二级结构。10,11 事实上,病毒基因组 RNA 的特定区域折叠成某些二级结构可能会阻碍病毒基因组的表达和复制,因为它们会阻碍病毒 RNA 转录和/或作为 RNA 加工机制附着的标志。这些结构包括 G-四链体 (G4),它是由单链富含鸟嘌呤的 DNA 或 RNA 序列自身折叠形成的四链结构。12 a,b G4 结构的特征是两个或多个平面排列的四个鸟嘌呤 (G-四联体) 堆叠,并通过 Hoogsteen 氢键和阳离子配位稳定。这些结构可能出现在具有至少四个连续的两个或更多个鸟嘌呤段的序列中,其间散布着形成所谓环的序列。 G4 在多种病毒(包括单链 RNA 病毒)中发挥着重要作用,13,14 一些靶向 G4 的化合物已显示出抗病毒活性,15 这表明 G4 特异性化合物是潜在的抗病毒药物。最近的报告在 SARS-CoV-2 基因组中发现了许多假定的 G4 形成序列,其中一些已被证明可以在体外形成 G4。11,16–18
HEK 293细胞用荧光素酶构建体,其中含有鸟嘌呤适体的核糖开关(左),腺嘌呤适体(中间)或TPP Aptamers(右)。转染的细胞用适体配体以指定的剂量处理。图显示了开关对不同适体粘合剂的剂量反应。con 1是没有核糖开关盒的控制构建体。
DNA和RNA世界:1。在门德尔(Mendel)之后的几年中,研究了遗传物质的性质,从而意识到DNA是大多数生物中的遗传物质。2。脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)是活体系中发现的两种核酸。核酸是核苷酸的聚合物。3。DNA在大多数生物体中充当遗传物质,而RNA在某些病毒中充当遗传物质。4。RNA主要用作Messenger。RNA具有其他功能作为衔接子,结构或催化分子。 5。 多核苷酸链的结构(i)核苷酸具有三个部分,即 氮基,五糖糖(DNA中的脱氧核糖,RNA中的核糖)和磷酸基团。 (ii)氮碱是嘌呤,即 腺嘌呤,鸟嘌呤和嘧啶,即 胞嘧啶,尿嘧啶和胸腺嘧啶。 (iii)胞嘧啶在DNA和胸腺氨酸中都存在于DNA中。 尿嘧啶存在于胸腺嘧啶位置的RNA中。 (iv)氮基碱通过N-糖苷键连接到五糖糖,形成核苷,即 腺苷和鸟嘌呤等。 (v)当磷酸基团通过磷酸二酯键连接到核苷的5' - OH时,形成了相应的核苷酸。 (vi)两个核苷酸通过3' - > 5'磷酸二酯键连接以形成二核苷酸。 (vii)可以连接几个核苷酸以形成多核苷酸链。 (x)基碱对彼此互补。RNA具有其他功能作为衔接子,结构或催化分子。5。多核苷酸链的结构(i)核苷酸具有三个部分,即氮基,五糖糖(DNA中的脱氧核糖,RNA中的核糖)和磷酸基团。(ii)氮碱是嘌呤,即腺嘌呤,鸟嘌呤和嘧啶,即胞嘧啶,尿嘧啶和胸腺嘧啶。(iii)胞嘧啶在DNA和胸腺氨酸中都存在于DNA中。尿嘧啶存在于胸腺嘧啶位置的RNA中。(iv)氮基碱通过N-糖苷键连接到五糖糖,形成核苷,即腺苷和鸟嘌呤等。(v)当磷酸基团通过磷酸二酯键连接到核苷的5' - OH时,形成了相应的核苷酸。(vi)两个核苷酸通过3' - > 5'磷酸二酯键连接以形成二核苷酸。(vii)可以连接几个核苷酸以形成多核苷酸链。(x)基碱对彼此互补。(viii)多核苷酸链中的主链由于糖和磷酸盐而形成。(ix)与主链糖部分相关的氮基碱基。6。在RNA的情况下,每个核苷酸残基都有一个额外的OH组,核糖中的2位位于核糖中。另外,在胸腺氨酸(5-甲基尿嘧啶)的位置也发现了尿嘧啶。
概率的父母之间没有血缘关系。确认了II型中枢神经系统的诊断,通常会提取和测序他的父母的血液基因组DNA及其父母的血液基因组DNA。遗传测试结果显示两个可疑的纯合致病突变。一个突变是C.1456 T> G P.Y486D纯合突变。Y486D位于外显子5上,将1,456胸腺素(T)改为鸟嘌呤(G),并将残留物486酪氨酸(Tyr)变成天冬氨酸(ASP)。他的父母是C.1456 T> G P.Y486D杂合载体(补充数字S1A – C)。另一个突变是c.211g> a p.g71r纯合突变。g71r位于外显子1中,将211鸟嘌呤(g)突变为腺嘌呤(a),并将残基71从甘氨酸(Gly)变化为精氨酸(ARG)。他的父亲是C.211G> p.g71r纯合子载体,没有任何症状,他的母亲是杂合携带者(补充数据S1D – F)。
硫唑嘌呤是活性代谢物 6-巯基嘌呤的前体药物,长期以来人们认为其主要作用机制是通过阻断诸如酰胺磷酸核糖基转移酶之类的酶来抑制嘌呤腺嘌呤和鸟嘌呤的合成,从而产生无功能的核酸链。从头嘌呤合成的中断会抑制 DNA 和 RNA 的合成,从而抑制淋巴细胞等快速生长细胞的增殖。淋巴细胞特别容易受到从头嘌呤合成抑制的影响,因为它们相对缺乏嘌呤合成的替代途径,即嘌呤“补救”途径,在该途径中核苷酸由核苷酸降解产物重新合成。然而,在过去的几十年里,人们提出了多种由各种硫唑嘌呤代谢物介导的其他作用机制,包括阻断 T 细胞活化和刺激 T 细胞凋亡。长期以来有报道称硫唑嘌呤对 T 细胞功能比对 B 细胞功能更有效,尽管缺乏有力的证据支持这一点,而且我们实验室最近的研究表明硫唑嘌呤可以抑制 B 细胞和 T 细胞增殖。
我们发现嘧啶胸腺嘧啶 (T) 和胞嘧啶 (C) 的 VAE 仅相差 0.03 eV,嘌呤鸟嘌呤 (G) 和腺嘌呤 (A) 的 VAE 仅相差 0.08 eV。与“化学”直觉相反,嘧啶的垂直形成的阴离子比较大嘌呤的阴离子更稳定,大约高 0.2 eV。考虑到每种化合物中中性势面和阴离子势面之间的 Franck-Condon 重叠,我们发现所有碱基都有一系列共同的能量,电子可在该能量范围内附着。换句话说,碱基的最低临时阴离子状态在实际意义上是简并的。此外,我们还观察到与腺嘌呤以外所有碱基的最低空分子轨道 (LUMO) 相关的临时阴离子核运动的证据。这表明电子注入这些轨道强烈激发中性分子的振动模式。