摘要在基因组成方面具有巨大的多样性,包括多种推定的抗生素耐药性基因,阿巴岛是鲍曼尼杆菌杆菌多药的潜在贡献者。但是,ABAR对抗生素耐药性和细菌生理学的有效贡献仍然难以捉摸。为了解决这个问题,我们试图准确删除Abar Islands并恢复其插入站点的完整性。为此,我们设计了一种多功能无疤的基因组编辑策略。我们在最近的两个鲍曼尼菌临床菌株中形成了这种遗传修饰:分别携带19.7 kbp和86.2 kbp的Abar1和Abar1岛的菌株AB5075和菌株AYE。然后,在父母菌株及其固定衍生物之间进行抗生素敏感性。通过该岛的开放阅读框(ORF)的预测功能所预期的,抗抗性的抗抗药性在野生型和ABAR11固定的AB5075菌株之间相同。ABAR1具有25个ORF,预测抗生素类别具有抗性,并且AYE ABAR1固定衍生物显示出对多种类别的抗生素的可疑性。此外,ABARS的固化恢复了高水平的自然转化性。的确,大多数阿巴群岛都被插入与自然转化有关的通讯基因中。我们的数据表明,Abar插入有效地失活,并且还原的通信是功能性的。固化始终导致高度转换,因此很容易遗传诱因。ABAR的修改提供了对Abar获取功能的洞察力的见解。
。cc-by 4.0国际许可(未经Peer Review尚未获得认证)是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本于2024年10月19日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.10.19.619093 doi:Biorxiv Preprint
摘要:抗菌素抵抗(AMR)在全球范围内对健康,社会,环境和经济部门构成了显着威胁,并且需要认真关注解决这一问题。鲍曼尼氏杆菌在传染性细菌中被赋予了头等大事,因为它几乎对所有抗生素类别和治疗选择都具有广泛的耐药性。耐碳青霉苯甲酸杆菌的baumannii被分类为世界卫生组织(WHO)优先级的抗生素耐药菌细菌的重点清单之一。尽管可用的遗传操纵方法在鲍曼尼曲霉的实验室菌株中取得了成功,但在新获得的临床菌株中使用时,它们受到限制,因为这种菌株的AMR水平高于用于选择它们进行基因操作的AMR。最近,CRISPR-CAS(群集定期间隔短的短粒子重复序列/CRISPR相关蛋白)系统已成为基因组编辑的最有效,最有效,最精确的方法之一,并提供了靶标针对AMR基因在特定的细菌菌株中的AMR基因。基于CRISPR的基因组编辑已成功应用于各种细菌菌株中以对抗AMR。但是,在鲍曼曼尼(A. Baumannii)中尚未广泛探索该策略。本评论提供了详细的见解,了解CRISPR-CAS使用对A. Baumannii中与AMR相关的基因操纵的进度,现有情况和未来潜力。
摘要:这项研究旨在研究抗碳青霉培养素的生物膜产生能力鲍曼尼(Baumannii)(CRAB)(CRAB),70%乙醇和0.5%钠次氯酸钠的生物膜膜片潜力在生物膜产生和细菌基因型之间。测试了总共111个螃蟹分离株的抗菌易感性,生物膜形成,编码碳青霉酶的基因的存在以及与生物FILM相关的毒力因子。还测试了消毒剂和SENP对CRAB分离株的抗纤维膜作用。绝大多数测试的分离株是生物膜生产者(91.9%)。在57%,70%和76%的螃蟹分离株中发现了BAP,OMPA和CSUE基因,与非生物产生的生产者(25%)相比,在生物纤维生产国(78.6%)中,CSUE在生物纤维生产国(78.6%)中的普遍性更高。测试的消毒剂比对弱生产者的抗纤维膜对中度和强生物膜产生的影响更好(p <0.01)。SENP对所有测试的浮游症状(MIC范围:0.00015至> 1.25 mg/ml)和生物纤维膜包含的蟹表现出抑制作用,最低生物膜抑制浓度低于0.15 mg/ml,生物纤维抑制浓度低于0.15 mg/ml。总而言之,SENP可以用作有前途的治疗和医疗设备涂料剂,因此是预防生物膜相关感染的替代方法。
结果:从137个表位中选择了最高分数的九种肽(20AA),并将五个肽视为抗原表位(E1 – E5)。E3作为有效抗原(得分:0.939537)和E1作为最佳疫苗候选者(得分:0.9803)。Solpro将所有表位视为可溶性肽。Protparam预测显示E3和E5作为稳定蛋白,保质期为3.5和1.9 h,具有负肉汁值。PSORTB服务器预测GACS蛋白序列作为细胞质膜蛋白的最终定位评分为7.88。IEDB保护分析显示,GACS序列中的100%保守序列,I类保护均为所有表位产生正值。聚类分析显示出很强的相互作用,并且与TLR-2最终检测到的E5的蛋白质肽相互作用是最佳相互作用的肽(H键= 14),其次是E3(H键= 12)。