伪exon是非功能性内含子序列,可以通过深内核序列变化激活。激活中的伪exon包含在mRNA中,并干扰了正常的基因表达。PCCA C.1285-1416A> g变化激活伪exon,并通过在PCCA和PCCB中编码的丙酰基-COA羧化酶酶的指示引起严重的代谢性毒性酸血症。我们详细介绍了这种致病性伪exon活化事件,并确定HNRNP A1对于正常代表很重要。PCCA C.1285-1416A> g变化破坏了HNRNP A1结合剪接消音器,并同时创建剪接增强器。我们证明,通过剪接切换的反义寡核苷酸阻止这种调节区域可恢复正常的剪接,并挽救患者纤维细胞中的酶活性,并在由CRISPR基因创建的细胞模型中恢复了酶活性。有趣的是,PCCA伪exon具有上调基因表达的未插入潜力,因为健康组织显示出相对较高的纳入水平。通过阻止未激活的野生型假exon的包含,我们可以同时增加PCCA和PCCB蛋白水平,从而增加了异二次运动酶的活性。令人惊讶的是,我们可以从具有PCCA错义变体的患者纤维细胞中的残留水平中吸收酶活性,而且还可以从具有PCCB错过变体的患者中进行酶活性。这是丙酸血症的潜在治疗策略。
摘要:人神经母细胞瘤细胞系SH-SY5Y和IMR-32可以通过用全反替酸(ATRA)处理分化为神经元样的表型。分化后,这些细胞系被广泛用作体外模型来研究神经元细胞生物学的各个方面。然而,在ATRA诱导的分化中,SH-SY5Y和IMR-32细胞的蛋白质组和磷酸蛋白质组的时间和定量分析受到限制。在这里,我们在ATRA诱导的分化过程中,在多个时间点对SH-SY5Y和IMR-32细胞的蛋白质组和磷酸蛋白质组进行了相对定量。与随后的基因本体分析的蛋白质和磷酸肽的相对定量表明,包括细胞骨架组织,细胞分裂,伴侣伴侣功能和蛋白质折叠以及单碳代谢在内的几种生物学过程与两种细胞系中ATRA诱导的分化都相关。此外,激酶 - 基底富集分析预测了分化过程中几种激酶的活性改变。其中,CDK5表现出增加的活性,而CDK2的活性降低。提供的数据是研究在ATRA诱导的分化过程中SH-SY5Y和IMR-32细胞中时间蛋白和磷蛋白丰度变化的宝贵资源。