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World File Search System细胞信号
Vivek Kashyap（助理研究员）
我在 Chauhan 博士实验室的研究目标是研究临床前药物开发、化学预防、细胞信号传导、纳米技术疗法、癌症诊断和预后生物标志物开发的命运。我正在研究 HPV 基因型流行率、HPV 16 E6 基因组变异频率以及导致 RGV 女性宫颈癌差异、转移和耐药性的免疫因素的分析。我的工作还侧重于了解各种合并症因素（即吸烟、酒精和 HIV 合并感染对 HPV 感染性的影响，这些因素主要导致宫颈癌的进展）之间的分子相互作用，并识别可用于预防和治疗癌症的新小分子。我研究的其他方面是阐明癌细胞中的耐药机制，并利用纳米技术开发临床药物（荜茇胺、白花丹素、α-芒果素和姜黄素）的靶向递送，并在临床前小鼠模型中评估它们的治疗效果。
MAPK和PI3K途径的四倍编辑有效地阻止Kras突变的结直肠癌细胞的进展
包含完整的蛋白酶抑制剂鸡尾酒（Roche，巴塞尔，瑞士）。将提取物通过十二烷基硫酸钠 - 聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）分离，并转移到聚偏二氟化物（PVDF）膜上。膜用5％的非脂肪牛奶或5％牛血清白蛋白（BSA）封闭，然后与针对以下抗原的主要抗体孵育：KRAS：KRAS（＃12063-1; Proteintech，Rosemont，Rosemont，IL，IL，USA），PIK3CA，PIK3CA（PIK3CA），PIK3CA（＃4249; Celling Signaling Technology; Celling Signaling Technology，Signal，Danvers，Danvers，Ma），Ma，Ma），MA，AKT（29），＃29; phospho-AKT (Ser473; #4060; Cell Signaling Technology), MTOR (#2983; Cell Signaling Technology), S6K (#9202; Cell Signaling Technology), phospho-S6K (T389; #9205; Cell Signaling Technology), MEK (#9126; Cell Signaling Technology), ERK (#4695; Cell Signaling Technology), phospho-ERK （Thr202/Tyr204;＃4370;细胞信号技术），
基于 DNA 的瞬态胶体共价连接信号网络...
摘要 受活细胞信号网络启发的可编程化学电路是开发自适应和自主自组装分子系统和材料功能的一种有前途的方法。分子水平上已经取得了进展，但将分子控制电路连接到自组装较大元素（如胶体）以进行实空间研究和获取功能材料的方法很少，而且可能会受到动力学陷阱、絮凝或困难的系统集成协议的影响。我们在此报告了一种立足点介导的 DNA 链置换反应网络，该网络能够自主地将两种不同的微凝胶引导到瞬态和自调节的共组装中。微凝胶被 DNA 功能化并成为网络的基本组成部分。电路设计的灵活性允许通过在核心电路的上游或下游链接额外的电路模块来安装延迟阶段或加速器。该设计提供了一种适应性强且强大的方法来调节其他构建块以实现高级仿生功能。
cxcr4导向的成像和内放射疗法
1外科部，纽约纽约纪念斯隆·凯特林癌症中心； 2纽约纽约的纪念斯隆·凯特林癌症中心放射学系； 3新泽西州罗格斯大学新泽西医学院放射学系和细胞信号中心辐射研究部；新泽西州纽瓦克； 4纽约纽约威尔·康奈尔医学放射学系； 5分子药理学计划，纽约纽约纪念斯隆·凯特林癌症中心； 6纽约纽约的纪念斯隆·凯特林癌症中心儿科部； 7纽约纽约的纪念斯隆·凯特林癌症中心医学物理部； 8比较病理学实验室，纪念斯隆·凯特林癌症中心，威尔·康奈尔医学和纽约纽约的洛克菲勒大学；和9个有机合成核心设施，纽约纽约纪念斯隆·凯特林癌症中心
评估Qrisk3在正常同生中的评分，...
引言非传染性疾病被认为是所有死亡人数超过60％的造成的，包括CVD，不同的恶性肿瘤，慢性呼吸系统疾病，糖尿病等。根据世界卫生组织（WHO），全世界有1770万人死亡，CVD是主要原因，包括中风和缺血性心脏病等脑血管疾病[1]。世界卫生组织说，这些死亡中的五分之一发生在印度[2]。人们认为，传统的危险因素，例如高血压，糖尿病，血脂异常，吸烟和肥胖，在印第安人中有助于冠状动脉疾病（CAD）的较高患病率[3]。治疗需要预防主要CVD的个体的第一个也是最重要的步骤是估计未来心血管事件的风险。QRisk3是一种基于网络的算法，用于估计10年CVD风险。Qrisk3的性能已在不同的人群中得到验证，结果非常好。高风险CVD定义为QRisk3 10年CVD风险评分超过20％[4]。相互联系的代谢和炎症途径与表观遗传，遗传和细胞信号异常有关
有针对性的witturb-seq揭示了EGR1和FOS作为转录RAF-MAPK响应的关键调节剂
MAPK途径是重要的细胞信号级联，其功能障碍会导致多种疾病。虽然该级联反应的上游调节剂已得到广泛的特征，但对其激活方式转化为不同的转录响应的理解仍然很众所周知。这项研究试图通过使用靶向的wisturb-seq来填补这一知识空白，以针对Raf-Mapk信号的诱导模型系统中的22个转录因子。基于拓扑的建模方法应用于获得的数据以构建方向交互网络。通过删除连贯的前馈回路并整合了转录因子的表达动力学，得出了一个简约的网络结构，该结构将直接与研究的转录因子及其靶标之间的间接相互作用区分开来。特别是，发现EGR1和FOS充当RAF-MAPK响应的正交上游调节剂。此处提供的结果为RAF-MAPK信号下游的转录网络的组织提供了宝贵的见解，从而为更好地理解这一复杂过程提供了基础。
破译MTOR信号传导的复杂作用和...
哺乳动物/mTOR是丝氨酸 - 硫代激酶。它控制了哺乳动物细胞的许多重要功能，例如细胞存活和蛋白质合成[4]。在2000年代初期，神经科学家开始对MTOR目标的兴趣。4E结合蛋白和P70核糖体S6蛋白激酶1最初研究[5]。在确定MTOR在神经元形态发生，生存和分化中的作用后不久，靶标开始流行，许多科学家在PD和Alzheimer病（AD）等不同疾病中观察到了其在不同疾病中的作用。与MTOR相关的生理状况和神经病理列表迅速增加，但是对MTOR调节及其神经元中其细胞效应子的透彻了解仍然难以捉摸。自噬，翻译，细胞信号传导，转录和细胞骨架动力学都受MTOR活性变化的影响[6]。根据新的研究，MTOR的过表达与PD的发病机理有关[7,8]。结果，mTOR可能是PD的可能治疗靶标之一[9]。MTOR活动很有争议。它具有
拷贝数畸变驱动激酶重新布线，导致癌症的遗传脆弱性
体细胞DNA拷贝数变化（CNV）在癌症中很普遍，并且可以驱动癌症进展，尽管在改变细胞信号状态下通常具有未表征的作用。在这里，我们整合了5,598个肿瘤样品的基因组和蛋白质组学数据，以鉴定导致异常信号转导的CNV。由此产生的关联概括了已知的激酶 - 基底关系，并进一步的网络分析优先考虑可能因果基因。在癌细胞系中复制了43％，包括在多种肿瘤类型中鉴定出的44种强大的基因磷材料。实验验证了几个预测的河马信号调节剂。使用RNAi，CRISPR和药物筛选数据，我们发现癌细胞系中激酶成瘾的证据，确定靶向激酶依赖性细胞系的抑制剂。我们建议基因的拷贝数状态，作为激酶抑制差异影响的有用预测指标，这是一种抗癌疗法的策略。
3D大脑建模的多层打印电路板
人类的行为，记忆，情绪，学习能力，认知功能障碍以及各种形式的痴呆症在大脑内的通信途径上显着铰接，在大脑的通信途径中，细胞细胞信号传导在正常生理和疾病发病机理中都起着关键作用。响应于在不同的大脑区域中测量不同细胞种群的电活动的持续挑战，我们设计并测试了与微电极阵列集成的多层打印电路板（PCB）的两个版本。这种创新的PCB，其带有传导孔，经过两个或多个相邻的层和电极结构，可以测量不同层的细胞组之间的信号。每层代表具有特定细胞类型的不同大脑区域，通过导电孔与相邻层通信。将微流体纳入PCB可以增强其功能性药物筛查的实用性，最终通过更有效的筛查方法来减少动物使用情况并改善患者的结果。
用KRASG12D或KRASG12V突变的AMHR2-CRE小鼠中妇科肿瘤发展的差异
不同的KRAS变体如何影响体内肿瘤的启动和进展。我们假设KRAS G12D或KRAS G12V突变启动肿瘤形成的能力取决于上下文。AMHR2-CRE小鼠在组织中发育到输卵管，子宫和卵巢中的组织中表达CRE重组酶。我们使用这些小鼠来有条件地表达KRAS G12V/ +或KRAS G12D/ +突变。具有基因型AMHR2-CRE PTEN（FL/ FL）KRAS G12D/ +（G12D小鼠）的小鼠具有异常的卵泡结构，并在18周内开发了低级浆液卵巢癌，其渗透率为100％。相比之下，具有基因型AMHR2-CRE PTEN（FL/ FL）KRAS G12V/ +（G12V小鼠）的小鼠具有正常的卵泡结构，其中约90％的子宫肿瘤具有类似于平滑肌瘤和Leiomyosarcomarcoma的组织学特征多样的组织学特征。颗粒细胞肿瘤也在G12V小鼠中发展。 使用RNA测序和反相蛋白阵列分析鉴定出G12D和G12V小鼠子宫组织中细胞信号途径的差异。 我们发现CTNNB1，IL1A，IL1B，TNF，TGFB1，APP和IL6在G12V小鼠中的活性高于G12D小鼠。 这些小鼠模型将有助于研究由KRAS G12V/ +或KRAS G12D/ +突变驱动的信号传导途径的差异，以帮助开发针对特定的KRAS突变变体的靶向疗法。 由KRAS G12V/ +突变驱动的我们的平滑肌瘤模型也将有助于解密从平滑肌瘤到平滑肌肉瘤的恶性发展。颗粒细胞肿瘤也在G12V小鼠中发展。使用RNA测序和反相蛋白阵列分析鉴定出G12D和G12V小鼠子宫组织中细胞信号途径的差异。我们发现CTNNB1，IL1A，IL1B，TNF，TGFB1，APP和IL6在G12V小鼠中的活性高于G12D小鼠。这些小鼠模型将有助于研究由KRAS G12V/ +或KRAS G12D/ +突变驱动的信号传导途径的差异，以帮助开发针对特定的KRAS突变变体的靶向疗法。由KRAS G12V/ +突变驱动的我们的平滑肌瘤模型也将有助于解密从平滑肌瘤到平滑肌肉瘤的恶性发展。