ryanodine受体(RYR)是细胞钙稳态和signaling的必要调节剂。脊椎动物基因组包含多个RYR基因同工型,在不同的tisse中表达并执行不同的功能。相反,无脊椎动物基因组包含一个单一的RYR编码基因,长期以来一直提出,替代剪接产生的不同转录本可能会使它们的功能多样化。在这里,我们分析了c中替代外显子的表达和功能。秀丽隐杆线虫Ryr Gene UNC-68。我们表明,特定的同工型亚集是通过替代启动子和UNC-68 Diver-Gent区域2(DR2)中的替代剪接创建的,该区域实际上对应于跨脊椎动物同型跨脊椎动物高序列变异性的区域。特定的UNC-68替代外显子的表达富含不同的组织,例如体壁肌肉,神经元和咽肌。为了推断特定替代启动子和UNC-68的替代外显子的功能,我们通过CRISPR/CAS9基因组编辑选择性地删除了它们。我们评估了咽功能,以及在游泳和爬行的运动功能,并通过高含量的计算机辅助姿势和行为分析。我们的数据提供了同工型特异性突变的多效影响的综合图,并强调了组织特异性的UNC-68 ISO形式实现了不同的功能。整体上,我们的工作阐明了c。秀丽隐杆线虫单基因UNC-68可以通过组织特异性同工型完成多个任务,并为进一步发展c提供了坚实的基础。秀丽隐杆线虫作为研究RYR通道功能和故障的模型。
改进的基因组工程方法可以使大型和精确的编辑自动化对于系统研究基因组功能至关重要。我们将Peel-1负选择适用于秀丽隐杆线虫中CRISPR-CAS9基因组工程的优化双标志物选择(DMS)盒式方案,并观察到多种效率测量的强大提高,这些效率均一致,这些效率是一致的。使用Peel-1-DMS选择杀死了具有转基因的动物,这些动物具有转基因,并保留了基因组编辑的整合体,通常会规避视觉筛查以识别基因组编辑的动物。为了证明该方法的适用性,我们会在推定的蛋白酶体亚基PBS-1和未表征的基因K04F10中删除等位基因。3并使用机器视觉自动表征其表型促进,从而揭示了纯合基本和杂合行为表型。这些结果为快速产生和表型基因组编辑的动物提供了强大而可扩展的方法,而无需通过眼睛进行筛查或评分。
迫切的治疗需求限制了监管机构批准前治疗药物的研究。因此,对批准后的药物进行分析可以提高我们对药物作用机制的理解,并实现更好的治疗。我们通过对线虫秀丽隐杆线虫进行简单的检测,筛选了 1443 种美国食品药品监督管理局 (FDA) 批准的药物库,发现三种化合物会引起形态变化。抗凝剂噻氯匹定和抗真菌剂舍他康唑都会导致药物积聚,导致咽部解剖结构明显扭曲,急性暴露后死亡,而质子泵抑制剂右兰索拉唑会导致蜕皮缺陷,需要在幼虫发育过程中暴露。强大的遗传模型系统中这种易于检测的缺陷主张继续使用各种模型生物探索现有药物,以更好地了解已经为数百万患者开出的药物。© 2020 作者。由 Elsevier Ltd. 出版。这是一篇根据 CC BY-NC-ND 许可协议 ( http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ ) 开放获取的文章。
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可,根据 未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是 由 此预印本的版权持有者(此版本于 2020 年 5 月 27 日发布。 ; https://doi.org/10.1101/2020.05.26.117390 doi: bioRxiv preprint
发育基因调控网络 (GRN) 是后生动物胚胎发生的基础,经历了重大修改,形成了当今地球上种类繁多的动物形态。线虫秀丽隐杆线虫一直是推动基础机械生物学许多重要发现的核心模型,最近,它为探索 GRN 结构的进化多样化和其他物种的发育过程提供了坚实的基础。在这篇简短的综述中,我们将重点关注最古老的胚胎胚层内胚层的 GRN 进化多样化。早期胚胎发生在线虫门中存在很大差异。值得注意的是,虽然一些物种部署了调控发育,但更衍生的物种,如秀丽隐杆线虫,则表现出胚胎发生的马赛克模式。尽管不同物种的线虫肠道形态相对相似,但已观察到启动内胚层 GRN 的信号输入存在广泛差异,这是发育系统漂移 (DSD) 的一个典型。我们将探索内胚层 GRN 的遗传变异如何帮助在物种间和物种内推动 DSD,从而形成强大的发育系统。使用不同线虫进行比较研究有望揭示控制发育可塑性的遗传机制,并为控制胚胎 GRN 进化修饰的原理提供范例。
引用格式 : 陈向阳 , 冯雪竹 , 光寿红 .靶向基因编辑技术在秀丽隐杆线虫中的应用 .中国科学 : 生命科学 , 2018, 48: 266–277 Chen X Y, Feng X Z, Guang S H. Application of targeted genome-editing technologies in Caenorhabditis elegans (in Chinese).Sci Sin Vitae, 2018, 48: 266–277, doi: 10.1360/N052017-00250
简历和讨论摘要:本申请提议在先前的研究工作的基础上,确定秀丽隐杆线虫中抗病毒信号传导和 RNA 免疫传感途径的机制。该提案具有重要意义,因为它试图通过确定秀丽隐杆线虫中可诱导的抗病毒和抗真菌反应来增进我们对先天免疫反应的理解。该申请的其他主要优势包括一支经验丰富的研究人员团队,他们在 RNA 测序和细胞内病原体反应途径方面拥有专业知识。研究方法包括全面讨论先前研究的严谨性、开发用于探索细胞内病原体反应途径的独特工具的技术创新。有大量令人信服的初步数据支持这项工作的可行性,对潜在的陷阱和替代方法进行了充分的描述。总体而言,审查小组对这一强大的申请表现出很高的热情。
开幕式联谊会,6 月 26 日,星期三:10:00 至 11:30 的全体会议 1 结束后,立即在 Royce Quad 的开幕式联谊会上与朋友和同事见面。将提供免费啤酒、葡萄酒和苏打水。GSA 教师指导社交活动将于 6 月 27 日星期四晚上 7:00 至 8:00 在 Grand Horizon Ballroom Terrace 举行。本次活动由资深 C. elegans 教师为现任和新聘用的初级教师组织。将介绍新教师,然后进行非正式讨论。鼓励所有 C. elegans 实验室负责人参加。晚间社交活动,6 月 27 日星期四和 6 月 28 日星期五:晚间社交活动将于晚上 10:00 至午夜 12:00 在 Pauley Pavilion 大厅举行。将提供免费啤酒、葡萄酒和苏打水。饮料必须留在大厅。海报展示区不允许饮用任何饮料。周六晚间活动,6 月 29 日:计划于晚上 6:30 至晚上 8:00 在 Royce Quad 举行烧烤活动。C. elegans 艺术展颁奖典礼将于晚上 8:15 在 Royce Hall 举行,随后是 Worm Variety Show,时间为晚上 8:30 至晚上 9:00。会议派对将于晚上 9:00 至晚上 11:30 在 Ackerman Grand Ballroom 举行。届时将提供啤酒、葡萄酒和软饮料。用餐时间