图4。砷矿甲基转移酶(ARSM)基因在鳟鱼湖,钢铁湖和基拉尼湖的周围DNA中检测到了PCR,使用靶向该基因保守区域的退化引物。从三个南部海湾声音湖中收集了植物,砷湖:鳟鱼湖(<1 ppb),钢铁湖(〜2 ppb)和基拉尼湖(〜20 ppb)。DNA以不同的浓度在聚合酶链反应(PCR)中用作模板,以不同的浓度:1 ng/ul,2 ng/ul和4 ng/ul。用两个引物对之一进行 PCR:与16S rRNA或ARSM基因互补。琼脂糖凝胶电泳。该图显示了用荧光染料,分子量(MW)梯子和可变标签可视化的凝胶。16S rRNA引物预计将导致111个碱基对(BP)的PCR产物,并且ARSM引物(MF1和MR2)预计将导致302至346 bp之间的PCR产物。
摘要:蜗牛养殖(Helicanture)在世界许多地方被认为是重要的农业部门,因为它在动物蛋白的生产中作用。然而,对蜗牛研究全球研究状况的整体图片进行了更少的研究。我们旨在根据使用RSTUDIO软件在1949年至2023年间发表的有关蜗牛研究的总共212篇研究文章进行文献评估。关于蜗牛研究的研究与年数(r 2 = 0.474; y = 0.1162x – 228.03)呈正相关,这表明该领域正在受到全球关注。在出版和引文数字方面,最有生产力的国家是美国,而出版物最多的组织是日本的九州大学。“ Snail/s”是最相关的主题的关键字,软体动物研究杂志是主要的学术来源,A,Staikou和Neiman M是蜗牛研究中最有影响力的作者。生产,繁殖,生长,生物柴油,腹足类和粮食安全是该领域最重要的关键字热点。这些发现可以帮助科学家和其他利益相关者更好地理解蜗牛研究的方向,这对于未来的调查和该领域的农业实践很有价值。关键词:文献计量学,腹足动物,旋转,rstudio,可视化分析简介
hal是一个多学科的开放访问档案,用于存款和传播科学研究文件,无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构,也可能来自公共或私人研究中心。
。CC-BY 4.0国际许可证可永久提供。是作者/资助者,他已授予Medrxiv的许可证,以显示预印本(未通过PEER REVIVE的认证)Preprint preprint the本版本的版权所有者于2025年2月3日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.01.25321522 doi:medrxiv preprint
。CC-BY 4.0国际许可证可永久提供。是作者/资助者,他已授予Medrxiv的许可证,以显示预印本(未通过PEER REVIVE的认证)Preprint preprint the本版本的版权所有者于2025年2月3日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.01.25321522 doi:medrxiv preprint
7。Abiona Ja。等。 “对来自白化病和正常皮肤的非洲巨型蜗牛(Archachatina Marginata)对某些细菌分离株的抑制活性的比较评估”。 埃塞俄比亚环境研究与管理杂志6.2(2013):177-181。Abiona Ja。等。“对来自白化病和正常皮肤的非洲巨型蜗牛(Archachatina Marginata)对某些细菌分离株的抑制活性的比较评估”。埃塞俄比亚环境研究与管理杂志6.2(2013):177-181。
染色体重排可导致生殖障碍的耦合,但它们是否以及如何促成物种形成的完成仍不清楚。 Littorina 属的海洋蜗牛反复在分离多个倒位排列的种群之间形成杂交区,为研究它们的屏障效应提供了机会。在这里,我们分析了适应瑞典岛屿不同海浪暴露条件的两种生态型 Littorina fabalis(“大”和“矮”)之间的杂交区中的 2 条相邻横断面。应用全基因组测序,我们发现 17 条染色体中的 9 条有 12 个推定的倒位。其中 9 个推定的倒位在两个生态型之间达到近乎差异固定,并且都处于强烈的连锁不平衡状态。这些倒位覆盖了 20% 的基因组,并携带 93% 的不同单核苷酸多态性 (SNP)。两个横断面的双峰杂交区表明,两种生态型的 Littorina fabalis 在接触后仍保持其遗传和表型完整性。双峰性反映了倒位趋势之间的强耦合和屏障效应在整个基因组中的扩展。人口统计学推断表明,耦合发生在异地时期,并在二次接触后维持了 1,000 代以上。总体而言,这项研究表明,多个染色体倒位的耦合导致了强烈的生殖隔离。值得注意的是,2 个假定的倒位与与近亲物种(Littorina saxatilis)的生态型差异相关的倒置基因组区域重叠,这表明具有相似结构变体的相同区域反复促进了不同物种的生态型进化。
基于自旋柱的DNA纯化试剂盒(例如Qiagen dneasy血液和组织试剂盒)一直是从包括腹足动物在内的各种生物体中提取基因组DNA的最爱。如前所述,这些套件的缺点是从某些样本类型(例如存储在乙醇中的样本类型)中可以实现的GDNA的数量和质量较低,但是在许多其他情况下,从其他样本类型中提取的GDNA可以很好地工作。可用的商业自旋柱套件的优点(例如Qiagen和Zymo品牌产品)是此过程中速度,易用性和缺乏有害化学物质的速度。蜗牛矢量工作组建议可以有效地使用几种基于自旋的柱子的试剂盒和方法,其中可以从新鲜组织中取出少量组织(例如部分头部脚),以避免过载和阻断旋转柱,并避免大量抑制物质的含量(请参阅Adema 2021)。此外,对于基于PCR的应用程序(甚至是扩增子面板),DNA质量和数量较低的DNA仍然适合使用,这些提供了一个不错的选择。注意,但是,使用Qiagen B&T旋转柱套件提取的生物胶质蜗牛的基因组DNA产生了具有出色读取长度的PACBIO组件(Bollmann,OSU)。
我们已经对Potamopyrgus estuarinus和Potamopyrgus kaitunuparaoa进行了测序,组装和分析的核和线粒体基因组和转录组,这是新西兰人的两个Prosobranch Snail物种,它们跨越了从河口到新淡水。这两个物种是淡水物种的最接近的亲属,potamopyrgus antipodarum是研究性别,宿主 - 寄生虫协同进化和生物侵入性的模型,因此为理解其异常生物学提供了关键的进化环境。P. esuarinus和P. kaitunuparaoa基因组的大小和整体基因含量非常相似。对基因组含量的比较分析,认为这两个物种具有涉及减数分裂和精子功能的几乎相同的基因,包括七个具有减数分裂特异性功能的基因。这些结果与这两个物种的强制性再生产是一致的,并为对抗杀虫假单胞菌的未来分析提供了一个框架,该物种既包含义务性的性和无性无性谱系,每个物种分别源自性祖先。全基因组多基因的系统发育分析表明,Kaitunuparaoa可能是最接近抗植物的。尽管如此,我们表明,埃斯图拉林和P. kaitunuparaoa之间存在相当大的渗透。该渗入不会扩展到线粒体基因组,该基因组似乎是雌雄同体和kaitunuparaoa P. estuarinus和P. kaitunuparaoa之间杂交的障碍。核编码基因,其产物在关节线粒体核酶复合物中的作用表现出相似的非渗透模式,这表明线粒体和核基因组之间的不兼容性可能阻止了这两种物种之间更广泛的基因流动。
根据从日本东北岛东北部的北太平洋地区收集的三个标本,描述了新的蜗牛鱼类careproctus io。新物种可以通过以下特征与同类物区分开:椎骨40-42;背鳍射线36或37;肛门鳍射线30;胸鳍深深地被28或29射线切成骨,下叶到达肛门鳍起源;大骨盆盘34.2%–34.5%HL(10.3%–10.9%SL);牙齿在两个下颌上都伸直,内牙内牙弱三叶或肩膀;头膜孔图2-6-7-2,下巴毛孔配对;胸鳍底部上方的g缝;身体鲜红色,生命中没有变化。CareproctusKrøyer的种类,1862年通常比肛门鳍射线较少的胸膜射线较少,尽管在这两个鳍片中,包括当前新物种在内的一些最近描述的物种(包括当前的新物种)都具有相似的射线计数。讨论了各种蜗牛,属以及所讨论的careproctus的通用限制,研究了此类计数以及骨盆盘大小之间的关系。