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基因Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒RAA-CRISPR/Cas12a检测方法的 ...
恒温扩增核酸检测技术因其耗时短、对扩增 设备要求低和引物探针商品化合成稳定等优势 , 在 病原快速检测技术中脱颖而出。 Piepenburg 等 [ 13 ] 参 照 T4 噬菌体 DNA 复制系统于 2006 年创建了一种新 型等温扩增技术 , 使用酶来打开双链 DNA, 该技术 称为重组酶聚合酶扩增 (Recombinase polymerase am- plification, RPA) 。随后发明的重组酶介导链置换 核酸扩增技术 (Recombinase-aid amplification, RAA) 技术原理与 RPA 类似 , 不同之处在于 RAA 的重组酶 来源于细菌或真菌 , 而 RPA 的重组酶来自 T4 噬菌 体。 2017 年 [ 14 ] 结合以上重组酶 , SHERLOCK (Specifi- chigh-sensitivity enzymatic reporter unlocking) 检测 方案问世 , 并应用于新冠病毒的检测技术开发 [ 15 ] , 该技术通过改造规律间隔成簇短回文重复序列及 其关联蛋白 (Clustered regularly interspaced short pa- lindromic repeats/CRISPR-associated proteins system, CRISPR/Cas) 系统 , 使其能够识别特定的严重急性 呼吸综合征冠状病毒 2 (Severe acute respiratory syn- drome coronavirus 2, SARS-Cov-2) 基因组片段 , 1h 就能确定检测结果 , 检测限可低至 2 amol/L 。 SHER- LOCK 技术特异和简便 , 将 SHERLOCK 与 RAA 整合 集成 , 能够凸显两者的优势 , 不仅可以实现靶标核 酸的快速扩增 ( 保留等温扩增技术的优势 ), 还增强 了检测特异性。
草鱼（Ctenopharyngodon idella）中潜在抗病毒三部分基序蛋白（TRIM）的全基因组鉴定和表达分析
简单总结：草鱼Ctenopharyngodon idellus是我国重要的淡水养殖硬骨鱼类，年产量达5,533,083吨，但由草鱼呼肠孤病毒（GCRV）引起的出血病严重制约了草鱼的养殖。为了更好地控制草鱼出血病，基于抗病毒免疫分子标记的抗性草鱼品系的培育是一种潜在的解决方案。然而，草鱼抗GCRV感染的分子基础仍然很大程度上未知，大大限制了抗出血病草鱼的培育。鉴于三部分基序蛋白（TRIM）在动物抗病毒免疫中的重要性，我们利用隐马尔可夫模型生物序列分析软件（HMMER）和SMART对草鱼基因组中的TRIM进行鉴定，并分析其基因位点、结构和进化特征。我们还尝试基于两组转录组揭示草鱼在GCRV感染过程中的抗病毒TRIM及其介导的免疫过程。本研究为了解草鱼的TRIM和抗病毒免疫提供了信息。
纯种繁殖动物 Sch-A 0 0 2 0101.29.00
195 0302.73.00 - - 鲤鱼（鲤鱼属、鲫鱼属、草鱼属、鲫鱼属、卷鱼属、青鱼属、喀拉鱼属、鲫鱼属、哈氏骨鱼、鲂鱼属、鲂鱼属） ）
水产养殖中的基因组编辑
草鱼 10.5 X 鲢鱼 8.8 尼罗罗非鱼 8.3 XX 鲤鱼 7.7 X 鳙鱼 5.8 卡特拉鱼 5.6 鲫鱼 5.1 颜色 大西洋鲑鱼 4.5 X 颜色，脂肪酸代谢 条纹鲶鱼 4.3 南亚鲮 3.7 X 虱目鱼 2.4 鱼雷鲶鱼 2.3 虹鳟鱼 1.6 X 武昌鲷 1.4 青鱼 1.3 黄鲶 0.9 X 斑点叉尾鲶 - XXX 大型泥鳅 - 颜色 牙鲆 - X 太平洋蓝鳍金枪鱼 - 游泳行为 太平洋牡蛎 - 肌球蛋白功能 赤鲷 - X 白虾 - 几丁质酶功能 南方鲶鱼 - X 虎斑河豚 - X
明尼苏达州入侵鲤鱼行动计划 - 文件 . dnr . 州 . mn . 美国
近年来，入侵性鲤鱼的捕获量有所增加，最大的一次捕获量是 2023 年底在密西西比河 6 号水池捕获的 410 条入侵性鲤鱼。请参阅附录 C，了解 2012 年至 2023 年明尼苏达州水域确认的入侵性鲤鱼图表。截至 2023 年，入侵性大头鱼、草鱼和银鲤的最上游发现地点是黑斯廷斯附近的密西西比河 2 号水池、斯蒂尔沃特附近的圣克罗伊河下游以及明尼苏达河花岗岩瀑布大坝下方。从捕获量、跳跃银鲤的目击情况和标记数据中得到的信息表明，在 2019 年和 2023 年春季洪水期间，更多的入侵性鲤鱼从密西西比河上游的开放式水坝中游过。明尼苏达州没有发现黑鲤鱼；在密西西比河，目前已知黑鲤鱼位于爱荷华州基奥卡克附近的 19 号船闸和大坝下方。