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肠道菌群：抗击结核病的关键因素
哺乳动物出生后不久，其胃肠道便会迅速被外来微生物密集占据，从而建立一个终生存在的微生物群落。这些共生肠道菌群具有多种功能，例如提供营养、处理摄入的化合物、维持肠道稳态以及塑造宿主的肠道结构。菌群失衡的特征是微生物群落失衡，与人类多种疾病密切相关，最近已成为健康预后的一个关键因素。结核病 (TB) 是一种传染性极强且可能致命的疾病，迫切需要改进预防、诊断和治疗策略。因此，我们旨在探索宿主的免疫防御、炎症反应、代谢途径和营养状况如何共同影响宿主对结核分枝杆菌感染的易感性或抵抗力的最新进展。本综述探讨了肠道微生物群的波动不仅影响这些生理过程的平衡，还间接影响宿主抵抗结核分枝杆菌的能力。这项研究强调了肠道微生物群在宿主-微生物相互作用中的核心作用，并为结核病预防和治疗方法的进步提供了新的见解。
引用 Ye X, Yu F, Zhou J, Zhao C, Wu J 和 Ni X (2023) 使用 metatag 分析胃食管反流病儿童的肠道菌群
胃食管反流病(GERD)是指胃内容物反流至食管，引起相应食管症状和/或并发症的疾病，典型症状为烧心、反流、胸痛，还可引起慢性咳嗽、哮喘、吸入性肺炎、咽炎等食管外症状，严重影响患者生活质量。GERD在西方国家的发病率为10%～20%，在亚洲为5.2%～18.3%（Jung，2011）。根据内镜表现分为非糜烂性反流病(NERD)、反流食管炎(RE)和Barrett食管(BE)三种类型。传统观点认为GERD的病理改变主要是胃酸或十二指肠胆汁反流刺激食管黏膜产生的化学性损伤所致，随着病情进展，病变逐渐累及黏膜层、黏膜下层、肌层及浆膜层。但大多数GERD患者在内镜下并无黏膜损伤，提示可能存在其他致病过程（Boeckxstaens et al., 2014; D'Souza et al., 2021; Sharma and Yadlapati, 2021）。近期研究表明，肠道菌群与宿主免疫系统的相互作用在胃肠道疾病（包括食管相关疾病）的发病机制中起关键作用（Gorkiewicz and Moschen, 2018; Dicks, 2022）。肠道菌群的多样性、稳定性、弹性和对生理、病理和环境变化的响应性使其成为许多疾病的有用生物标志物、诊断工具或治疗靶点（Magnusdottir et al., 2017; von Frieling et al., 2018）。虽然对GERD患者菌群的研究取得了一些进展，但之前的研究大多集中在食管和胃内的微生物。研究表明，正常人食管菌群主要由厚壁菌门中的革兰氏阳性链球菌组成（Hunt and Yaghoobi，2017；Deshpande et al., 2018）。然而，研究发现GERD患者食管内以拟杆菌门、变形菌门和梭杆菌门中的革兰氏阴性厌氧菌和微量需氧菌为主（Yang et al.，2009；Yu et al.，2019）。此外，慢性炎症已被证明在多种胃肠道疾病（如BE和食管癌）的发展中发挥作用，而慢性炎症引起的肠道菌群变化则进一步加速疾病的发生和发展（Ghoshal et al.，2012）。脂多糖（LPS）是革兰氏阴性菌外膜的重要组成部分，可能通过诱导NF-κB的表达来促进组织炎症。在动物模型中，高脂饮食通过调节肠道菌群上调炎症信号通路中的 IL-8/CXCL1 来促进 BE 进展为食管癌（Munch et al., 2019），证实了肠道菌群在疾病进展中的作用。GERD 患者肠道菌群的组成和功能仍在很大程度上未知，并且已经证明肠道菌群通过将宿主营养物质转化为
肠道菌群在自身免疫性疾病中的新兴作用
累积研究表明，肠道菌群通过与宿主进行复杂的相互作用，在自身免疫性疾病的发作中起关键作用。本综述旨在全面概述有关肠道菌群与自身免疫性疾病之间关系的现有文献，从而阐明了肠道微生物群，宿主和免疫系统之间的复杂相互作用。Furthermore, we aim to summarize the impacts and potential mechanisms that underlie the interactions between the gut microbiota and the host in autoimmune diseases, primarily focusing on systemic lupus erythematosus, rheumatoid arthritis, Sjögren ' s syndrome, type 1 diabetes mellitus, ulcerative colitis and psoriasis.本次审查将强调基于肠道微生物群作为自身免疫性疾病的创新辅助疗法的临床意义和潜在的干预措施应用。
噬菌体在冰河流生物膜上微生物细菌群落的作用
病毒调节微生物群落的多样性和活性。然而，对它们在流细菌生物膜群落结构中的作用知之甚少。在这里，我们介绍了有关瑞士三种横向冰山的各种流病毒群落多样性和组成的见解。冰期流的特征是极端的环境条件，包括近冻结温度和超寡聚营养。这些条件选择了几个但适应良好的细菌进化枝，这些进化枝在生物膜群落中占主导地位，并通过微生物菌株占据了壁ni。我们使用元基因组测序揭示了这些流中各种生物膜病毒组合。在不同的流量和流中，病毒群落组成与细菌宿主的组成紧密结合，细菌宿主的宿主是由一般高的宿主特定城市强调的。将噬菌体相互作用的预测与辅助代谢基因（AMG）相结合，我们确定了通过感染微生变化枝成员的噬菌体共享的特定AMG。我们的工作为更好地理解细菌之间的复杂相互作用和噬菌体在一般情况下的噬菌体和噬菌体之间提供了一步。
粪便菌群与炎症性肠病的肠外表现有关
摘要简介：大部分炎症性肠病患者（IBD）经历了胃肠道外IBD相关的炎症状况，称为肠外表现（EIM），进一步降低了生活质量，在极端情况下，可能会危及生命。EIMS的发病机理仍然未知，尽管肠道菌群改变是IBD患者的众所周知的特征，但其与EIMS的关系仍然很少研究。这项研究旨在比较有没有EIM的IBD患者的肠道菌群。方法：该研究中总共包括131名IBD患者，其中86例具有EIMS（IBD-EIM）史，而45例没有（IBD-C）。粪便样品接受了16S rRNA测序。放大序列变体（ASV）映射到SILVA数据库。比较了IBD-EIM和IBD-C之间的多样性指数和距离矩阵。使用自定义多重模型统计分析方法鉴定了差异丰富的ASV，并使用稀疏相关性（SPARCC）（SPARCC）鉴定了共同相关细菌的模块，并且与患者EIM状态有关。结果：IBD患者和EIMS患者表现出疾病活性增加，体重指数，粪便钙骨蛋白钙蛋白酶水平升高以及循环单核细胞和中性粒细胞。微生物学上，IBD-EIM比IBD-C（Mann-Whitney's Test，p = .01）和独特的粪便微生物群组成（方差的置换多变量分析；加权Unifrac，r 2 = 0.018，p = .01）。共有26个ASV在IBD-EIM和IBD-C之间表现出不同的相对丰度，包括减少的Agathobacter和Blautia和IBD-Eim组中的Eggerthella lenta增加。SPARCC分析确定了27个细菌共同关联模块，其中3个与EIM（逻辑回归，p <.05）呈负相关，其中包括重要的健康相关细菌，例如Agathobacter和Agathobacter和Faecalibacterium。结论：EIMS IBD患者的粪便菌群与没有EIM的IBD患者不同，对于EIM发病机理可能很重要。
母亲肠道菌群在母亲和后代的健康中
由于怀孕期间的生理改变，母体肠道菌群在代谢过程后发生变化。最近的研究表明，孕产妇肠道微生物群与妊娠期间子宫内的免疫微环境密切相关，并且在特定妊娠并发症中起着至关重要的作用，包括先兆子痫，胎儿糖尿病，早产，出生和经常性的流产。其他一些证据还表明，异常的母体肠道菌群通过母亲和胎儿之间的免疫比对，增加了后代各种疾病的风险，例如过敏和神经发育障碍。益生菌和高纤维饮食是预防母亲和胎儿疾病的有效发明。在这篇综述中，我们总结了孕产妇肠道菌群在妊娠并发症发展中的作用，以及从免疫学的角度来看，后代的健康状况，这可能为母亲和后代的健康管理提供新的治疗策略。
接种微生物菌群可增加土壤微生物多样性，改善缺水缺氮条件下番茄的农艺性状
微生物刺激素可作为生物和非生物胁迫保护剂和生长促进剂，在气候变化的背景下，在农业中也变得越来越重要。寻找能够在各种田间条件下帮助减少化学投入的新产品是新的挑战。在这项研究中，我们测试了两种具有互补作用模式的微生物生长促进剂（Azotobacter chroococcum 76A 和 Trichoderma afroharzianum T22）的组合是否可以帮助番茄适应最佳水和氮需求减少 30% 的情况。在最佳水和营养条件下，微生物接种物可提高番茄产量 (+48.5%)。此外，微生物应用提高了胁迫条件下的叶片水势 (+9.5%)，降低了叶片整体温度 (-4.6%)，并增加了地上部鲜重 (+15%)，表明该组合可在有限的水和氮供应下充当植物水分关系的积极调节剂。在胁迫条件下施用 A. chroococcum 76A 和 T. afroharzianum T22 可显著增加根际微生物种群，这表明这些接种物可增强土壤微生物丰度，包括本地有益微生物的丰度。采样时间、有限的水和氮状况以及微生物接种均会影响根际土壤中的细菌和真菌种群。总体而言，这些结果表明，所选微生物群落可作为植物生长促进剂和胁迫保护剂，可能通过土壤微生物多样性和相对丰度的功能性变化触发适应机制。
肠道菌群及其可能的影响
简介：肠道菌群对人体健康非常重要，因为它除了有助于消化食物外，还具有免疫功能，可以防止有害病原体在肠道中滋生。微生物群由各种微生物组成，在人类出生后不久就形成。然而，它的失衡会对宿主产生影响，例如有利于病理发生的代谢紊乱。目的：描述肠道菌群失衡如何引发 2 型糖尿病。方法：这是一篇综合性文献综述，分析了比较肠道菌群与 2 型糖尿病发展之间可能存在的关系的科学研究。结果与讨论：研究发现，儿童时期不当使用抗生素，甚至营养不良都可能影响菌群失衡，这直接导致某些细菌门类发生变化并因此定植。结论：肠道菌群的组成可能根据个体的出生、生活方式等因素而呈现出微生物的种类。因此，微生物群失衡会有利于某些引起代谢紊乱的细菌种类，并进而导致 2 型糖尿病的出现。
肠道菌群对生殖功能的影响
肠道微生物群对生理过程的影响正在迅速在全球引起关注。尽管研究不足，但仍有可用的数据证明了肠道微生物群的串扰，以及该轴对繁殖的重要性。本研究回顾了肠道菌群对繁殖的影响。此外，还提出了肠道菌群调节男性和女性繁殖的可能机制。数据库，包括Embase，Google Scholar，PubMed/Medline，Scopus和Web of Science。的发现表明，肠道菌群通过调节类固醇性激素，胰岛素敏感性，免疫系统和性腺微生物群的循环水平来促进性腺功能。肠道菌群还改变了ROS的产生和细胞因子积累的激活。总而言之，可用的数据证明了肠道微生物群轴的存在，该轴对性腺功能的作用。然而，大多数数据是动物研究的诱人证据，而人类数据的数据很大。因此，使用动物模型验证实验研究报告的人类研究很重要。
ME/ ... div>的胃肠道菌群
与其他感染一样，SARS-COV-2感染也会触发急性后感染综合征（PAIS），该感染通常会发展为肌肌脑膜炎/慢性疲劳综合征（ME/CFS）。ME/CFS是一种严重的多系统疾病，尚未建立特定的诊断标记或治疗概念。尽管有许多迹象表明了感染后神经系统，免疫学，内分泌和代谢偏差，但确切的原因和病理生理学仍然尚不清楚。迄今为止，数据很少，胃肠道菌群的组成和功能的变化已成为与免疫学和炎症途径相关的潜在影响变量，ME/CFS的变化。据推测，这种营养不良可能导致肠道屏障功能障碍，氧化应激增加的微生物成分的易位以及ME/CFS的发展或进展。在这篇综述中，我们详细讨论了有关胃肠道微生物群及其在ME/CFS中的微生物介体的改变的发现。批判性观察时，目前尚无证据表明微生物群的变化与ME/CFS的发展之间的因果关系。大多数研究都描述了定义较差的患者人群中的关联，通常结合了各种临床表现，例如肠易激综合征和与ME/CFS相关的疲劳。然而，利用与其他胃肠道疾病的类比，有可能制定旨在调节肠道菌群和/或其代谢物作为ME/CFS和其他PAIS的潜在治疗方法的策略。应在临床试验中进一步研究这些策略。