基因转录受组蛋白转化后修饰(PTM),染色质蛋白(CAPS)和DNA甲基化(DNAME)之间的复杂相互作用的调节。绘制其基因组位置并检查这些染色质元素之间的关系是一种强大的疾病机制方法,从而可以发现新型的生物标志物和治疗剂。领先的表观基因组映射技术(例如,Chip-Seq,Cut&Run)依靠DNA碎片来隔离感兴趣的区域以在短读平台上进行测序(例如Illumina)。这种策略导致有关周围DNA的上下文信息的实质性丧失,从而排除了单个DNA分子上多个同时出现的表观基因组特征的鉴定。相比之下,长阅读测序(LRS)平台能够从单个分子(通常> 10KB)进行很长的读取,从而使单个分子上的特征之间的关系可以用于解决混合群体内的异质性。在这里,我们报告了一种强大的多摩变方法,该方法利用LRS在单个测定中同时介绍了组蛋白PTMS(或CAPS),DNAME和父母单倍型。
DNA N 6 -甲基腺嘌呤(6mA)修饰在生物体中广泛存在,在调控细胞过程方面发挥着重要的功能性作用。作为生物湿法冶金的模式生物,Acidithiobacillus ferrooxidans在酸性条件下可以通过氧化亚铁(Fe 2+ )和各种还原性无机硫化物(RISC)获取能量。为探讨A. ferrooxidans中基因组DNA甲基化与两种氧化代谢途径切换之间的联系,利用6mA-IP-seq技术评估了不同条件下培养的A. ferrooxidans基因组中的6mA景观。在Fe 2+和RISCs氧化条件下分别鉴定出214个和47个6mA的高置信度峰(P < 10 − 5 ),表明在Fe 2+氧化条件下基因组甲基化程度更高。 6mA在转录起始位点(TSS)处表达下降,并且在两种氧化条件下均频繁出现在基因体中。此外,基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析显示,7条KEGG通路被映射到差异甲基化基因上,大多数差异甲基化基因在氧化磷酸化和代谢途径中富集。选择了14个基因研究甲基化差异对mRNA表达的影响。除petA-1外,13个基因随着甲基化水平的增加表现出mRNA表达下降。整体而言,两种条件下6mA甲基化富集模式相似,但富集的途径有所不同。基因甲基化水平上调与表达下调的现象表明6mA的调控机制与Fe 2+和RISCs氧化途径之间存在潜在关联。
摘要:最近发现DNA N6-甲基趋化(6MA)在基因中扮演调节作用,该作用与真核物种的各种生物学过程联系起来。6MA甲基转移酶的功能鉴定对于理解表观遗传6MA甲基化的潜在分子机制至关重要。据报道,甲基转移酶METTL4可以催化6ma的甲基化。但是,METTL4的功能在很大程度上未知。在这项研究中,我们旨在研究Bombyx Mori同源性METTL4(BMMETTL4)在鳞翅目模型昆虫中的作用。通过使用CRISPR-CAS9系统,我们在蚕中对BMMETTL4进行了体积突变,发现BMMETTL4的破坏会导致蚕胚晚期的发育缺陷和随后的致死性。我们进行了RNA-Seq,并确定了BMMETTL4突变体中有3192个差异表达的基因,其中包括1743个上调和1449个下调的基因。基因和基因组分析的基因本体论和京都百科全书表明,涉及分子结构,几丁质结合和丝氨酸水解酶活性的基因受BMMETTL4突变的显着影响。我们进一步发现,表皮蛋白基因和胶原蛋白的表达明显降低,而胶原酶高度增加,这对异常的胚胎和蚕的孵化性降低了。采取了这些结果,这些结果表明6MA甲基转移酶BMMETTL4在调节蚕的胚胎发育中的关键作用。
收到2022年12月4日; 2023年8月3日接受;出版于2023年8月17日作者隶属关系:1分子环境微生物学实验室,韩国首尔韩国环境科学与生态工程系,韩国共和国。*信件:Woojun Park,WPARK@韩国。AC。KR关键词:抗生素耐药性;生物膜; DNA甲基化;外排泵;表观遗传学;甲基转移酶。缩写:AR,抗生素耐药性; Azi,阿奇霉素; CCCP,羰基氰化物3-氯苯基氢气; Col,Colistin; Ery,红霉素; Etbr,溴化乙锭; Gen,庆大霉素; IPD,脉间持续时间; Kan,Kanamycin; 6mA,n -6-甲基丹宁; 4MC,n -4-甲基环肽; 5MC,5-甲基胞嘧啶; MEM,MeropeNem; MIC,最小抑制浓度; MTase,甲基转移酶;小睡,核苷相关蛋白;也不,诺福路吗? OMV,外膜外囊泡; PMB,多粘蛋白B; rif,利福平; RM,限制修改; SEM,扫描电子显微镜; SMRT-SEQ,单分子实时测序; TF,转录因子; TMP,甲氧苄啶。†这些作者对此工作数据声明也同样贡献:本文或通过补充数据文件中提供了所有支持数据,代码和协议。本文的在线版本可以使用三个补充数据和六个补充表。001093©2023作者
Power Supply: 10 to 40 VDC (15 to 24 VDC Recommended) for 4 to 20 mA or 0 to 5 VDC Outputs 15 to 40 VDC (15 to 24 VDC Recommended) for 0 to 10 VDC Outputs 12 to 28 VAC (Requires a separate pair of shielded wires) for 0 to 5 VDC Outputs 15 to 28 VAC (Requires a separate pair of shielded wires) for 0 to 10VDC Outputs Power Consumption: 100 mA maximum DC: 4 to 20 mA Output (<30mA typical) 75 mA maximum DC: 0 to 5 VDC or 0 to 10 VDC Outputs (6mA typical) 1.9 VA maximum AC: 0 to 5 VDC or 0 to 10 VDC Outputs (0.2VA typical) Outputs: 4 active outputs plus 1 passive temperature sensor Volts........................0 to 5 VDC or 0 to 10VDC, Impedance >10KΩ (OUT1, OUT2, OUT3, OUT4) Current....................4 to 20 mA, Impedance <500Ω @ 24 VDC (OUT1, OUT2) Resistance..............Setpoint, 5 VDC @ 5 mA max (OUT3, OUT4) - Factory selected per application Relay Contact.........N.O., 500 mA @ 24 VDC max Temp.传感器.........被动RTD或热敏电阻(temp+/temp-)输入:外部覆盖.... 5 VDC或24 VDC/VAC/vac外部传感器...... 10K-2 Themistor单独购买。Wired 25' max from sensor Sensing Elements for Active Outputs and Display: Temperature............10K-2 Thermistor Humidity..................Capacitive Polymer, ±2%RH Sensing Element for Resistive Temp Output: Thermistor or RTD Mounting: Standard 2”x4” junction box, European junction box
1 Polsky J-Y,Moubarac J-C,Garriguet D.,(2020年)。加拿大统计局加拿大量化超级加工食品的消费。2 Monteiro CA,Moubarac J-C,Cannon G,NG SW,PopkinB。超级加工产品在全球食品系统中占主导地位,肥胖症评论,2013年; 14(S2):21–8。3加拿大政府,(2019年)。 加拿大成年人中慢性疾病的患病率。 4加拿大政府,(2011年)。 加拿大的糖尿病:从公共卫生的角度来看,事实和数字,第5章:儿童和青少年的糖尿病。 5个统计局,(2021年)。 儿童和青少年的血压,2016 - 2019年。 6Małachowskaa,JeêSka-Zychowicz M.检查儿童食品体验是否有助于更好地了解成年后的食物选择? 营养,2021年3月; 13(3):983。 7 Hastings等,(2003)。 审查食品促进儿童影响的研究,格拉斯哥,斯特拉斯克莱德大学,食品标准局。 8 McDermott L,Stead M,Hastings G.,(2007年)。 案例研究4:一种营销策略,旨在审查食物促进对儿童的影响。 9办公室De La Protection du Consommateur andÉditionsProtégez-Vous(2008)。 vos enfants et la pub。 [仅在法语中] 10维持:更好的食物与农业联盟(2004年)。 儿童食品和健康:为什么要迫切需要立法来保护儿童免受不健康的食物广告和促销。 11 Gootman,Appleton J,McGinnis,J Michael和Kraak,Vivica I.,(2006年)。 对儿童和青少年的食品营销:威胁或机会? 19 S.A.3加拿大政府,(2019年)。加拿大成年人中慢性疾病的患病率。4加拿大政府,(2011年)。 加拿大的糖尿病:从公共卫生的角度来看,事实和数字,第5章:儿童和青少年的糖尿病。 5个统计局,(2021年)。 儿童和青少年的血压,2016 - 2019年。 6Małachowskaa,JeêSka-Zychowicz M.检查儿童食品体验是否有助于更好地了解成年后的食物选择? 营养,2021年3月; 13(3):983。 7 Hastings等,(2003)。 审查食品促进儿童影响的研究,格拉斯哥,斯特拉斯克莱德大学,食品标准局。 8 McDermott L,Stead M,Hastings G.,(2007年)。 案例研究4:一种营销策略,旨在审查食物促进对儿童的影响。 9办公室De La Protection du Consommateur andÉditionsProtégez-Vous(2008)。 vos enfants et la pub。 [仅在法语中] 10维持:更好的食物与农业联盟(2004年)。 儿童食品和健康:为什么要迫切需要立法来保护儿童免受不健康的食物广告和促销。 11 Gootman,Appleton J,McGinnis,J Michael和Kraak,Vivica I.,(2006年)。 对儿童和青少年的食品营销:威胁或机会? 19 S.A.4加拿大政府,(2011年)。加拿大的糖尿病:从公共卫生的角度来看,事实和数字,第5章:儿童和青少年的糖尿病。5个统计局,(2021年)。 儿童和青少年的血压,2016 - 2019年。 6Małachowskaa,JeêSka-Zychowicz M.检查儿童食品体验是否有助于更好地了解成年后的食物选择? 营养,2021年3月; 13(3):983。 7 Hastings等,(2003)。 审查食品促进儿童影响的研究,格拉斯哥,斯特拉斯克莱德大学,食品标准局。 8 McDermott L,Stead M,Hastings G.,(2007年)。 案例研究4:一种营销策略,旨在审查食物促进对儿童的影响。 9办公室De La Protection du Consommateur andÉditionsProtégez-Vous(2008)。 vos enfants et la pub。 [仅在法语中] 10维持:更好的食物与农业联盟(2004年)。 儿童食品和健康:为什么要迫切需要立法来保护儿童免受不健康的食物广告和促销。 11 Gootman,Appleton J,McGinnis,J Michael和Kraak,Vivica I.,(2006年)。 对儿童和青少年的食品营销:威胁或机会? 19 S.A.5个统计局,(2021年)。儿童和青少年的血压,2016 - 2019年。6Małachowskaa,JeêSka-Zychowicz M.检查儿童食品体验是否有助于更好地了解成年后的食物选择?营养,2021年3月; 13(3):983。7 Hastings等,(2003)。审查食品促进儿童影响的研究,格拉斯哥,斯特拉斯克莱德大学,食品标准局。8 McDermott L,Stead M,Hastings G.,(2007年)。 案例研究4:一种营销策略,旨在审查食物促进对儿童的影响。 9办公室De La Protection du Consommateur andÉditionsProtégez-Vous(2008)。 vos enfants et la pub。 [仅在法语中] 10维持:更好的食物与农业联盟(2004年)。 儿童食品和健康:为什么要迫切需要立法来保护儿童免受不健康的食物广告和促销。 11 Gootman,Appleton J,McGinnis,J Michael和Kraak,Vivica I.,(2006年)。 对儿童和青少年的食品营销:威胁或机会? 19 S.A.8 McDermott L,Stead M,Hastings G.,(2007年)。案例研究4:一种营销策略,旨在审查食物促进对儿童的影响。9办公室De La Protection du Consommateur andÉditionsProtégez-Vous(2008)。vos enfants et la pub。[仅在法语中] 10维持:更好的食物与农业联盟(2004年)。儿童食品和健康:为什么要迫切需要立法来保护儿童免受不健康的食物广告和促销。11 Gootman,Appleton J,McGinnis,J Michael和Kraak,Vivica I.,(2006年)。对儿童和青少年的食品营销:威胁或机会?19 S.A.国家科学院出版社。12 Harris J,Heard A,Schwartz BS。,(2014年)。年龄较大,但仍然容易受到伤害:所有儿童都需要保护不健康的食品营销,耶鲁·鲁德食品政策中心。13 Valkenburg PM,Cantor J.2001年1月1日,《应用发育心理学杂志》,将儿童发育成消费者; 22(1):61–72。14 Kunkel D.评论对儿童对广告有说服力的意图的理解的评论不可估量,儿童和媒体杂志,2010年2月1日; 4(1):109–17。15 John Dr。儿童的消费者社会化:回顾性研究二十五年的研究,《消费者研究杂志》,1999年; 26,183–213。 16 G. 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