与其他医学领域相反,内分泌学与一种器官结构无关,而与复杂的激素和代谢产物有关。激素被嵌入到局部和远端作用的复杂且复杂的网络中。这包括各种受体,信号通路和复杂的反馈机制。因此,存在多种细胞和激素模型,存在多种生理和疾病相关的相互作用。这些多层和相互联系的系统显然超出了人脑的理解和推理。适当的内分泌和代谢调节存在于昼夜节律,巡洋舰和巡洋舰节奏的微观和宏观宇宙上。激素调节中时钟基因依赖性生物节律的机制,以及内分泌模块中扭曲的自主激素产生的机制仍然很少了解。预计这种显着的异质性和复杂性将非常适合通过AI算法来解决[2]。
人类健康与疾病之间的微妙界限可能由宿主和微生物因素之间的相互作用所驱动。这种“宏基因组”调节癌症的发生、发展和对治疗的反应。除了不同微生物物种调节化疗药物药效学的能力外,上皮屏障与其微生物生态系统之间的共生关系对局部和远端免疫系统有重大影响,显著影响癌症患者的临床结果。使用抗生素可以降低免疫检查点抗体的癌症免疫疗法的疗效,而特定肠道微生物的存在可以观察到更好的疗效。精准医疗的未来策略可能会依赖于新的诊断和治疗工具,以识别和纠正影响治疗效果的微生物群缺陷。C
胆管癌(CCA)是一种侵略性,尽管是罕见的胆管恶性肿瘤,这是由肝内或肝外胆管上皮细胞引起的。ccas根据原点的位置分为三个不同的类别:肝内(ICCA)出现在二阶胆管上方;脊期(PCCA)位于二阶胆管或普通肝管以下;远端(DCCA)发生在囊性管插入以下的公共胆管中(1,2)。PCCA和DCCA通常分组在一起,并称为“肝外胆管癌”(ECCA)(3)。ICCA代表了胆管癌的类别,不仅在解剖学上是不同的,而且具有其自身独特的分子和临床特征。因此,至关重要的是,ICCA的诊断,可用治疗方式,手术选择和整体预后与ECCA分开。
基于活动的 CRISPR 扫描揭示 DNA 甲基化维持机制中的变构 Kevin C. Ngan 1,2、Samuel M. Hoenig 1、Pallavi M. Gosavi 1,2、David A. Tanner 1、Nicholas Z. Lue 1,2、Emma M. Garcia 1,2、Ceejay Lee 1,2 和 Brian B. Liau 1,2 * 隶属关系:1 美国马萨诸塞州剑桥市化学与化学生物学系 2 美国马萨诸塞州剑桥市哈佛大学和麻省理工学院 Broad 研究所 02142 *通讯地址:liau@chemistry.harvard.edu 摘要 变构能够动态控制蛋白质功能。一个典型的例子是严格协调的 DNA 甲基化维持过程。尽管变构位点具有重要意义,但系统地识别变构位点仍然极具挑战性。在这里,我们使用基于活性的抑制剂地西他滨对必需的维持甲基化机制——DNMT1 及其伴侣 UHRF1——进行 CRISPR 扫描,以揭示调节 DNMT1 的变构机制。通过计算分析,我们确定了远离活性位点的 DNMT1 中假定的突变热点,这些热点包括跨越多域自抑制界面和未表征的 BAH2 域的突变。我们从生化角度将这些突变表征为增加 DNMT1 活性的功能获得突变。将我们的分析推断到 UHRF1,我们在多个域中辨别出假定的功能获得突变,包括跨自抑制 TTD-PBR 界面的关键残基。总的来说,我们的研究结果强调了基于活性的 CRISPR 扫描在提名候选变构位点方面的实用性,甚至超越了直接药物靶点。简介变构是一种基本特性,它使蛋白质能够将一个位点的刺激作用转化为调节另一个远端位点的功能。尽管进行了深入研究,但在不同的蛋白质靶标中识别变构位点仍然具有挑战性,并且高度依赖于上下文。与正构位点不同,变构位点在相关蛋白质之间的保守性通常较低,并且控制其结构特征和特性的原理尚不清楚。1,2 由于这些挑战,用于识别和表征变构位点的实验和计算方法较少。3 尽管如此,人们仍在努力开发小分子变构调节剂,因为与正构配体相比,变构位点的结构多样性具有更高的选择性、更低的毒性和蛋白质功能的微调潜力。1,2 因此,开发能够识别变构机制的新工具将进一步加深我们对蛋白质调控的理解并促进药物发现。同时利用药理学和遗传学扰动已广泛成功地用于靶标反卷积和阐明药物作用机制。4 特别是,识别出导致药物耐药性的突变可为靶向作用提供关键验证,并且通常可以阐明潜在的生物学原理。5 尽管许多耐药性突变发生在药物结合位点附近,但它们也可能出现在靶蛋白的远端位置。即使药物在正构位点内结合,这些远端突变也可以通过扰乱变构机制起作用。6–8 例如,对 ABL1 抑制剂(包括正构和变构抑制剂)的耐药性突变始终出现在药物结合位点之外,并通过破坏非活性构象或以其他方式中和 ABL1 自身抑制来驱动耐药性。8–12 此类
正在服用 CFTR 调节剂和抗排斥药物的囊性纤维化患者——因为吸收不良可能会影响治疗效果。 接受过全胰腺切除术的患者 因壶腹部周围疾病(包括但不限于:胰腺/十二指肠/远端胆管/壶腹部癌、神经内分泌肿瘤和癌前病变)而接受过胰头手术的患者 正在接受化疗的胰腺癌患者——因为吸收不良和营养不良导致的身体机能状态不佳可能会阻止患者接受潜在的治愈性或延长生命的治疗。 服用生长抑素类似物治疗 NET 的患者 患有 PEI 和胰岛素依赖型糖尿病的患者 任何患有 PEI(包括胰腺炎、胰腺癌、囊性纤维化、胃切除术后等)并且难以维持营养状况的患者。
与其他医学领域相反,内分泌学与一种器官结构无关,而与复杂的激素和代谢产物有关。激素被嵌入到局部和远端作用的复杂且复杂的网络中。这包括各种受体,信号通路和复杂的反馈机制。因此,存在多种细胞和激素模型,存在多种生理和疾病相关的相互作用。这些多层和相互联系的系统显然超出了人脑的理解和推理。适当的内分泌和代谢调节存在于昼夜节律,巡洋舰和巡洋舰节奏的微观和宏观宇宙上。激素调节中时钟基因依赖性生物节律的机制,以及内分泌模块中扭曲的自主激素产生的机制仍然很少了解。预计这种显着的异质性和复杂性将非常适合通过AI算法来解决[2]。
癌细胞基因组含有正常细胞中没有的环状染色体外 DNA (ecDNA) 元素。临床样本分析表明,它们在大多数癌症中很常见,它们的存在预示着不良预后。它们通常含有高表达的增强子和驱动致癌基因。环状 ecDNA 拓扑结构导致染色质开放构象并产生新的基因调控相互作用,包括与远端增强子的相互作用。着丝粒的缺失导致细胞分裂过程中 ecDNA 随机分布,并且编码在其上的基因以非孟德尔方式传播。ecDNA 可以整合到染色体 DNA 中和退出。特定 ecDNA 的数量会随着治疗而改变。这种重塑癌症基因组的动态能力挑战了长期存在的基本原理,为肿瘤异质性、癌症基因组重塑和耐药性提供了新的见解。
尼古丁等。细胞成分(图5B)主要涉及I-κB/NF-κB复合物、胞质溶胶、核质和细胞核。分子功能(图5C)主要集中在同源蛋白结合、转录因子结合、转录调控区DNA结合、RNA聚合酶II远端增强子序列特异性DNA结合、蛋白质同源二聚化活性、染色质结合、转录因子活性、序列特异性DNA结合、蛋白质异源二聚化活性。结果提示ALI/ARDS涉及体内多个生物学过程,RAM可能通过调控这些生物学过程在ALI/ARDS的治疗中发挥作用。总结出排名前20的生物学过程和所有的细胞成分及分子功能,以供直观分析。