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World File Search System趋化性
改变了蛋白质动力学和与神经变性相关的UCHL1突变体中的更具反应性催化性半胱氨酸
在早期发作神经退行性患者中检测到的泛素C末端水解酶L1（UCHL1）的突变体UCHL1 R178Q显示出比野生型UCHL1（UCHL1 WT）更高的催化活性。位于活动地点袋中，精氨酸是相互作用网络的一部分，该网络将催化组氨酸保持在不活动的排列中。然而，尚不清楚glutamine取代时酶促激活的结构基础和机制。我们将X射线晶体学，蛋白质核磁共振（NMR）分析，酶动力学，共价抑制分析和生物物理测量结果结合在一起，以描述突变体中的激活因子。虽然UCHL1 R178Q的晶体结构显示出催化残基和活性位点的相同排列，但该突变在化学环境中引起了广泛的变化和30多个残基的动态，有些是距突变部位的15 a远。在HSQC光谱中的主链酰胺谐振的显着拓宽表明，几种残基的主链动力学变化与溶液小角度X-射线散射（SAXS）分析一致，这表明蛋白质动力的总体增加。酶动力学表明，尽管底物的底物略有弱，但激活是由于k猫的效应所致。与此相一致，与野生型酶相比，突变体与底物衍生的不抑制剂UB-VME的反应中显示了更高的二阶速率常数（K INACT /K I），与野生型酶相比，这是一种观察到的，表明在突变剂中具有更复发性的催化性催化性。2024 Elsevier Ltd.保留所有权利。一起，观察结果强调了结构可塑性是促进酶动力学行为的因素，可以通过突变效应调节。
脂质纳米粒子的物理化学趋向性和亲和性部分靶向性相结合可增强器官靶向性
摘要：目前已出现两种将纳米粒子靶向特定器官和细胞类型的方法：亲和部分靶向和物理化学趋向性。在这里，我们直接比较和结合使用旨在靶向肺部的静脉 (IV) 脂质纳米粒子 (LNP)。我们利用 PECAM 抗体作为亲和部分，利用阳离子脂质作为物理化学趋向性。这些方法产生的肺摄取量几乎相同，但 aPECAM LNP 显示出更高的内皮特异性。结合这些靶向方法的 LNP 的肺摄取量比单独使用任何一种方法高 2 倍以上，并且显著增强了上皮摄取量。为了确定肺部吸收是否是因为肺部是静脉注射下游的第一个器官，我们比较了静脉注射和颈动脉内 (IA) 注射，发现 IA 联合靶向 LNP 在首过器官大脑中达到每克注射剂量的 35% (%ID/g)，是报道中最高的。因此，结合亲和部分和物理化学策略可提供单独任何一种靶向方法都无法实现的好处。关键词：肝外递送、物理化学、抗体介导、肺靶向、细胞类型表达
2025; 15（8）：3316-3331。 doi：10.7150/thno.100793研究论文PBRM1缺乏效率通过染色体coscectibil
理由：据报道，肿瘤细胞表观遗传学，尤其是染色体可及性，与肿瘤免疫景观和免疫疗法密切相关。但是，确切的机制仍然未知。方法：使用全外活体测序分析13个用PD1免疫疗法治疗的结直肠肿瘤样品。使用测序（ATAC-SEQ）和RNA测序进行转座酶可访问的染色质测定法用于检测肿瘤细胞的染色体可及性状态和筛查调节途径。结果：Polybromo-1（PBRM1）是12个与免疫疗法敏感性相关的体细胞突变频率最高的基因之一。PBRM1/PBRM1结直肠癌的缺乏症促进了体内和体外微环境中CD8 + T和NK细胞的PD-1免疫疗法敏感性以及CD8 + T和NK细胞的趋化性。ATAC测序表明，SWI/SNF复合物的关键成分的缺失增加了肿瘤细胞中染色体可及性的增加，并通过激活NF-κB信号传导途径触发细胞因子的释放，例如CCL5和CXCL10。在BALB/C小鼠或结直肠患者衍生的肿瘤器官（PDTOS）中应用ACBL1（PRM1的ProC抑制剂）显着促进了对PD1抗体免疫疗法的敏感性。结论：我们的研究确定PBRM1/PBRM1缺乏症与结直肠癌的PD1免疫治疗敏感性呈正相关。基本的分子机制涉及调节染色体可及性，NF-κB信号通路的激活以及微环境中的免疫细胞浸润。这些发现确定了潜在的分子靶标，以增强结直肠癌的免疫疗法。
COVID-19和糖尿病：DPP4抑制可以起作用吗？COVID-19和糖尿病：DPP4抑制可以起作用吗？
一般而言，糖尿病患者在感染病毒时患有并发症的风险更高。2型糖尿病，是最常见的糖尿病类型，与过量的内脏脂肪组织诱导的低年级慢性炎症相关。这种炎症状态影响稳态葡萄糖调节和周围胰岛素敏感性。慢性高血糖和炎症会引起异常和无效的免疫反应。这种复杂而多因素的途径包括动员多形核白细胞的动员，趋化性和吞噬活性，细胞因子的分泌下降，例如Ilthleukin-1（IL-1）（IL-1），IL-6和IL-6的分泌以及对脂肪糖的响应，抑制肿瘤的肿瘤，thecllys and tumor necryc and cllys necrass（Tnf-cell）（TNF）（TNFNF）。免疫球蛋白。最新的2019年冠状病毒病（Covid-19）的数据是由2019年新颖的冠状病毒（2019-NCOV）引起的，即糖尿病与高龄有关，是不良结果的主要风险因素。糖尿病约占重症监护病房（ICU）的20％，该糖尿病是根据对中国武汉的小同类队列的早期分析[1]。来自意大利的更多数据显示，死于严重急性呼吸道冠状病毒2（SARS-COV-2）的人中有超过三分之二的人患有糖尿病[2]。在最近的两次冠状动脉疫情中，糖尿病患者的死亡率和并发症的较高风险相似，SARS影响了8000多人，主要是2002年初在亚洲，以及中东呼吸综合征（MERS），以及在2012年在2012年在Saudi Arabia中影响更多的人。糖尿病是垂死或发展的严重并发症的优势比冠状病毒（MERS-COV）感染时，同时发生的持续时间为2.47至7.24。
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PING CHEN 葡萄糖-PTS 调节甘油代谢和过氧化氢介导的血链球菌竞争 FABIANA ROGLIERO 新型聚氨酯基聚合物材料在运动护齿制造中的生物相容性 ANH HAO DANG 重新定位 FDA 批准的抗抑郁药 2-PCPA 以治疗牙周炎 ADRIAN REQUEJO 小鼠脑部感染新生隐球菌后星形胶质细胞的强效活化 ANJALI SONI 利用虚拟和增强现实技术彻底改变正畸教育、诊断和治疗计划 EDISON N. TRAN CRISPR-Cas 系统可以调节 PGN_1547：牙龈卟啉单胞菌 ATCC 33277 中的一种新的假设毒力因子 BEN L. OFRI 了解心理弹性对医疗干预期间患者幸福感的影响DANNIEL PHAM 血链球菌葡萄糖-PTS 的遗传特征，检测其竞争力和适应度 THOMAS DUARTE 使用机器学习和非破坏性检测来预测定制护齿套的机械性能 TUSHAR DESARAJU 探索 TLR2 信号对 TLR2-/- 小鼠生态时间序列多菌牙周感染后牙槽骨吸收的影响 ASHITHA YADA TLR2-/- 小鼠生态时间序列多菌牙周感染 (ETSPPI) 后的牙周细菌传播 GRACE ADAMS Cbp+ 变形链球菌与老年人根龋的关联 RAFAEL GARCIA 新型隐球菌葡萄糖醛酸木甘露聚糖通过抑制嘌呤能来损害小胶质细胞趋化性受体
SQ3370 是首个临床点击化学激活的癌症治疗药物，显示出对人类的安全性和跨物种的可转化性
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2023 年 3 月 29 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.03.28.534654 doi：bioRxiv preprint
无疤痕去除大型抗性岛可导致抗生素的敏感性和增加的鲍曼尼杆菌的自然转化性
摘要在基因组成方面具有巨大的多样性，包括多种推定的抗生素耐药性基因，阿巴岛是鲍曼尼杆菌杆菌多药的潜在贡献者。但是，ABAR对抗生素耐药性和细菌生理学的有效贡献仍然难以捉摸。为了解决这个问题，我们试图准确删除Abar Islands并恢复其插入站点的完整性。为此，我们设计了一种多功能无疤的基因组编辑策略。我们在最近的两个鲍曼尼菌临床菌株中形成了这种遗传修饰：分别携带19.7 kbp和86.2 kbp的Abar1和Abar1岛的菌株AB5075和菌株AYE。然后，在父母菌株及其固定衍生物之间进行抗生素敏感性。通过该岛的开放阅读框（ORF）的预测功能所预期的，抗抗性的抗抗药性在野生型和ABAR11固定的AB5075菌株之间相同。ABAR1具有25个ORF，预测抗生素类别具有抗性，并且AYE ABAR1固定衍生物显示出对多种类别的抗生素的可疑性。此外，ABARS的固化恢复了高水平的自然转化性。的确，大多数阿巴群岛都被插入与自然转化有关的通讯基因中。我们的数据表明，Abar插入有效地失活，并且还原的通信是功能性的。固化始终导致高度转换，因此很容易遗传诱因。ABAR的修改提供了对Abar获取功能的洞察力的见解。
脂质纳米颗粒以物理化学方式靶向肺部诱发凝血：机制与解决方案
脂质纳米颗粒 (LNP) 已成为行业中占主导地位的药物输送技术，有望输送 RNA 来上调或下调任何目标蛋白质。LNP 大多通过物理化学靶向技术靶向特定细胞类型或器官，其中 LNP 的脂质组成经过调整以找到具有所需趋向性的混合物。本文研究了肺趋向性 LNP，其器官趋向性源于含有阳离子或可电离脂质，从而赋予正的 zeta 电位。令人惊讶的是，这些 LNP 被发现会诱发大量血栓形成。这种血栓形成出现在肺部和其他器官中，并且研究表明，先前存在的炎症会大大加剧这种血栓形成。这种凝血是由各种含有阳离子脂质的制剂引起的，包括 LNP 和非 LNP 纳米颗粒，甚至是由不具有永久阳离子电荷的肺趋向性可电离脂质引起的。该机制依赖于 LNP 与纤维蛋白原结合并改变其构象，进而激活血小板和凝血酶。基于这些机制，设计了多种解决方案，使带正电荷的 LNP 能够靶向肺部，同时改善血栓形成。这些发现说明了必须尽早研究物理化学靶向方法的风险，并在仔细了解生物机制的情况下重新设计。
