肺癌是全球癌症死亡的主要原因,而肺腺癌 (LUAD) 是最常见的肺癌类型。基因失调在 LUAD 的发展中起着至关重要的作用。基于药物靶基因和 LUAD 靶基因之间的关联进行药物重新定位有助于发现用于治疗 LUAD 的潜在新药,同时还可以降低新药发现和开发的金钱和时间成本。在这里,我们开发了一个基于机器学习的流程,通过已建立的图注意力网络 (GAT) 来预测潜在的 LUAD 相关靶基因。然后,我们通过基于基因巧合和基于基因网络距离的方法预测了用于治疗 LUAD 的潜在药物。使用来自 Cancer Genome Atlas 的 535 个 LUAD 组织样本和 59 个癌前组织样本的数据,鉴定出 48,597 个基因并用于构建 GAT 的预测模型。GAT 模型实现了良好的预测性能,受试者工作特征曲线下面积为 0.90。从GAT模型中识别出1597个潜在的LUAD相关基因。然后利用这些LUAD相关基因进行药物重新定位。计算了美国食品药品监督管理局批准的3070种药物和672种临床前化合物与靶基因的基因重叠和网络距离。其中,溴乙胺被预测为治疗LUAD的新型潜在临床前化合物,西咪替丁和苯溴马隆被预测为LUAD的潜在治疗药物。本研究建立的管线为开发LUAD的靶向疗法提供了新方法。
摘要◥ras/raf/mek/erk(MAPK)和pi3k/akt信号通路影响涉及癌症的几个细胞功能,使它们成为有吸引力的药物靶标。我们描述了一种新型的多重元素 - 用于定量PI3K/AKT和MAPK途径中蛋白质蛋白质的同工型特异性磷酸化,以评估小型动力学变化。在具有验证的抗体试剂验证的Luminex平台上开发了ERK1/2,MEK1/2,AKT1/2/3和RPS6的ERK1/2,MEK1/2,AKT1/2/3和RPS6的总蛋白质和特异性磷酸化水平的同工型特异性测定。多重分析表现出令人满意的分析性能。使用选定药物处理的异种移植模型进行拟合验证。在PC3和HCC70异种移植肿瘤中,PI3K B抑制剂AZD8186在单剂量后4至7小时抑制Akt1,Akt2和RPS6的磷酸化,但水平返回到
养子T细胞疗法(ACT)是一种快速发展的治疗方法,旨在利用T细胞特异性和功能来进行疾病。基于证据表明,T淋巴细胞可以介导有效的抗肿瘤反应,最初仅依赖于分离,体外膨胀以及输注肿瘤炎或循环肿瘤特异性T细胞。尽管在一部分病例中有效,但在第一次ACT临床试验中,几名患者在暂时疾病控制后发生了疾病进展。该证据促使研究人员通过利用不断发展的基因工程场和改进制造方案来改善ACT产品,从而能够生成有效且长期持续的肿瘤特异性T细胞产品。尽管最近进展,但在开发工具的开发中,包括抗原靶标,识别和优化肿瘤特异性T细胞受体的挑战,使T细胞能够抵消免疫抑制性肿瘤微环境,但仍需要面对。本综述旨在总结旨在在液体和实体瘤的背景下改善行为效率和安全性的主要成就,障碍和可能的解决方案。
* 通讯作者 Sunil J. Advani,加利福尼亚大学圣地亚哥分校摩尔斯癌症中心放射医学与应用科学系,3855 Health Sciences Drive, MC 0843,拉霍亚,CA 92093-0843,电话:858-822-6046,传真:858-822-5568,sjadvani@ucsd.edu。#contributed 同等贡献 作者声明 Dina V. Hingorani:调查、可视化、撰写 - 原始草稿。Jessica L. Crisp:调查、可视化。Matthew K. Doan:调查。Maria F. Camargo:调查。Maryam A. Quraishi:调查。Joseph Aguilera:调查。Mara Gilardi:调查。Larry A. Gross:方法论、调查。Tao Jiang:方法论、调查。Wei T. Li:调查。Weg M. Ongkeko:数据管理。 Ezra EW Cohen:资源、写作-评论和编辑。J. Silvio Gutkind:资源、写作-评论和编辑。Stephen R. Adams:方法论、资源、写作-评论和编辑。Sunil J. Advani:概念化、写作-原始草稿、监督、资金获取。
锡拉丘兹大学的超导量子位基于约瑟夫森连接处,是建造LargeScale量子信息处理器的主要候选人之一。在过去的十年中,超导量子位的性能取得了重大进展,目前在具有多达数十个量子位的系统的开发方面取得了迅速的进步。为了构建较大的系统,需要开发新技术来解决室温电子硬件和低温恒温器接线的间接费用要求,以控制和阅读大量量子。这项挑战的一种方法是在低温环境中实施更多的量子控制和读数。我将描述我们在将超导的古典数字电路与超导Qubits整合到相干控制和读数方面的努力。