强大的研究数据管理解决方案,包括基因组数据的pb迁移到可扩展的云基础架构(AWS S3和GALT)。与多学科团队合作,我增强了AGRF的遗传测序基础架构整合了新的生物信息学工作流并确保遵守监管标准。我在编码和部署,减少系统停机时间以及LED培训计划方面建立了最佳实践,以建立团队持续集成和数据治理的能力。这些努力确保了数据可靠性,优化的工作流以及支持AGRF提供高质量基因组服务的使命。
AGRF 开展的所有临床工作均严格遵循 ISO15189 的要求。AGRF Ltd 已获得国家测试机构协会 (NATA) 在医学测试领域的认证(范围:体质遗传变异调查 - 诊断测试。遗传(种系)DNA/RNA 变化的全外显子组测序研究)。员工和分析流程遵循标准操作程序,该程序定义了责任和质量检查以达到报告的标准。在定期审查和内部审计期间,我们会监控合规性。工作由具有相关资格的人员监督,并在进行过程中和完成后进行检查,以确保其符合必要的 ISO15189 标准。
整个质粒和Amplicon Express的测序配置为150bp配对的末端。因此,索引ED扩增子的长度应在150-250bp之间(这是靶向扩增子的长度减去NEX TERA标签)。在同一测序运行中具有不同大小的放大器,例如两个极端:150bp和250bp,可能会产生不同数量的测序读数。这是由于较小尺寸群集的扩增子在流动池上更有效地簇,从而导致其在测序池中较高的表示(从而产生更多数据)。AGRF将采用汇总偏移量来解释大小的差异,并最大程度地减少测序读数的可变性。短PCR扩增子不应包含任何内部修饰,荧光团或深色淬火器。服务仅在珀斯可用。4.0样本提交要求
德比西·阿拉巴先生是一位公共政策、创新和战略专家,专注于食品、环境和创业的未来。他目前是伦敦帝国理工学院环境政策中心的客座研究员。他还担任蒙彼利埃马拉博专家小组成员——一个由全球杰出专家组成的小组——共同致力于加强非洲和欧洲政府对非洲国家和地区农业发展和粮食安全优先事项的支持。此前,他曾担任非洲绿色革命论坛 (AGRF) 的常务董事,还曾担任国际热带农业中心 (CIAT) 的非洲地区主任,该中心是国际农业研究联盟 CGIAR 的成员。他还曾担任尼日利亚农业和农村发展部部长的环境政策高级技术顾问。