背景:尿路感染(UTI)是社区和住院患者中最普遍的感染。目标:本研究旨在研究伊朗德黑兰的UTI药物中当前的抗菌敏感性模式。方法:这项回顾性研究分析了2019年至2020年从住院患者那里收集的9836个尿液样本。根据临床和实验室标准研究所指南测试了对常用抗生素的抗体敏感性。结果:基于发现,大肠杆菌是UTI的最普遍的病因(72.3%),其次是克雷伯氏菌属。(13.4%),假单胞菌(4.8%),acinetobacter spp。(2.8%),Andotherspecies(6.7%)。,943酶(97%)属于革兰氏阴性杆菌;然而,革兰氏阳性球菌有32例(3.05%)。大肠杆菌对amikacin,硝基氟烷,庆大霉素,imipenem,andcefoperazonewerewerewerewere8.4%,87.5%,68.3%,65.9%和62.6%的易感率。klebsiella spp的感应率。氨基氨酸,亚硝基氟氨酸和丙咪成的分离株分别为87.6%,71.5%和68.9%。结论:本研究的结果表征了伊朗抗生素的滥用。伊朗监测研究将帮助临床医生选择最合适的经验治疗方法,并防止抗性生物引起的感染。
抗生素耐药性ESKAPE(屎肠球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和肠杆菌属)病原菌是对人类健康的全球威胁。ESKAPE病原菌是院内感染中最常见的机会性致病菌,相当一部分临床分离株对常规抗菌治疗不敏感。因此,能够有效对抗ESKAPE病原菌的创新治疗策略将带来巨大的社会效益和经济效益,并减轻成千上万患者的痛苦。在这些策略中,CRISPR(成簇的规律间隔的短回文重复序列)系统由于其高特异性而受到了格外的关注。遗憾的是,目前还没有基于CRISPR系统的直接抗感染治疗方法。本文就CRISPR-Cas系统在ESKAPE病原体研究中的应用进行综述,旨在为理想的新型药物研究提供方向,为解决后抗生素时代多重耐药菌(MDR)引起的一系列问题提供参考,但多数研究距离临床应用还有一定的距离。
根据美国疾病控制与预防中心 (CDC) 2019 年《抗生素耐药性 (AR) 报告》,美国每年发生超过 280 万例抗生素耐药性感染,导致超过 35,000 人死亡 1 。CDC 根据对人类健康的三个关注程度将抗生素耐药性威胁分为:紧急、严重和令人担忧。紧急威胁包括耐碳青霉烯类肠杆菌 (CRE)、耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 (CRAB) 和耳念珠菌。严重威胁包括产超广谱β-内酰胺酶 (ESBL) 的肠杆菌和多重耐药 (MDR) 铜绿假单胞菌 1 。令人担忧的威胁包括耐红霉素 A 组链球菌 (GAS) 和耐克林霉素 B 组链球菌 (GBS) 1 。这些微生物都代表着对公共卫生的新威胁,因为它们可导致高死亡率的感染,具有高度传染性,并且很有可能在社区传播。针对这些微生物的治疗选择有限,而且可能还需要数年时间才能出现新的治疗药物。
摘要 病例介绍。一名 13 岁女性患者,无已知合并症,因发热十天、寒战、每日四次腹泻和呕吐而就诊,服用对乙酰氨基酚治疗。就诊前四天,患者感到乏力、意识模糊和行走困难。她被其母亲带到医疗机构。治疗。她因疑似沙门氏菌病、脑炎、水电解质失衡、急性肾损伤和急性胃肠炎伴严重脱水而被送往二级医院。她接受了肠外补液和抗生素治疗,并因呼吸窘迫需要机械通气被转诊至三级医院,在那里获得了伤寒沙门氏菌血培养阳性。结果。患者因脓毒症出现全身炎症反应综合征,用血管活性胺治疗;入院第16天患者出现心动过速、发热,血培养多重耐药鲍曼不动杆菌阳性,出现心肌炎、神经功能恶化(格拉斯哥评分8分),并出现多系统衰竭,住院32天后死亡。
耐多药细菌病原体的迅速出现和蔓延要求开发出既高效又不会引起毒性或耐药性的抗菌剂。在此背景下,我们设计并合成了两亲性树枝状大分子作为抗菌候选药物。我们报道了由长疏水烷基链和叔胺封端的聚(酰胺胺)树枝状大分子组成的两亲性树枝状大分子AD1b对一组革兰氏阴性细菌(包括耐多药大肠杆菌和鲍曼不动杆菌)表现出的强效抗菌活性。AD1b 在体内表现出对抗耐药细菌感染的有效活性。机制研究表明,AD1b 靶向膜磷脂磷脂酰甘油 (PG) 和心磷脂 (CL),导致细菌膜和质子动力破坏、代谢紊乱、细胞成分泄漏,并最终导致细胞死亡。总之,特异性地与细菌膜中的 PG/CL 相互作用的 AD1b 支持使用小型两亲性树枝状聚合物作为针对耐药细菌病原体的有希望的策略并解决全球抗生素危机。
耐多药细菌病原体的迅速出现和蔓延要求开发出既高效又不会引起毒性或耐药性的抗菌剂。在此背景下,我们设计并合成了两亲性树枝状大分子作为抗菌候选药物。我们报道了由长疏水烷基链和叔胺封端的聚(酰胺胺)树枝状大分子组成的两亲性树枝状大分子AD1b对一组革兰氏阴性细菌(包括耐多药大肠杆菌和鲍曼不动杆菌)表现出的强效抗菌活性。AD1b 在体内表现出对抗耐药细菌感染的有效活性。机制研究表明,AD1b 靶向膜磷脂磷脂酰甘油 (PG) 和心磷脂 (CL),导致细菌膜和质子动力破坏、代谢紊乱、细胞成分泄漏,并最终导致细胞死亡。总之,特异性地与细菌膜中的 PG/CL 相互作用的 AD1b 支持使用小型两亲性树枝状聚合物作为针对耐药细菌病原体的有希望的策略并解决全球抗生素危机。
摘要:CRISPR-Cas 系统是一种原核生物免疫系统,不仅在细菌和古菌中广泛存在,而且最近也在人类生物学研究和应用中得到应用。迄今为止,许多研究都利用了合成的 sgRNA 和 CRISPR 核酸酶 Cas9,但阵列处理核酸酶的发现现在允许在异源宿主以及具有内源系统的生物体中使用更紧凑、天然的 CRISPR 阵列。不幸的是,多重天然 CRISPR 阵列的构建在技术上仍然具有挑战性、成本高昂和/或耗时。这种限制阻碍了在天然和异源宿主中涉及天然 CRISPR 阵列的研究。为了解决这个问题,我们提出了一种组装 CRISPR 阵列的方法,该方法简单、快速、经济实惠且高度可扩展我们用 1 天的工作时间组装了 9 间隔阵列。我们利用这种方法来利用高能力细菌 Acinetobacter baylyi 的内源性 CRISPR-Cas 系统,结果表明,虽然单个间隔物并不总是能够完全有效地阻止通过天然能力获取 DNA,但多重天然 CRISPR 阵列可以实现几乎完全的 DNA 排除和基因组编辑,包括对两者的多个目标。除了展示一种将有益于各种应用的 CRISPR 阵列组装方法外,我们还发现了一种潜在的双赢策略,用于在天然能力的 A. baylyi 中平衡 CRISPR 防御与 DNA 获取。
沿海和河口环境处于内源性和外生压力下,危害居住的生物群的生存和多样性。多个(a)生物应激源和Holobiont相互作用的可能协同作用的信息在易北河河口大部分缺失,但对于估计对动物生理学的不可预见的影响至关重要。在这里,我们试图利用宿主转录RNA-seq和Gill Mucus Microbial 16S rRNA MetabarCoding数据,并在网络分析方法中结合了生理和非生物测量方法,以反应多个压力源对少数压力源对少数压力的影响,属于Lar eStuaries的Juevenile Sander Lucioperca。我们发现以g组织特异性转录响应为特征的中鞘区域与渗透传感和组织重塑相匹配。肝动物转录组强调,来自高度浊度区域的Zander经历了受损的身体状况支持的饥饿。潜在的致病细菌,包括Shewanella,acinetobacter,Aeromonas和Chryseobacterium,沿淡水过渡和氧气最小区域占据了吉尔微生物组。它们的发生与宿主ill中强烈的适应性和先天的转录免疫反应相吻合,并增强了肝组织中的能量需求,从而支持其潜在的致病性。总体而言,我们证明了信息从将OMIC数据整合到鱼类生物监测到鱼类的生物监测并指出具有疾病潜力的细菌物种所获得的信息。
o生牛奶可以被多种微生物污染(Ledenbach和Marshall,2009年)。挤奶后,乳酸细菌(包括乳酸菌,乳酸杆菌,白细胞杆菌,肠球菌和链球菌)立即在牛奶中发现(Wouters等,2002,Machado等,2017,2017,Fusco等,2020)。这些生物中的许多生物在发酵乳制品中起重要的功能作用(Wouters等,2002),但如果不保留牛奶,这些生物可能会导致牛奶中的损坏。一旦牛奶被冷却和冷藏,精神营养的生长(包括芽孢杆菌,微球菌,假单胞菌,动物杆菌,气球杆菌等)受到青睐,并且它们成为存在的主要微生物(Muir,2011,Quigly,2011,Quigley,2011,Quigley et al.,2013年,2013年,YAA)。o最近的一项评论指出,生奶的菌群主要由革兰氏阴性菌(Pseudomonas,serratia,serratia,eeromonas和entobacter)和革兰氏阳性孢子形成剂组成,芽孢杆菌(Bacillus,bacillus,aneurinibacillus,brevibaCillus,brevibacillus and geobacacilus and geobacIllus and GeobacIllus and Geobacillus and divebaCillus al al ail ail ail al o Another review comments that “Storage of raw milk at refrigerator temperature for several days can lead to growth of psychrotrophic species of several bacterial genera: Aerococcus , Bacillus , Lactobacillus , Leuconostoc , Microbacterium , Micrococcus , Propionibacterium , Proteus , Pseudomonas , Streptococcus , coliforms, and others (Erkmen and Bozoglu,2016年)。 o“生牛奶中形成的孢子细菌主要是芽孢杆菌属。 (例如B. cereus,B。licheniformis,B。megaterium和B. uttilis)。 梭状芽胞杆菌。 在低水平的生牛奶中存在。o Another review comments that “Storage of raw milk at refrigerator temperature for several days can lead to growth of psychrotrophic species of several bacterial genera: Aerococcus , Bacillus , Lactobacillus , Leuconostoc , Microbacterium , Micrococcus , Propionibacterium , Proteus , Pseudomonas , Streptococcus , coliforms, and others (Erkmen and Bozoglu,2016年)。o“生牛奶中形成的孢子细菌主要是芽孢杆菌属。(例如B. cereus,B。licheniformis,B。megaterium和B. uttilis)。梭状芽胞杆菌。在低水平的生牛奶中存在。o “A wide variety of genera including Gram-negative genera ( Pseudomonas, Aeromonas, Alcaligenes, Acromobactor Acinetobacter, Flavobacterium, Chryseobacterium, Enterobacteriaceae such as Serratia, Hafnia, Klebsiella, Enterobacter and Rahnella ) and Gram-positive genera ( Bacillus,在生乳中经常发现梭状芽孢杆菌,小杆菌,微球菌,葡萄球菌,微区,乳酸菌和乳酸杆菌)(Vithanage等,2016)。生牛奶中孢子形成细菌的种群季节性变化。芽孢杆菌和梭状芽孢杆菌。在冬季收集的原始牛奶中的水平高于夏季,因为在冬季,奶牛躺在孢子污染的床上用品材料上,并消耗含孢子的青贮饲料”(Erkmen and Bozoglu,2016年)。o假单胞菌属。被认为是牛奶变质的最常见原因(Quigley等,2013)。serratia liquefaciens也可以在生乳中造成变质(Bagliniere等,2017)。o由于乳糖是牛奶中的主要碳水化合物,因此可以水解乳糖的微生物(具有乳糖酶或β-半乳糖苷酶等酶的生物)比无法(Erkmen and Bozoglu,2016年)具有优势。
16S rRNA基因的V1-V2区域有效地分化了Rickettsia Africae和Rickettsia Aeschlimannii与其他立克物种,以及Coxiella insosymbionts与Coxiella burnetii。相反,这些物种的V3-V4区域序列无法明确区分。coxiella内共生体在AM中最常见。Gemma和Rh。pulchellus,而弗朗西斯拉内共生体则占主导地位;两者都主要定位在唾液腺中。高丰富的Coxiella内共生体和假单胞菌与两者中的Rickettsia病原体的缺失或低丰度有关。Gemma和Rh。pulchellus,提示这些微生物之间的竞争相互作用。此外,除了唾液腺外,proteus mirabilis是人类泌尿道的机会性病原体,主要是在透明质的壁虱中,除唾液腺外,唾液腺中最丰富。此外,我们在所有tick组织中检测到了杆菌,假单胞菌和corynebacterium属,这支持了这些细菌可能在骆驼血和壁虱之间循环的假设。唾液和血淋巴通常比唾液腺和中肠含有更多的细胞外细菌。