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长链非编码 RNA Fos 下游转录本在发育过程中可有可无，但对于塑造中风后功能结果至关重要
我们之前表明，诱导一种高度保守的脑富集 lncRNA（称为 Fos 下游转录本 (FosDT, MRAK159688)）可通过与 REST（RE1 沉默转录因子）相关染色质修饰蛋白相互作用促进缺血性脑损伤。2,11 FosDT 基因与 Fos 基因同源，Fos 基因是细胞应激的标志物。12 FosDT 和 Fos 基因位于大鼠 6 号染色体（人类为 14 号染色体）上约 240 000 个核苷酸的基因沙漠内。11 我们目前使用通过 CRISPR-Cas9 基因组编辑开发的 FosDT −/− 大鼠评估了 FosDT 在大脑发育和缺血后结果中的功能意义。我们还通过分析另一个实验室的 FosDT 在缺血性脑损伤中的作用来评估我们数据的可重复性。我们进一步对短暂性局部缺血后的 FosDT −/− 和 FosDT +/+ 大鼠进行了 RNA 测序分析，以了解 FosDT 在缺血性脑中的机制含义。
2021; 12(13): 4099-4108. doi: 10.7150/jca.58097 研究论文 长链非编码RNA FIRRE促进肝细胞增殖和糖酵解
最近的研究表明，长链非编码RNA (lncRNA) FIRRE 参与结直肠癌和弥漫大B细胞淋巴瘤的增殖、抗凋亡和侵袭。然而，FIRRE 在肝细胞癌 (HCC) 中的生物学功能仍然未知。在本文中，我们发现与非肿瘤组织相比，HCC 中的 FIRRE 水平经常升高。与正常肝细胞相比，我们还证实了 HCC 细胞中 FIRRE 水平上调。值得注意的是，FIRRE 高表达与恶性临床特征有关，包括晚期 TNM 分期和肿瘤大小≥5 cm，并导致 HCC 生存率较低。功能上，FIRRE 敲低抑制了 HCCLM3 细胞的增殖和糖酵解。FIRRE 过表达增强了 Huh7 细胞增殖和糖酵解。值得注意的是，FIRRE 正向调节肝癌细胞中的乙醇酸酶 6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-双磷酸酶 4 (PFKFB4) 表达。PFKFB4 在肝癌组织中高表达且与 FIRRE 水平呈正相关。PFKFB4 的上调表达与高肿瘤分级和晚期 TNM 分期相关。TCGA 数据显示，PFKFB4 高表达提示肝癌预后不良。从机制上讲，调节 FIRRE 水平不会影响 PFKFB4 mRNA 的稳定性。FIRRE 主要分布在肝癌细胞的细胞核中，并通过 cAMP 反应元件结合蛋白 (CREB) 促进 PFKFB4 的转录和表达。PFKFB4 可以消除 FIRRE 敲低对肝癌细胞增殖和糖酵解的影响。总之，高表达的 FIRRE 通过增强 CREB 介导的 PFKFB4 转录和表达促进 HCC 细胞增殖和糖酵解。
2021; 17(1): 220-235. doi: 10.7150/ijbs.50730 综述 长链非编码 RNA：肝细胞癌治疗和诊断的潜在生物标志物和靶点
肝细胞癌 (HCC) 是全球癌症相关死亡的主要原因之一。越来越多的研究表明，长链非编码 RNA (lncRNA) 是一类长度超过 200 个核苷酸但缺乏编码蛋白质能力的新 RNA，在 HCC 的发生和发展中起着至关重要的作用。lncRNA 通过调节下游靶基因表达和癌症相关信号通路促进肿瘤细胞的增殖、迁移、侵袭、自噬和凋亡。同时，lncRNA 可用作预测 HCC 治疗策略（例如手术、放疗、化疗和免疫治疗）疗效的生物标志物，并可作为 HCC 诊断和治疗的潜在个性化工具。在本综述中，我们概述了 lncRNA 作为 HCC 手术、放疗、化疗耐药、靶向治疗和免疫治疗的潜在生物标志物的最新发现，并讨论了 lncRNA 作为 HCC 诊断和治疗工具的潜在临床应用。
长链非编码 RNA PTPRG- AS1 的过度表达与上皮性卵巢癌预后不良相关
长链非编码RNA（lncRNA）长度超过200个核苷酸，是一类新发现的基因转录副产物，由于缺乏开放阅读框6，其蛋白质编码功能有限。越来越多的研究表明，lncRNA通过转录和转录后水平等多种机制在基因调控中起着潜在的调节作用7。鉴于lncRNA对肿瘤相关基因的积极影响，其可能参与癌症进展也就不足为奇了8,9。近年来，利用高通量测序技术发现了越来越多在各类肿瘤中失调的lncRNA，随后通过RT-PCR实验进一步证实10,11。随后，许多功能实验表明，lncRNA可以作为肿瘤启动子或抑癌基因来调节肿瘤细胞行为12,13。 lncRNA 的频繁失调及其在肿瘤进展中的重要作用凸显了 lncRNA 作为新型生物标志物的巨大潜力 14,15 。LncRNA PTPRG 反义 RNA 1 (PTPRG-AS1) 是一种新发现的 lncRNA，由 Yi 等人首次在鼻咽癌中阐明其功能。16 。此前，PTPRG-AS1 也在肺癌和乳腺癌中表达 17,18 。然而，它们在上述两种肿瘤中的功能仍有待探索。到目前为止，PTPRG-AS1 是否在 EOC 中异常表达尚未得到证实。在这项研究中，我们首次提供了 PTPRG-AS1 在 EOC 组织中高表达的证据，并有可能作为 EOC 患者的新型预后生物标志物。
c-Met 中的微小 RNA 和长链非编码 RNA - ...
微小RNA（miRNA）和长链非编码RNA（lncRNA）是与肿瘤侵袭性和癌症转移相关的许多信号通路的组成部分。一些lncRNA被归类为竞争性内源性RNA（ceRNA），它们与特定的miRNA结合，以阻止与靶向mRNA的相互作用。研究表明，肝细胞生长因子/间充质上皮转化因子（HGF/c-Met）通路参与细胞生长、血管生成和胚胎发生等生理和病理过程。c-Met的过度表达可导致下游信号的持续激活，从而导致致癌、转移和对靶向治疗的耐药性。在本综述中，我们利用临床和组织染色质免疫沉淀 (ChIP) 分析数据评估了抗癌和致癌非编码 RNA (ncRNA) 对 c-Met 的影响，以及癌症中 lncRNA、miRNA 和 c-Met 之间的相互作用。我们总结了当前对 lncRNA/miR-34a/c-Met 轴在不同肿瘤类型中的机制和影响的认识，并评估了针对 c-Met 的 lncRNA 和/或 miRNA 对药物耐药性的潜在治疗价值。此外，我们讨论了 lncRNA 和 miRNA 在 c-Met 相关致癌作用中的作用以及潜在的治疗策略。
长链非编码 RNA TUG1 是 TGF-β/TWIST1/EMT 介导的结直肠癌细胞转移所必需的
摘要 结直肠癌 (CRC) 是全球癌症死亡的主要原因之一，而转移是 CRC 相关死亡的主要原因。转化生长因子-β (TGF- β) 不仅在调节正常结肠中起着重要作用，而且在 CRC 的发展和转移中也起着重要作用。然而，TGF- β 不被认为是理想的治疗靶点，因为它根据肿瘤阶段表现出促肿瘤发生和抗肿瘤发生的活性。因此，找到可以靶向损害 CRC 转移的 TGF- β 下游信号传导成分非常重要。在这里，我们表明 TGF- β 促进 CRC 迁移并上调长链非编码 RNA 牛磺酸上调基因 1 (TUG1) 的表达。TUG1 敲低抑制了体外 CRC 细胞的迁移、侵袭和上皮 - 间质转化 (EMT)，并降低了体内 CRC 肺转移。 TGF- β 诱导转移，而 TUG1 敲低则抑制了这种作用。此外，TGF- β 不能逆转 TUG1 敲低的抗转移作用。这些数据表明 TUG1 是 TGF- β 的下游分子。此外，TWIST1 表达随着 TGF- β 处理而增加，而 TUG1 敲低则降低了 CRC 细胞中的 TWIST1 表达。TWIST1 敲低抑制了 CRC 细胞的侵袭和 EMT；这些作用不受同时敲低 TUG1 的影响，表明 TWIST1 是 TUG1 的下游介质。此外，TUG1 在 CRC 患者中显著过表达。总之，TGF- β 通过 TUG1/TWIST1/EMT 信号通路促进 CRC 转移。TUG1 可能是抑制 TGF- β 通路激活治疗 CRC 的一个有希望的药物靶点。
长链非编码RNA在生物体内调控机制研究方面的最新进展
多发性硬化症 (MS) 是一种慢性自身免疫性疾病，其特征是中枢神经系统 (CNS) 的严重炎症和脱髓鞘，导致复发和进行性神经功能恶化 [ 1 ] 。根据 3 Atlas of MS 2013 [ 2 ]，全球有 200 万至 300 万人患有 MS，每 10 万人中有 33 人患病，但由于缺乏有关亚洲大国的数据，这一数字可能被低估。MS 主要影响以女性为主的年轻人，该病的首发症状通常出现在 20 至 40 岁之间 [ 3 ]。MS 具有多种临床特征，包括感觉丧失、肌肉逐渐无力、小脑和自主脊髓症状等 [ 4 ]。治疗 MS 的药理学方法是