90095,美国。* 通讯作者电子邮件:ana@chem.ucla.edu 摘要。为了解开为什么计算设计无法创造可行的酶,而定向进化 (DE) 却能成功,我们的研究深入研究了原珠蛋白的实验室进化。DE 已经改造了这种蛋白质,使其能够有效催化卡宾转移反应。我们表明,之前提出的增强底物接近和结合本身不能解释 DE 期间产量的增加。通过蛋白质动力学跟踪整个活性位点的 3D 电场,使用亲和力传播算法进行聚类,并进行主成分分析。该分析揭示了 DE 电场的显着变化,其中不同的场拓扑影响过渡态能量和机制。一个具有化学意义的场成分出现并在 DE 期间起主导作用,并有助于跨越卡宾转移障碍。我们的研究结果强调了内在电场动态对酶功能的影响、场在同一蛋白质内切换机制的能力以及场在酶设计中的关键作用。主页
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文件名:l_supply_chain_management_system_dynamics_modelling_approach.pdf (1.97M)
原发灶不明的癌症 (CUP) 是一个总称,用于根据缺乏可识别的原发肿瘤对一组异质性转移性癌症进行分类。临床上,CUP 具有一系列独特特征,包括早期转移性播散,模式不典型、临床病程侵袭性强、对经验性化疗反应不佳,因此预期寿命较短。人们追求两种相反的策略来改善糟糕的预后。一方面,遵循传统的组织学方法,越来越多复杂的组织来源 (TOO) 分类器检测被用于将假定的原发灶识别推到极限,其明确目的是允许肿瘤部位特异性治疗。然而,支持其常规临床应用的有力证据仍然缺乏,特别是最近两项随机临床试验未能证明基于 TOO 预测的部位特异性治疗比 CUP 经验性化疗对患者有益。另一方面,就组织无关策略而言,针对可操作基因组改变的精准医疗方法已经改变了许多已知肿瘤类型的治疗方法。然而,仍需要精心设计的临床试验来研究其在 CUP 中的潜在作用,而不仅仅是轶事病例报告。在缺乏改变实践的结果的情况下,我们认为 CUP 一词中隐含的强调不惜一切代价寻找假定的未知原发性肿瘤的倾向已经使该领域的近期研究产生了偏见。我们关注所有 CUP 共有的独特临床特征,主张采用原发性转移性癌症 (PMC) 这一术语来指代一种独特的癌症实体。我们认为,PMC 应被视为转移性疾病的原型,因此,尽管仅占恶性肿瘤的 2-3%,但揭示其中的机制不仅有助于改善 PMC 患者的预后,而且有望大大增强我们对所有癌症类型的转移过程和致癌作用的理解。
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国际地层学委员会(ICS)宣布了新的年代地层学量表国际地质科学联盟(IUGS)执行委员会的批准。这些变化尤其影响了全新世 - 第四纪最年轻的部门。根据多年的研究,建议将全新世分为三个层:早期的蒙古格陵兰舞台,中蒙古中部北流感阶段和蒙古晚期的巨型巨型舞台。所有这些都是根据与气候变化相同的碳的同位素组成的急剧变化时间来确定的[1]。类比与公认的“全新世”(持续了过去12000年的时代),生态学家尤金·斯托勒(Eugene Stormer)介绍了“人类世”一词 - 与生态系统相关的人类活动具有破坏性的时期。人类世的一个特征是,人类活动对地球的影响比自然地质过程更大[2]。人类正处于其历史上最大的阶段过渡之一的边缘。重要的事件是原子测试,化石燃料发电厂的广泛使用,野生物种灭绝的人和宠物的数量急剧增加,大气中的CO 2含量增加,海洋的微塑性污染,对肥料的使用以及对食物的种植,源于外国(入侵性的植物)和新的养分型。尽管Vernadsky的作品是100年前写的,而Lovelock的作品 - 50年前,人类对环境宏观过程的理解水平仍处于起步阶段。
摘要根际是植物根直接影响的土壤区域。根际中的微生物群落包括真菌,原生和细菌:所有在植物健康中都起着作用。有益的细菌中西氏细菌在氮含有的豆科植物上感染了根毛。感染会导致根结节的形成,其中Meliloti将大气氮转化为氨(一种可生物利用形式)。在土壤中,经常在生物膜中发现梅洛蒂(S. meliloti),并沿着根部缓慢行进,沿着未感染的根尖生长的根尖端发出根毛。土壤原生生物是根际系统的重要组成部分,能够沿着根和水膜迅速行进,后者捕食土壤细菌,并且已知未消除的吞噬体已知。我们表明,土壤原生物colpoda sp。可以将S. meliloti沿Medicago trunca-tula根传递。使用模型的土壤缩影,我们直接观察到沿截骨根部的流体标记为Meliloti链球菌,并随着时间的推移跟踪了荧光信号的位移。共同接种两周后,当Colpoda sp。也存在与含有细菌但没有生物的治疗方法相比。直接计数还表明,生存细菌需要生存者才能达到我们缩影的更深层。促进细菌运输可能是土壤生物促进植物健康的重要机制。
文章信息摘要文章历史记录:收到:18/12/2024以修订格式收到:23/12/2024接受:29/12/2024在线可用:30/12/2024
将生物聚合物用作化学洪水中合成聚合物的一种替代方法,以增强石油回收(EOR),由于其能够承受恶劣的储层条件和环境友好的能力,因此变得非常重要。在这种情况下了解生物聚合物的行为对于确定它们表现出一致的行为还是因一种情况而变化至关重要。This study focuses on evaluating the rheological properties and core flooding outcomes of three specific biopolymers, namely hydroxyethyl cellulose (HEC), xanthan gum, and guar, under reservoir conditions of 212°F, the salinity of 135,000, and pressure of 2200 psi where the previous works lacked to examine the behavior of these biopolymers under such combined conditions.的发现表明在这些条件下生物聚合物流变特性的不均匀行为,突出了在EOR过程中使用它们之前对其进行评估的关键需求。在储层条件下,压力的增加导致黄原胶的粘度降低,但瓜的粘度提高。HEC的粘度最初随着压力的增加而降低,但随后显示出增加。此外,在储层条件下,所有生物聚合物都显示出剪切稀疏和弱凝胶行为(存储模量/损失模量> 0.2)。使用实际Bahariya地层核心的核心洪水实验显示,黄原,瓜尔和HEC恢复了22%,8.9%和1.8%的残留油饱和度,分别为6%,2.7%和0.6%的原始油。这表明黄原胶在恶劣的储层条件下在测试的生物聚合物中具有出色的流变特性和油回收率。
真核细胞核的进化起源机制仍不清楚。在几种合理的假设中,最具争议的是大型 DNA 病毒(如痘病毒)导致了真核细胞核的出现。最近的几项发现,包括在原核病毒和具有类似核的内膜的原核生物中发现类似核的结构,表明基因组 DNA 不仅在真核生物中存在区室化,在原核生物中也存在区室化。人们认为,巨型病毒的复杂病毒机制类似于真核细胞核:DNA 在病毒工厂和细胞核内复制,细胞核至少部分被膜包围,没有核糖体。此外,最近发现的棘阿米巴卡氏水母病毒的几个特征表明,祖先病毒工厂和真核细胞核之间存在进化关系。值得注意的是,Ran、DNA聚合酶和组蛋白显示了病毒和宿主之间核基因横向转移的分子化石。这些结果表明病毒在真核细胞核出现过程中具有创新性。根据这些结果,提出了一种从病毒参与的角度解释真核细胞核起源的新方案。这种新方案可能会对真核生物起源的研究产生重大影响,并激发有关病毒对真核细胞核进化贡献的进一步讨论。