摘要 转移 RNA (tRNA) 在蛋白质生物合成中起着核心作用。转录后 RNA 修饰影响 tRNA 的功能和稳定性。在这些修饰中,RNA 编辑是生命三个领域中广泛存在的 RNA 修饰。作用于 tRNA 的腺苷脱氨酶 (ADAT) 家族的蛋白质是在 20 多年前发现的。它们在 tRNA 成熟过程中催化腺苷脱氨为肌苷 (A - 到 - I) 或胞苷脱氨为尿苷 (C - 到 - U)。研究最多的例子是原核或真核 tRNA 反密码子中 tRNA 摆动位置的 TadA 或 ADAT2 / 3 介导的 A - 到 - I 转换。本综述提供了有关不同生命领域中 tRNA 的 A 到 I 和 C 到 U 编辑的详细信息,介绍了有关 DNA 编辑的 ADAT 的最新发现,最后评论了 ADAT3 基因突变与智力障碍之间的关联。
腺苷(a)至inosine(i)RNA编辑有助于转录本多样性,并以动态的细胞类型(特定方式)调节基因表达。在哺乳动物脑发育过程中,特定腺苷的编辑增加,而A-to-i编辑酶的表现保持不变,这表明存在介导RNA编辑时空调节的分子机制。在此,通过使用生化和基因组方法的组合,我们发现了一种分子机制,该机制以神经和发育特异性的方式调节RNA编辑。比较开发过程中的编辑,从而确定了仅在一个生命阶段编辑的神经转录本。特定于阶段的EDIT在神经发育过程中很大程度上受差异基因表达的调节。正确表达了近三分之一的神经发育调节基因取决于秀丽隐杆线虫中的唯一的A到I编辑酶ADR-2。但是,我们还确定了整个开发过程编辑和表达的神经转录本的子集。尽管在发育过程中ADR-2的神经特异性下调,但这些位点的大多数显示出成年神经细胞中的编辑增加。生化数据表明,作用于RNA(ADAR)家族的腺苷脱氨酶的脱氨酶缺陷成员ADR-1正在与ADR-2竞争,以在开发早期与特定转录本结合。我们的数据提出了一个模型,其中在神经发育过程中,ADR-2水平克服ADR-1抑制,从而导致ADR-2结合增加和特定转录本的编辑。一起,我们的发现揭示了RNA编辑的组织和开发特异性调节,并确定了调节ADAR底物识别和编辑效率的分子机制。
小球形头足动物通过腺苷脱氨基表现出异常广泛的mRNA,但尚不清楚基本机制。由于作用于RNA(ADAR)酶的腺苷脱氨酶会催化这种形式的RNA编辑,因此头足类直系同源物的结构和功能可能会提供线索。最近的基因组测序项目提供了蓝图,以全面互补。我们实验室的先前结果表明,Squid表达了一个ADAR2同源物,具有两个名为SQADAR2A和SQADAR2B的剪接变体,并且这些消息经过广泛编辑。基于章鱼和鱿鱼基因组,转录组和cDNA克隆,我们发现在小卵形中表达了另外两个ADAR同源物。第一个与脊椎动物ADAR1直系同源。与其他ADAR1不同,它包含一个新型的N末端结构域,为641 AA,预测为无序,包含67个磷酸化基序,并且具有氨基酸组成,丝氨酸和碱性氨基酸的氨基酸组成异常高。编码sqadar1的mRNA本身是广泛编辑的。也存在于任何脊椎动物同工型的直系同源的sqadar/d-like酶。编码SQADAR/D类的消息未编辑。使用重组SQADAR的研究表明,仅在完美的双链dsRNA和鱿鱼钾通道mRNA底物上,只有SQADAR1和SQADAR2是活跃的腺苷脱氨酶。sqadar/d样对这些底物没有活性。对这些底物没有活性。总体而言,这些结果揭示了SQADARS中的一些独特特征,这些特征可能会导致头足类动物中观察到的高级RNA回收。
当 G 蛋白被气味受体激活时,α 亚基中的 GDP 被鸟苷三磷酸 (GTf) 取代。此过程导致 α 亚基与 β 和 γ 亚基分离。释放的 α 亚基现在与酶 -腺苷酸环化酶 (AC) 结合并激活该酶。酶活化过程将 GTP 水解为 GDP。然后 α 亚基与 β 和 γ 亚基重新结合,使 G 蛋白恢复到静止状态。活化的酶将腺苷三磷酸 (ATP) 环化为环-3'-5'-腺苷单磷酸 (cAMP),后者充当细胞内激素(通常称为“第二信使”)。细胞内 cAMP 浓度急剧增加,从而激活(打开)细胞膜上的门控离子蛋白通道。打开的通道允许细胞外无机离子(Ca++)流入燃料电池,导致其极化。细胞因氯离子流而去极化,这种全细胞电流是气味接收信号的来源,该信号通过轴突传送到嗅球[7]。我
烟酰胺腺苷二核苷酸磷酸(NADPH)氧化酶(NOX)通过介导活性氧的产生,在真核细胞的生理学中具有重要作用。在细菌中发现了具有NOX催化核心的进化较远的蛋白质,包括肺炎链球菌NOX(SPNOX),该蛋白质被认为是研究NOX的模型,因为其在洗涤剂胶束中具有较高的活性和稳定性。我们在这里提出了无底物和烟酰胺腺苷二核苷酸(NADH)结合的SPNOX以及NADPH结合的野生型和F397A SPNOX的冷冻电子显微镜结构。这些高分辨率结构提供了对电子转移途径的见解,并揭示了由F397位移调节的氢化物转移机制。我们进行了结构引导的诱变和生化分析,这些诱变解释了对NADPH的底物特异性的缺乏,并提出了组成型活性背后的机制。我们的研究提出了结构基础SPNOX酶活性,并阐明了其体内功能的潜力。
摘要:表观转录组学是指通过影响 RNA 功能的 RNA 修饰和编辑来对基因表达进行转录后调控。已描述了多种类型的 mRNA 修饰,其中包括 N6-甲基腺苷 (m6A)、N1-甲基腺苷 (m1A)、7-甲基鸟苷 (m7G)、假尿苷 (Ψ) 和 5-甲基胞苷 (m5C)。它们改变 mRNA 结构,从而改变稳定性、定位和翻译效率。表观转录组的扰动与人类疾病有关,因此为潜在的治疗方法提供了机会。在这篇综述中,我们旨在概述表观转录组标记在骨骼肌系统中的功能作用,特别是在胚胎肌生成、肌细胞分化和肌肉稳态过程中。此外,我们探索了高通量表观转录组测序数据来识别肌肉特异性基因中的 RNA 化学修饰,并讨论了可能的功能作用和潜在的治疗应用。
描述:PRMT1 化学发光检测试剂盒旨在测量 PRMT1 活性,用于筛选和分析应用。PRMT1 化学发光检测试剂盒采用方便的形式,8 孔试纸条预涂有组蛋白 H4 肽底物、针对组蛋白 H4 甲基化精氨酸残基的抗体、HRP 标记的二抗、S-腺苷甲硫氨酸、甲基转移酶检测缓冲液和纯化的 PRMT1 酶,可进行 96 种酶反应。PRMT1 化学发光检测试剂盒的关键是一种高度特异性的抗体,可识别组蛋白 H4 甲基化的 R3 残基。使用此试剂盒,只需三个简单的步骤即可检测甲基转移酶。首先,将 S-腺苷甲硫氨酸与含有检测缓冲液和甲基转移酶的样品一起孵育。接下来,添加一抗。最后,用 HRP 标记的二抗处理试纸条,然后添加 ELISA ECL 底物以产生化学发光,然后可以使用化学发光读数仪进行测量。组件:
摘要研究表明,铁,碘,维生素B12和维生素D的缺陷与儿童发育延迟独立相关。虽然这些可能是独立的方式运作的,但这些营养素也有可能以某种联系在一起,这对于发育延迟而言是一种原因。维生素D的激活是一种多酶过程,它需要几个辅助因素(包括铁,维生素B2和维生素B12)的贡献。我们已经使用尿磷酸作为功能性维生素D缺乏症的标志物,并将各种泌尿代谢标记与尿磷酸水平进行了比较,以遵循维生素D激活中的基本元素。维生素D的激活取决于足够水平的铁,维生素B2和维生素B12,这是通过CYP27B1的多酶复合物在维生素D激活期间所必需的,腺苷毒素和腺苷毒素还原酶。这些发现将发育延迟的各种原因汇集到中央联系中,这些延迟可能有可能用于治疗和预防病情。
摘要:最近,狐猴酪氨酸激酶3(LMTK3)的致癌作用已在不同的肿瘤类型中得到很好的确定,从而将其作为可行的治疗靶标。在本研究中,使用体外和基于细胞的测定与生物物理分析相结合,我们确定了高度选择性的小分子LMTK3抑制剂,即C36。生化/生物物理和细胞研究表明,在国家癌症研究所(NCI)-60癌细胞系列面板中进行测试时,C36表现出高体外选择性,并具有明显的治疗作用。我们还报告了通过微观热疗法(MST)所证明的LMTK3和C36之间的结合功能。此外,C36对LMTK3表现出混合型抑制作用,与抑制剂与腺苷5' - 三磷酸腺苷(ATP)和底物结合位点一致。用C36治疗不同乳腺癌细胞系导致增殖减少和凋亡增加,进一步增强了LMTK3抑制剂对癌症治疗的预期价值。