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合成基因电路：设计，实施和应用
手稿于2021年8月2日收到； 2021年10月27日修订； 2021年11月30日接受。出版日期，2021年12月31日；当前版本的日期，2022年5月19日。这项工作得到了国家科学基金会（NSF）的支持。Andrew Lezia的工作得到了国家科学基金会研究生研究奖学金计划的支持，该计划是Grant DGE-2038238。（Andrew Lezia和Arianna Miano对这项工作也同样贡献。）（通讯作者：Andrew Lezia。）Andrew Lezia和Arianna Miano在加利福尼亚大学圣地亚哥分校的生物工程系，美国加利福尼亚州92093，美国加利福尼亚州92093（电子邮件：andrewlezia@gmail.com）。 Jeff Hasty曾在加利福尼亚大学圣地亚哥分校，分子生物学科，分子生物学科和Biocircuits Institute，分子生物学科和Biocircuits Institute，加利福尼亚州圣地亚哥，加利福尼亚州，美国加利福尼亚州92093。Andrew Lezia和Arianna Miano在加利福尼亚大学圣地亚哥分校的生物工程系，美国加利福尼亚州92093，美国加利福尼亚州92093（电子邮件：andrewlezia@gmail.com）。Jeff Hasty曾在加利福尼亚大学圣地亚哥分校，分子生物学科，分子生物学科和Biocircuits Institute，分子生物学科和Biocircuits Institute，加利福尼亚州圣地亚哥，加利福尼亚州，美国加利福尼亚州92093。
亚历山大·霍夫曼（Alexander Hoffmann） - 信号系统实验室 - UCLA
ahoffmann@ucla.edu叙述我是UCLA的微生物学和免疫学教授，信号系统实验室的PI，自2013年以来，自2013年以来，定量和计算生物科学研究所（QC Bio）（QC Bio）主任，该研究所的教育和培训跨越了50多个教育和培训，该计划是该教育和培训的培训，并培训了学生，并毕业于研究生，并毕业于研究生。我拥有物理学和动物学（剑桥大学）的本科学位，并归功于我的博士学位培训归功于Robert Roeder（Rockefeller University）在生物化学和分子生物学领域，以及我对免疫信号和系统免疫学的David Baltimore（MIT和Caltech）的博士后培训。我开发了计算生物学专业知识作为博士后，以及我在加州大学，UCSD和UCLA的许多计算学员和同事。我的实验室研究重点是控制先天和适应性免疫反应的分子和细胞机制。一个中心主题是这些网络的动力学决定了功能特异性。i首先阐明了“时间代码”的概念，该概念在信号传导字段中产生了广泛的影响。我的实验室揭示了如何通过大量反馈和其他调节基序“编码”免疫反应信号传导动力学。我们已经表明，在疾病环境中，动力学发生了变化，并且可能是针对药物的。我们已经阐明了如何通过基因调节网络解码信号动力学，以控制刺激特异性基因的表达，细胞命运决策，从而控制了免疫细胞种群动力学。目前，我指挥NIH-和NSF资助的基因组学（B.I.G.）我们的系统生物学研究正在产生多功能，上下文依赖性巨噬细胞和产生抗体库的B细胞的预测细胞模型。我旨在推进跨学科研究和教育，以利用技术，计算和定量科学的机会。到目前为止，我已经在几个层面的生物科学中追求了这一目标：（i）通过在实验室中开发系统生物学方法，重点关注控制免疫的信号和基因调节网络，（II）通过通过UCSD的生物学家研究所（2009年）和Sanivo Biositios for Systems Biolosios for Systems Biolosios for Systems Biolosios for Systems Biolosios for Systems Biolosios for Systems Biolosios for Systems Biogios和2010年，以及2010年，以及（2010年），以及促进系统生物学，以及（QCB）在UCLA（2014）涉及广泛的教师招聘，空间翻新，中心和计划赠款以及教育计划，例如在UCLA（III）的多轨计算生物学专业和次要的教育计划，通过建立和/或改造UCSD的研究生培训，例如UCSD的生物信息和系统生物学（2009年），诸如UCSD加州大学洛杉矶分校的生物信息学研究生计划（2014年）和生物医学大数据培训计划（2015年）。我致力于促进作为导师的多样性，公平和包容性的范围，并为外展活动促进，以及在各种行政能力中，例如部门多样性委员会主席（2009- 2012年），学术参议院多样性与公平委员会（2005-2011）以及校长的多元化委员会（2011年 - 2011年学生）（2011年至2011年至2011年），该委员会（2005- 2011年）对危机的反应。关于反种族主义工作队（2021）我共同撰写了用于机构变革的蓝图，为VC研究提供了建议，并制定了教师评估标准。夏季本科研究计划，将申请人池多样化为生物信息学，基因组学，系统生物学的研究生计划。