XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System转座
LINE-1，核仁组织的北极星
长期散布的元素-1（LINE-1）反转座子是哺乳动物杂物中丰富的转座元件，代表了人类或混血基因组的几乎五分之一。他们的高拷贝数来自逆转录位置，这是一种副本和糊状机制，通过该机制，线1元素在整个镀铬中散布，并在新的Geno-Mic位置引入顺式调节元素。尽管只有相对较小的line-1元素在现代人类中仍具有跨位置活跃，从而导致遗传变异和偶尔遗传疾病，但它们的过去活性具有深远的高阶基因组结构和功能。行1元素积聚在B室（与抑制染色质相关的拟菌素结构域）中，并在核和核仁周围的建立和/或增强和聚集（Solo-Vei等人。2016; Lu等。2021）。一致地，线1元素与Giemsa/quinarcine-阳性带（g/q频段）密切相关，该带表示代表中期染色体上的杂化物（Solovei et al。2016）。在更具区域规模的情况下，行1元素经常con-
RNA编辑酶ADAR2限制L1迁移率
作用于RNA（ADARS）的摘要腺苷脱氨酶是将腺苷转化为双链RNA中的插入（RNA编辑A-TO-I）的酶。adar1和adar2先前被报道为HIV-1前病毒因素。这项研究的目的是研究HIV-1表达期间ADAR2核糖核蛋白蛋白复合物的组成。通过在表达HIV-1然后进行质谱分析的细胞中使用双标记亲和力纯化程序，我们确定了10个非核糖体ADAR2-相互作用因子。先前发现了与长的散布元素1（Line1或L1）核糖核颗粒相关的这些蛋白质的很大一部分，并调节L1逆转录子的生命周期。考虑到我们先前证明ADAR1是Line-1逆转录座子活性的抑制剂，我们研究了ADAR2是否也起着相似的功能。为了达到这个目标，我们在过表达或消融的ADAR2的细胞中进行了特定的细胞培养逆转录分析。这些实验揭示了ADAR2作为L1反转座的抑制剂的新功能。此外，我们表明ADAR2结合了基底L1 RNP复合物。
Spen 将 RNA 介导的内源性逆转录病毒沉默与 X 染色体失活联系起来
摘要 Xist lncRNA 介导 X 染色体失活 (XCI)。我们在此表明，Spen 是一种对 XCI 至关重要的 Xist 结合阻遏蛋白，它与古老的逆转录病毒 RNA 结合，发挥监视作用，将染色质沉默机制招募到这些寄生基因座。Spen 的丢失会激活小鼠胚胎干细胞中的一组内源性逆转录病毒 (ERV) 元素，从而获得染色质可及性、活性组蛋白修饰和 ERV RNA 转录。Spen 直接与 ERV RNA 结合，这些 RNA 显示出与 Xist 的 A 重复序列的结构相似性，而 Xist 的 A 重复序列是 Xist 介导的基因沉默的关键区域。ERV RNA 和 Xist A 重复序列以竞争性方式结合 Spen 的 RRM 结构域。将 ERV 插入 A 重复序列缺陷的 Xist 可挽救 Xist RNA 与 Spen 的结合，并导致顺式中严格的局部基因沉默。这些结果表明，Xist 可能利用转座因子 RNA-蛋白质相互作用来重新利用强大的抗病毒染色质沉默机制来进行性染色体剂量补偿。
SOP标题
a。第三部分：对于合成核酸，那些：（1）既不能复制也不能产生可以在任何活细胞中复制的核酸（例如，例如，寡核苷酸或其他合成核酸，这些核酸或其他不包含重复的元素或不包含DNA或RNA polna polymase的元素，（（在LD50的每公斤体重小于100纳米图的LD50上产生致命的毒素。如果将合成核酸故意转移到一个或多个人类研究参与者中并符合III-C节的标准，则本节并非豁免。b。第三部分：那些不在生物，细胞或病毒中的尚未被修饰或操纵（例如，封装成合成或天然车辆）以使其能够穿透细胞膜。 c。 III-F-3节：那些仅由来自自然界中同时存在的单个来源的精确重组或合成核酸序列组成。 d。 III-F-4节：完全由原核生物宿主的核酸组成的那些，包括其本地质粒或病毒，仅在该宿主（或同一物种的紧密相关菌株）或以良好的生理手段转移到另一个宿主时。 e。 III-F-5节：完全由来自真核宿主的核酸组成的那些，包括其叶绿体，线粒体或质粒（但不包括病毒），仅在该宿主中传播时（或同一物种的紧密相关菌株）。尚未被修饰或操纵（例如，封装成合成或天然车辆）以使其能够穿透细胞膜。c。 III-F-3节：那些仅由来自自然界中同时存在的单个来源的精确重组或合成核酸序列组成。d。 III-F-4节：完全由原核生物宿主的核酸组成的那些，包括其本地质粒或病毒，仅在该宿主（或同一物种的紧密相关菌株）或以良好的生理手段转移到另一个宿主时。e。 III-F-5节：完全由来自真核宿主的核酸组成的那些，包括其叶绿体，线粒体或质粒（但不包括病毒），仅在该宿主中传播时（或同一物种的紧密相关菌株）。f。 III-F-6节：完全由来自不同物种的DNA片段组成，这些片段通过已知的生理过程交换DNA，尽管其中一个或多个段可能是合成的等效物。g。 III-F-7节：那些获得了可转座元件的基因组DNA分子，前提是可转座元件不含任何重组和/或合成DNA。h。 III-F-8节：那些没有对健康或环境构成重大风险的人（请参见
lamivudine（3TC），一种核苷逆转录酶抑制剂，可防止突变tau转基因小鼠中存在的神经病理改变
摘要：转座元件的失调导致神经退行性疾病。先前的研究报告说，果蝇模型以及人的tauopathies中的逆转录子转录增加。在这种情况下，我们在P301S小鼠中测试了逆转录酶抑制剂，即拉米夫丁（也称为3TC），这是基于FTDP-17-TAU过表达的阿尔茨海默氏病动物模型。通过饮用水施用拉米夫丁的转基因P301S小鼠在以下典型的tauopath的组织病理学标记中显示出降低：tau磷酸化；炎症；神经元死亡；和海马萎缩。lamivudine治疗减弱了运动率（Rotarod测试）和改善的短期记忆（Y-Maze检验）。为了评估tau在逆转录中的作用，我们用含有完整的线-1序列和新霉素的盒式盒子和新霉素的盒式磁带，并与tau序列共转染HeLa细胞。line-1插入大大增加。此外，拉米夫丁抑制了线1的插入。我们的数据表明，在神经病理学的第一个症状下，通过兰米夫定给予tauopathy的进展。
心脏手术干预和术后死亡率的时机在欧洲患有严重先天性心脏缺陷的儿童中
方法和结果：这是一项基于人群的数据链接队列研究，将9个欧洲先天性异常注册机构与重要统计数据和医院数据库联系起来。为5693名Schds儿童提取了1995年至2004年出生的儿童。亚组分析。患有SCHD的儿童在中位年龄为3.6（95％CI，2.6-4.5）周时接受了第一次手术干预。在整个欧洲，大多数Schd亚型的第一次手术时间都保持一致。在生命的头5年中，患有左心脏的儿童接受了最多的心脏手术，中位数为4.4（95％CI，3.1-5.6）。年龄<1岁的儿童的30天术后死亡率范围从法洛特四局的1.1％（95％CI，0.5％–2.1％）到EBSTEIN ANOMALON的四边形到23％（95％CI，12％–37％）。术后为30天的术后致命率最高的儿童在生命的第一个月接受手术。所有SCH的总体5年生存率均为90％，除了大动脉的转座，法洛的四边形以及主动脉的缩回。
基因组学时代的基因和基因组的进化
近几十年来，我们目睹了DNA测序领域的重大技术进步和革命。DNA测序应用的范围和范围得到了极大的扩展，影响了所有生命科学学科甚至更广阔的领域（Shendure等，2017）。低成本、高通量测序带来了来自模式生物和非模式生物的大量新的分子和基因组数据，使我们能够以前所未有的规模和深度研究进化的模式和过程及其潜在机制。特别是在进化的维度上，基因组数据与复杂的计算技术和分子生物学相结合，从而改变了生物学家看待生命世界的方式，并为解答有关生物多样性和进化的长期问题提供了机会（Wen等，2019）。这里我们简要总结了一些关于基因和基因组进化的最新研究，并强调了这些研究提供的新见解。我们重点关注四个具体主题，涉及基因获得和丢失的进化、转座因子、细胞器基因组的 RNA 编辑以及主要谱系的系统发育重建，强调需要统一不同科学学科的优势和见解，以扩展我们对进化的总体理解。
跨学科研究：研究人员职业跨学科研究的动机和挑战
转座元素（TES）是寄生虫DNA序列，能够沿所有基因组的染色体移动和繁殖。可以通过靶向沉默表观遗传标记来控制它们，这可能会影响包括基因在内的相邻序列的Chro Matin结构。在这项研究中，我们使用了来自几个果蝇Melanogaster的卵巢样品和果蝇Simulans野生型菌株产生的转录组和表观基因组高吞吐量数据，以精细量化Te插入对基因RNA水平和组蛋白标记的影响（H3K9ME3和H3K9ME3和H3K4ME3）。我们的结果揭示了与梅拉·诺加斯特（D. Mela Nogaster）相比，TES对D. simulans中直源基因的表观遗传作用更强。同时，我们发现了D. mel Anogaster基因组中TE对基因H3K9me3的差异的较大贡献，这证明了Te数字周围的Te数与D. melanogaster中这种染色质标记的水平的更强相关性。总体而言，这项工作有助于理解TE在基因组中的物种特异性影响。它为TE提供的可观自然变异性提供了新的启示，这可能与适应性和进化潜力的对比有关。
先天性心脏病患者感染性心内膜炎的长期发病率
背景患者患有先天性心脏病（CHD）的患者终生患有感染性心内膜炎（IE）的高风险。IE的风险大概在不同的CHD之间有所不同，但是该地区的知识很少。在这项观察性队列研究中，使用丹麦全国登记处确定了1977年至2018年出生的所有CHD患者，并从出生之日起，直到第一次IE，移民，死亡或研究结束（2018年12月31日）。评估了来自背景人群的冠心病患者与年龄和性别匹配的对照组之间IE的比较风险。根据COX-Repressralsent 根据CHD的类型以及与IE相关的CHD类型和IE相关的因素（包括性别和相关时间变化的系数）（IE，Cyanisos，心脏假体，糖尿病，糖尿病，慢性肾脏疾病和Cardiac植入型电子设备）。 结果总共确定了23,464名冠心病患者（50.0％的男性），并与93,856个对照匹配。 在17。7年的时间随访期间，开发了217名（0.9％）CHD患者和4（0.0％）对照，相当于发病率分别为5.2（95％CI 4.6-6.0）和0.02（95％CI 0.01-0.1），分别为10,000人年。 IE的发生率最高，在三角法的患者中，心脏腔室的畸形（包括大动脉的转座，单个心脏心脏和动脉truncus Arteriosus），心室室内隔缺陷和心脏瓣膜缺陷。 与IE相关的冠心病患者中的因素包括男性性别，氰化物，心脏假体，慢性肾脏疾病和心脏植入电子设备。 （Am Heart J 2023; 259：9-20。）根据CHD的类型以及与IE相关的CHD类型和IE相关的因素（包括性别和相关时间变化的系数）（IE，Cyanisos，心脏假体，糖尿病，糖尿病，慢性肾脏疾病和Cardiac植入型电子设备）。结果总共确定了23,464名冠心病患者（50.0％的男性），并与93,856个对照匹配。在17。7年的时间随访期间，开发了217名（0.9％）CHD患者和4（0.0％）对照，相当于发病率分别为5.2（95％CI 4.6-6.0）和0.02（95％CI 0.01-0.1），分别为10,000人年。IE的发生率最高，在三角法的患者中，心脏腔室的畸形（包括大动脉的转座，单个心脏心脏和动脉truncus Arteriosus），心室室内隔缺陷和心脏瓣膜缺陷。与IE相关的冠心病患者中的因素包括男性性别，氰化物，心脏假体，慢性肾脏疾病和心脏植入电子设备。（Am Heart J 2023; 259：9-20。）结论CHD患者的IE相关发病率要高于背景人群。随着这些患者寿命的日益增加，有关预防措施的相关指南很重要。随着这些患者寿命的日益增加，有关预防措施的相关指南很重要。
tick和tick传播疾病
墨西哥湾海岸tick虫，Amblyomma Maculatum，居住在美国东南部与墨西哥，墨西哥湾和其他中美洲国家接壤的美国。最近，其美国范围已向亚利桑那州和东北部延伸至纽约州和康涅狄格州。这是立克帕克里（Rickettsia Parkeri）和赫帕托津（Hepatozoon Americanum）的矢量。该壁虱物种已成为研究tick/人力体相互作用的模型。为了提高我们对大曲霉的基本生物学的了解，我们在这里报告了该tick的基因组草案，并对其蛋白质组进行了广泛的功能分类。单个雄性tick的DNA用作基因组来源，10倍基因组学方案确定了28,460个脚手架，其脚手架具有相等或大于10 kb，总计1.98 GB。N50脚手架的大小为19,849 kb。Braker管道用于在组装的A. maculatum基因组上找到蛋白质编码基因边界，发现237,921 CD。在修剪和分类可转座元件，细菌污染物和截短的基因后，将一组25,702个注释并分类为核心基因产物。BUSCO分析显示83.4％的完整Buscos。提供了超链接的电子表格，可以浏览单个基因产品及其匹配到几个数据库。