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二甲双胍调节骨髓基质细胞在糖尿病小鼠中加速骨骼愈合
抽象映射神经递质身份对神经元是理解神经系统中信息流的关键。它还为研究神经元身份特征的发展和可塑性提供了宝贵的入口点。在秀丽隐杆线虫神经系统中，神经纤维 - 米特的身份在很大程度上是通过编码神经递质生物合成酶或转运蛋白的神经递质途径基因的表达模式分析来分配的。但是，其中许多作业都依赖于可能缺乏相关顺式调节信息的多拷贝记者转基因，因此可能无法提供神经递质使用情况的准确图片。我们分析了秀丽隐杆线虫中所有主要类型的神经递质（谷氨酸，乙酰胆碱，GABA，5-羟色胺，多巴胺，多巴胺，酪胺和章鱼胺）中所有主要类型的神经递质的16个CRIS/CAS9工程敲入报告菌株的表达模式。我们的分析揭示了这些神经递质系统在神经元和神经胶质中以及非神经细胞中的新颖位点，最著名的是在性腺细胞中。所得表达的地图集定义了可能仅是神经肽的神经元，它基本上扩展了能够共同传播多个神经递质的神经元的曲目，并鉴定了单胺能神经植物的新颖位点。此外，我们还观察到单胺能合成途径基因的异常共表达模式，这表明存在新型单胺能发射器。我们的分析导致迄今为止，神经递质使用量最广泛的全动物范围图构成了最广泛的全动物范围图，为更好地理解秀丽隐杆线虫中神经元通信和神经元身份规范铺平了道路。
人类细胞图谱的计算技术
当研究人员收集单细胞数据并将其细化为细胞图谱时，一项关键任务是对每种细胞类型进行表征和标记或注释。“这通常是一项非常耗时、繁重的任务，只有少数生物学专家才能完成，”计算生物学家、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所 HCA 细胞注释平台负责人 Evan Biederstedt 说。研究人员已经开发了几种自动标记细胞的程序，但这些工具并不总是能得出相同的答案。popV 就是个例子。它的功能简单但功能强大：它将八种自动细胞注释工具整合到一个平台中，并且可以在有更多工具可用时添加 1 。“这是一个加速工具，”联合开发者、加州大学伯克利分校的计算生物学家 Can Ergen 说。拥有新鲜生成的单细胞 RNA 测序数据的研究人员可以将其加载到 popV 中，八种方法中的每一种都会对细胞身份进行“投票”——因此该工具的全名是 popular Vote。对于任何给定的细胞，用户可以检查所有八种注释是否一致，或者对可能的身份是否存在分歧投票。如果这些方法对某种细胞类型的判定一致，研究人员就可以对其身份充满信心；如果存在分歧，可能就没那么自信了。为了量化这一点，popV 提供了“不确定性分数”，以便用户知道在其鉴定中可以给予多大信任度。“这真的很酷，”Regev 说。PopV 使用来自 Tabula Sapiens 的数据进行训练，Tabula Sapiens 是一张人类细胞图谱，涵盖了近 500,000 个细胞，代表了 15 个人的 24 个器官。研究人员随后在来自人类肺细胞图谱 2 的数据库上对其进行了测试；根据最终论文，popV 的预测与大多数注释一致，比任何单个计算注释器都更准确。Biederstedt 计划将 popV 整合到 HCA 细胞注释平台用户界面中，科学家将能够在对细胞类型进行分类时查看 popV 的预测。“它确实让社区更接近自动细胞注释的梦想，并将极大地帮助研究人员，”他说。一旦研究人员发现了一种有趣的细胞类型或状态，他们可能会想知道它还会出现在哪里。Regev 和她的同事开发了 SCimilarity 来回答这个问题。该软件可以获取感兴趣的细胞概况
全球可再生能源地图集倡议
过去十年来，《全球可再生能源地图集》得到了广泛应用。该倡议收集了 1000 多张可再生能源地图，涵盖太阳能、风能、生物能、地热能、水电和海洋能。该倡议还制作了多份场地评估报告，确定了布基纳法索、毛里塔尼亚、马里、萨尔瓦多等国家开发公用事业规模太阳能和风能的潜力。该倡议还评估了西非、拉丁美洲和海湾合作委员会国家等地风能和太阳能投资的潜力。《全球可再生能源地图集》已成为 IRENA 的重要资产，有助于分析可再生能源市场、电网整合和稳定性以及可再生能源路线图。该倡议提供了确凿的证据，证明在传统电力系统和离网情况下增加可再生能源是可行、经济且高效的。
Atlas的建筑可扩展分析基础架构
摘要。我们探讨了采用云代表工具和原理，以锻造灵活和可扩展的基础架构，旨在支持分析框架 - 在高光度大型强调撞机（HL-LHC）时代为Atlas实验开发的框架。该项目最终建立了一个联合平台，整合了来自各种提供商的Kubernetes群集，例如Tier-2中心，第3层中心，以及来自国家科学基金会项目的Iris-Hep可伸缩系统实验室。一个统一的接口进行了简化容器化应用程序的管理和缩放。通过与分析效率集成，使Jupyter / Binder笔记本电脑和DASK工人的溢出到TIER-2资源来实现增强的系统可伸缩性。我们调查了“拉伸”（在大型网络）集群模式的灵活部署方案，包括集中式的“灯光管理”模型，Kubernetes服务的远程管理以及完全自主的站点管理的群集方法，以适应各种操作和安全要求。该平台在多群集演示器中展示了其e ffi cacy，以使用Co ff ea，servicex，uproot和dask以及rdataframe等工具进行低延迟分析和高级工作流程，并说明了其支持各种处理框架的能力。该项目还为Atlas软件和计算登机事件提供了强大的用户培训基础架构。
生物多样性数据经理（NBN地图集）...
薪水：35,000英镑至45,000英镑，具体取决于经验位置：完全遥远，在家工作，有一些旅行。合同：至2025年3月31日，有可能延长。考虑的借调。小时：每周35小时。可用的灵活工作。我们将考虑合适的候选人的兼职工作（每周至少28小时）。截止日期：2024年2月15日上午9点面试：22，23 Rd或2月26日（TBC）您能想象自己领导着英国国家生物多样性数据存储库NBN Atlas的战略发展吗？此角色将“大局”战略计划和利益相关者的参与与“动手”数据管理和分析相结合。在NBN信托基金会，我们的使命是“使数据起作用”。如果这引起您的共鸣，这可能是您的完美工作。来加入我们的小型，友好的团队，在动员数据中发挥着至关重要的作用，以对我们的自然和地球的健康产生真正的影响。
大鼠脑的Waxholm空间大图
将许多核分开并封装为描述的鲁棒和可再现的起点。在划定4版的灰质区域中，SMRI/DTI数据提供的信号强度差异不足以识别神经结构的变化。在这些区域中，通过从组织学部分图像中注册到地图集的信息来确定边界的位置，例如，从其他参考地图集中显示了细胞结构组织，或从包含立体坐标的已发表的地图中显示。以这种方式，WHS大脑大脑Atlas V4的描述建立在几种解剖信息的来源上。基于对比的地标通常是可重现的，并被认为是定义大脑区域的有意义的标准，其他标准，如示例
统一的DRG和TG参考地图集
资金：Burroughs Wellcome基金；丽塔·艾伦基金会；偏头痛研究基金会；爱德华兹（Edwards）疼痛研究中的博士生；巴里家庭哈佛干细胞研究所奖； Ninds U19NS130617; Ninds R01NS119476; Ninds U19NS130608; Ninds U19NS130607; NIDA DP1DA054343; NEI U01EY034709; Teva Pharmaceuticals；
