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World File Search System表达方法
使用元词，基因组学和异源表达方法的组合
自2005年FDA批准Sorafenib以来，口服多次激酶抑制剂已成为转移性肾细胞癌（MRCC）的基石治疗。2021年更新的欧洲泌尿外科协会肾细胞癌指南建议将免疫检查点抑制剂加上口服酪氨酸激酶抑制剂（TKI）组合，以对MRCC进行第一线治疗。相对于单独的口服TKI，这种方法在无进展和整体生存（OS）方面取得了可观的增长。对于无法服用或耐受检查点抑制剂的患者以及对免疫疗法反应的患者，仍考虑口服TKI单一疗法。MRCC患者中的1个口腔TKI治疗序列的研究很少2，可能构成疾病进展的预后标志。3，4
10-差分表达和丰度
基准研究Scrna-Seq中的差异表达方法：Squair，J.W.，Gauter，M.，Kathe，C。等。（2021）自然通信https://doi.org/10.1038/s41467-021-25960-2
真菌基因组编辑新技术
■知识产权：Tokugan 2022-196304“生产基因组编辑的细胞和促进杂交的方法”，Tokugan 2024-057389“核酸裂解酶，核酸，矢量，矢量，辅助套件，用于修改核酸和核酸的方法3。碎片，套件和方法用于产生基因工程的真核细胞”，未发表的应用，Tokugan 2024-057383“产生突变体，基因表达方法和真核生物细胞的方法”，未发表的应用，■公立资助的项目的名称，使用的名称：Young Scientist（a）：2017-2019，挑战2.2022.202 Ental Research b：2023-2027
基因组编辑——Alt-R™ CRISPR-Cas9 系统
图 1. Alt-RTM CRISPR-Cas9 系统核糖核蛋白的表现优于其他瞬时 CRISPR-Cas9 编辑方法。人类、小鼠或大鼠的 Alt-R CRISPR HPRT 对照 crRNA 与 Alt-R CRISPR-Cas9 tracrRNA 复合。将所得复合物与 Cas9 表达质粒、Cas9 mRNA 或 Cas9 RNP（包含与 crRNA 和 tracrRNA 预复合的 Alt-R Sp Cas9 核酸酶 3NLS）一起转染到人类 (HEK-293)、小鼠 (Hepa1- 6) 或大鼠 (RG2) 细胞系中。使用 T7EI 测定法进行的突变检测表明，Alt-R CRISPR-Cas9 RNP 的表现优于其他瞬时 Cas9 表达方法，并且与稳定表达 S. pyogenes Cas9 的参考 HEK-293–Cas9 细胞的表现相当。
miR-218-2通过补体成分3-依赖于突触囊泡释放的调节
microRNA-218（miR-218）已与几种认知的神经退行性和神经精神疾病有关。但是，miR-218是否在认知功能中起着直接作用仍然未知。在这里，使用miR -218敲除（KO）小鼠模型和海绵/过表达方法，我们表明miR -218-2但不是mir -218-1可以双向调节小鼠的上下文和空间记忆。此外，miR -218-2缺乏诱发的形态和突触前神经递质在海马中释放，以损害长期增强。结合了RNA测序分析和荧光素酶报告基因测定法，我们确定了补体组合3（C3）作为海马中miR-218的主要靶基因，以调节突触前功能。最后，我们证明了在miR中恢复C3活性-218-2 KO小鼠可以挽救突触和学习缺陷。因此，mir -218-2通过C3在小鼠的认知功能中起着重要作用，这可能是对miR -218相关神经元疾病的有缺陷认知的机制。
使用软执行器网络对软水下操纵器的基于学习的外观
摘要 - 与环境对象的互动可以引起外部感受和本体感受信号的重大变化。然而，水下软操作器中外部感受传感器的部署遇到了许多挑战和约束，从而对其感知能力施加了限制。在本文中，我们提出了一种基于学习的新型表达方法，该方法利用内部本体感受信号并利用软执行器网络（SAN）的原理。def> div>趋势倾向于通过水下软操作器中的sans传播，并且可以通过本体感受传感器检测到。我们从传感器信号中提取特征，并开发完全连接的神经网（FCNN）基于分类器以确定碰撞位置。我们已经构建了一个培训数据集和一个独立的验证数据集，目的是培训和验证分类器。使用独立的验证数据集以97.11％的精度识别出碰撞位置的实验结果，该碰撞位置在水下软机器人的感知和控制范围内表现出潜在的应用。
讲师。成员AyşenurEminoğlu -Avisis
AyşenurEminoğlu博士讲师。 Member E-Mail: aysenur.eminoglu@erdogan.edu.tr Business Phone: +90 464 223 4093 Internal: 1842 Address: Recep Tayyip Erdoğan University Faculty of Arts and Literature Faculty: 4 Biology Department 53100 Lantern/Rize International Researcher IDs Schosid: 86760707070526917342984 Orcıd: 0000-0003-1693-6332 Publons / Web of Science研究人员：A-7495-2016Scopusıd：56707465700达特茅斯学院，泰耶工程学院，化学和生化工程 /能源技术，美国硕士2010-2012雷德·泰耶普·埃尔多安大学，科学学院，阿纳比尔斯，生物学系 /分子生物学，土耳其生物学，2003年 - 2004年数学现场教育，土耳其本科生1999年 - 2003年塞索克大学，艺术与科学学院，生物学，土耳其外语英语，C1高级证书，课程和培训职业课程，DNAMarkır在植物生物技术学和基因表达方法中的应用，Ankara University biotechnology，Ankara University Institute，2004改善嗜热细菌乙醇产生的代谢（英语），黑海技术大学，科学研究所，生物学/ molkeular Biology，2018 Master，Anoxybacillus flavithermus afcda afcda GenerAyşenurEminoğlu博士讲师。Member E-Mail: aysenur.eminoglu@erdogan.edu.tr Business Phone: +90 464 223 4093 Internal: 1842 Address: Recep Tayyip Erdoğan University Faculty of Arts and Literature Faculty: 4 Biology Department 53100 Lantern/Rize International Researcher IDs Schosid: 86760707070526917342984 Orcıd: 0000-0003-1693-6332 Publons / Web of Science研究人员：A-7495-2016Scopusıd：56707465700达特茅斯学院，泰耶工程学院，化学和生化工程 /能源技术，美国硕士2010-2012雷德·泰耶普·埃尔多安大学，科学学院，阿纳比尔斯，生物学系 /分子生物学，土耳其生物学，2003年 - 2004年数学现场教育，土耳其本科生1999年 - 2003年塞索克大学，艺术与科学学院，生物学，土耳其外语英语，C1高级证书，课程和培训职业课程，DNAMarkır在植物生物技术学和基因表达方法中的应用，Ankara University biotechnology，Ankara University Institute，2004改善嗜热细菌乙醇产生的代谢（英语），黑海技术大学，科学研究所，生物学/ molkeular Biology，2018 Master，Anoxybacillus flavithermus afcda afcda GenerMember E-Mail: aysenur.eminoglu@erdogan.edu.tr Business Phone: +90 464 223 4093 Internal: 1842 Address: Recep Tayyip Erdoğan University Faculty of Arts and Literature Faculty: 4 Biology Department 53100 Lantern/Rize International Researcher IDs Schosid: 86760707070526917342984 Orcıd: 0000-0003-1693-6332 Publons / Web of Science研究人员：A-7495-2016Scopusıd：56707465700达特茅斯学院，泰耶工程学院，化学和生化工程 /能源技术，美国硕士2010-2012雷德·泰耶普·埃尔多安大学，科学学院，阿纳比尔斯，生物学系 /分子生物学，土耳其生物学，2003年 - 2004年数学现场教育，土耳其本科生1999年 - 2003年塞索克大学，艺术与科学学院，生物学，土耳其外语英语，C1高级证书，课程和培训职业课程，DNAMarkır在植物生物技术学和基因表达方法中的应用，Ankara University biotechnology，Ankara University Institute，2004改善嗜热细菌乙醇产生的代谢（英语），黑海技术大学，科学研究所，生物学/ molkeular Biology，2018 Master，Anoxybacillus flavithermus afcda afcda Gener
通过预复合的 CRISPR-Cas9/sgRNA 核糖核蛋白避开细胞抑制 RNA，实现高效的 ssODN 介导靶向
结合 CRISPR-Cas9 技术和单链寡脱氧核苷酸 (ssODN)，可以在诱导性多能干细胞 (iPSC) 中的目标基因组位点引入特定的单核苷酸改变；然而，与缺失诱导相比，ssODN 敲入频率较低。尽管已报道了几种 Cas9 转导方法，但是 CRISPR-Cas9 核酸酶在哺乳动物细胞中的生化行为仍有待探索。在这里，我们研究了影响 Cas9 体外裂解活性的内在细胞因素。我们发现细胞内 RNA（而不是 DNA 或蛋白质部分）会抑制 Cas9 与单向导 RNA (sgRNA) 结合并降低酶活性。为了防止这种情况，与 Cas9 过表达方法相比，在递送到细胞之前预复合 Cas9 和 sgRNA 可产生更高的基因组编辑活性。通过优化预复合核糖核蛋白和ssODN的电穿孔参数，我们实现了高达70%的单核苷酸校正效率和高达40%的loxP插入效率。最后，我们可以用C2等位基因替换HLA-C1等位基因，以生成组织相容性白细胞抗原定制编辑的iPSC。
Omar Fawzi，PaulFermé。广播频道编码：算法方面和非信号辅助。 IEEE信息理论交易，2024，70 智能原型的霍斯学学习 使用元词，基因组学和异源表达方法的组合
我们解决了为经典广播渠道编码的问题，该问题需要通过在广播频道上发送固定数量的消息来最大化成功概率。对于[1] a（1- e-e-1）在多项式时间内运行的[1] A（1- e-e-1）中发现的Barman和Fawzi的，Barman和Fawzi 表明，实现严格的更好近似值率是NP-HARD。 此外，这些算法结果是它们在对点对点通道的不信号辅助方面建立的局限性的核心。 自然要询问广播通道是否存在类似的结果，并利用通道编码问题的近似算法与非信号辅助能力区域之间的链接。 在这项工作中，我们在广播渠道的算法方面和非信号辅助助理区域做出了一些贡献。 对于确定性广播渠道的类别，我们描述了在多项式时间内运行的A（1- e -e -1）2- approximation算法，并且我们表明该类别的容量区域在有或没有非信号辅助的情况下相同。 最后，我们表明，在价值查询模型中，对于一般广播通道编码问题，我们无法在多项式时间内实现比ω1√m更好的近似值，其中M的大小是通道的一个输出之一。，Barman和Fawzi 表明，实现严格的更好近似值率是NP-HARD。 此外，这些算法结果是它们在对点对点通道的不信号辅助方面建立的局限性的核心。 自然要询问广播通道是否存在类似的结果，并利用通道编码问题的近似算法与非信号辅助能力区域之间的链接。 在这项工作中，我们在广播渠道的算法方面和非信号辅助助理区域做出了一些贡献。 对于确定性广播渠道的类别，我们描述了在多项式时间内运行的A（1- e -e -1）2- approximation算法，并且我们表明该类别的容量区域在有或没有非信号辅助的情况下相同。 最后，我们表明，在价值查询模型中，对于一般广播通道编码问题，我们无法在多项式时间内实现比ω1√m更好的近似值，其中M的大小是通道的一个输出之一。表明，实现严格的更好近似值率是NP-HARD。此外，这些算法结果是它们在对点对点通道的不信号辅助方面建立的局限性的核心。自然要询问广播通道是否存在类似的结果，并利用通道编码问题的近似算法与非信号辅助能力区域之间的链接。在这项工作中，我们在广播渠道的算法方面和非信号辅助助理区域做出了一些贡献。对于确定性广播渠道的类别，我们描述了在多项式时间内运行的A（1- e -e -1）2- approximation算法，并且我们表明该类别的容量区域在有或没有非信号辅助的情况下相同。最后，我们表明，在价值查询模型中，对于一般广播通道编码问题，我们无法在多项式时间内实现比ω1√m更好的近似值，其中M的大小是通道的一个输出之一。
摄入单个引导 RNA 可通过激活 CRISPR 来诱导基因过度表达并延长秀丽隐杆线虫的寿命
秀丽隐杆线虫是一种用于研究发育和衰老遗传学的多功能模型生物，通过给线虫喂养表达特定 dsRNA 的细菌可以抑制其基因表达。之前已证实通过常规转基因技术过表达缺氧诱导因子 1 ( hif-1 ) 或热休克因子 1 ( hsf-1 ) 可延长线虫寿命。然而，目前尚不清楚其他基因过表达方法是否可行，尤其是随着基于 CRISPR 的技术的出现。本文中，我们表明，给经过基因改造以稳定表达 Cas9 衍生的合成转录因子的秀丽隐杆线虫喂养表达启动子特异性单向导 RNA (sgRNA) 的细菌也可以激活基因表达。我们证明，通过摄取针对 hif-1 或 hsf-1 各自启动子区域的 sgRNA 激活 CRISPR 可增加基因表达并延长秀丽隐杆线虫的寿命。此外，作为旨在使用 CRISPR 激活秀丽隐杆线虫的未来研究的计算机资源，我们提供了预测的启动子特异性 sgRNA 靶序列，用于超过 13,000 个秀丽隐杆线虫基因，并具有实验定义的转录起始位点。我们预计本文描述的方法和组件将有助于促进全基因组基因过表达研究，例如，通过将表达 sgRNA 的细菌喂给线虫来诱导转录，以识别衰老或其他感兴趣的表型的调节因子。