑制剂已被研究作为癌症和其他疾病的潜在治疗剂。已知 HDI 可促进组蛋白乙酰化,从而导致开放染色质构象并通常增加基因表达。在之前的研究中,我们报告了一组基因,特别是那些由超级增强子调控的基因,可以被 HDAC 抑制剂拉格唑抑制。为了阐明拉格唑抑制基因的分子机制,我们进行了转座酶可及染色质测序、ChIP-seq 和 RNA-seq 研究。我们的研究结果表明,虽然拉格唑治疗通常会增强染色质的可及性,但它会选择性地降低一组超级增强子区域的可及性。这些基因组区域在拉格唑存在下表现出最显著的变化,富含 SP1、BRD4、CTCF 和 YY1 的转录因子结合基序。 ChIP-seq 分析证实 BRD4 和 SP1 在染色质上各自位点的结合减少,特别是在调节基因(如 ID1、c-Myc 和 MCM)的超级增强子上。拉格唑通过抑制 DNA 复制、RNA 加工和细胞周期进程发挥作用,部分是通过抑制 SP1 表达来实现的。shRNA 消耗 SP1 可模拟拉格唑的几种关键生物学效应并增加细胞对该药物的敏感性。针对细胞周期调控,我们证明拉格唑通过干扰中期染色体排列来破坏 G/M 转换,这种表型在 SP1 消耗时也观察到。我们的结果表明,拉格唑通过抑制超级增强子上的 BRD4 和 SP1 发挥其生长抑制作用,导致细胞抑制反应和有丝分裂功能障碍。
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