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5mC 选择性脱氨酶的发现及其在碱基分辨率甲基化位点超灵敏直接测序中的应用
摘要 挖掘噬菌体中的新酶活性对于开发新的生物技术工具仍然很重要。在本研究中，我们使用 MetaGPA（一种将宏基因组数据中的基因型与表型联系起来的方法）来识别脱氧胞苷脱氨酶，这是一种与宏病毒组中的胞嘧啶修饰高度相关的蛋白质家族。出乎意料的是，这些脱氨酶的一个子集在单核苷酸和单链 DNA 底物中都表现出对 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 的偏好，而不是胞嘧啶 (C)。在甲基化组测序工作流程中，这些酶优先脱氨 5mC，这使得甲基化胞嘧啶能够直接转化，同时完全消除任何未修饰胞嘧啶的背景脱氨。这种直接转换允许以单碱基分辨率精确识别甲基化位点，具有无与伦比的灵敏度，为基因组和甲基化组的同时测序提供了广泛的应用。
5mC 临床前 paper_bioRxiv_final
Wataru Akahata，博士 VLP Therapeutics，Inc. 704 Quince Orchard Rd. #110，Gaithersburg，MD 20878 电话：(240) 801-4456 电子邮件：wakahata@vlptherapeutics.com Hisashi Akiyama，博士 病毒学、免疫学和微生物学系 波士顿大学 Chobanian & Avedisian 医学院 650 Albany Street，X343B Boston，MA 02118 电话：(617) 358-1778 传真：(617) 638-4286 电子邮件：hakiyama@bu.edu