15:10 Omiq-HES和组成分析平台(Genomcore Bims和Fujitsu Omics分析解决方案)15:10 Omiq-HES和组成分析平台(Genomcore Bims和Fujitsu Omics分析解决方案)
1 医学科学与创新研究所,医学院,德国医学学院,发展宇宙,圣地亚哥7610658,智利2智利和迪卡斯科学研究所慢性疾病(ACCDIS),科学学院质量和药房,智利大学,圣地亚哥大学7610658,智利5分子建模中心,Biofo和Bioinform和BioinformÁTICA(CM2B2)(CM2B2),Qualic and Pharmices of Chile and Pharmacies,Chile University of Chile,Santiago 76106110658,Chile chile of Chile of Chile 7610658。工程科学,奥希金斯大学,Rancagua 7610658,智利7 Odontol或Gica Sciences研究所,牙科学院,智利大学牙科学院,圣地亚哥大学7610658,智利 *通信 *通信 *); mezquer@udd.cl(M.E. div>);电话。 div>: +56-990-699-272(F.E.); +56-976-629-880(M.E.) div>
1988年,美国政府推出了第一个包含多种生物体DNA序列的公共数据库。这个序列库被命名为美国国家生物技术信息中心(NCBI)。如今该中心在世界各地拥有多个分支机构,除了数据库本身之外,NCBI 还提供大量计算机工具和资源来协助科学家进行基因研究。计算机在生物学研究、尤其是基因研究中的应用日益广泛,催生了生物信息学这门学科。生物信息学仍被认为是生物技术的一个新兴分支,代表着生物技术与信息技术的“结合”。简而言之,生物信息学包括在数据库中存储和分析基因序列,以及随后使用特定软件对这些序列进行操作和分析。公共数据库的建立使得科学家可以获取其他实验室的信息,也可以交换和共享基因序列。每天都会有新的序列存入 NCBI 公共数据库(称为 GenBank)。生物信息学彻底改变了医学生物学研究的发展,使得几乎每天都有新的相关发现。如今,大多数从事遗传学研究的生物学家并不局限于实验室工作,而必须将大量时间投入到生物信息学研究中。
3。课程C,Hammer HF,Hammer,Hammer, 人类胃鼻虫中的甲烷发育。 Hepol Gastroenterol Nat 19:805–813。 ://doi.org/10.1038/s41575-022- 00673-z 4。 Catelier E,完成T,Qin J,Prince E,Hildebrand F,False G,Aluminum M,Aluminant M,Batto J-M,Kennedy S等。 2013。 人类具有代谢标记的丰富性。 自然500:541–546。 https://doi.org/10.1038/natur12506 5。 用户U,Shukla R,Wrimp D,UC Hashal。 2016。 非常综合征肠。 Word 10:932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡,Van Dijk JB,CM Pluge,CM。 1993。 IMPL返回微生物59:1114–1119。 59.4.4 fastQC:数据集的质量控制。 编织:http://www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织: 练习A,Antipov D,Meleshko D,Lapidus A,Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70:E102。课程C,Hammer HF,Hammer,Hammer,人类胃鼻虫中的甲烷发育。Hepol Gastroenterol Nat 19:805–813。Catelier E,完成T,Qin J,Prince E,Hildebrand F,False G,Aluminum M,Aluminant M,Batto J-M,Kennedy S等。2013。人类具有代谢标记的丰富性。自然500:541–546。https://doi.org/10.1038/natur12506 5。 用户U,Shukla R,Wrimp D,UC Hashal。 2016。 非常综合征肠。 Word 10:932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡,Van Dijk JB,CM Pluge,CM。 1993。 IMPL返回微生物59:1114–1119。 59.4.4 fastQC:数据集的质量控制。 编织:http://www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织: 练习A,Antipov D,Meleshko D,Lapidus A,Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70:E102。https://doi.org/10.1038/natur12506 5。用户U,Shukla R,Wrimp D,UC Hashal。2016。非常综合征肠。Word 10:932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡,Van Dijk JB,CM Pluge,CM。 1993。 IMPL返回微生物59:1114–1119。 59.4.4 fastQC:数据集的质量控制。 编织:http://www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织: 练习A,Antipov D,Meleshko D,Lapidus A,Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70:E102。Word 10:932–938。https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡,Van Dijk JB,CM Pluge,CM。 1993。 IMPL返回微生物59:1114–1119。 59.4.4 fastQC:数据集的质量控制。 编织:http://www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织: 练习A,Antipov D,Meleshko D,Lapidus A,Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70:E102。https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。AJM海峡,Van Dijk JB,CM Pluge,CM。1993。IMPL返回微生物59:1114–1119。59.4.4fastQC:数据集的质量控制。编织:http://www.braham。B.2014。BBTools软件包装。编织:练习A,Antipov D,Meleshko D,Lapidus A,Chorobell A.2020。使用组件的水疗中心。原始的Currish Bioinform 70:E102。https://doi.org/10.1002/cpbi.102
Contacts with postgraduate courses: Bioinformatics: bioinformatica@pediba.edu.uy biotechnology: postgraduate.biotecnologia@fcien.edu.uy Environmental Sciences: maca@fcien.edu.uy Biological Sciences: Biologia@pediba.edu.uy Physics: Physics.南方锥体的综合沿海管理:mcisur.mcisur.maestria@gmail.com数学:lydia@cmat.edu.uy compersy委员会:postgrados@fcien.edu.uy.uy.uy.uy.uy
Guerau Fernandez。劳工部的副教授,负责巴塞罗那神圣胡安医院临床生物信息单位。教会的戴安娜。西班牙富士通基因组和健康的高级分析和人工智能主管。
在我返回西班牙(1993年)时,我批准了数千名候选人的第四最佳笔记,这是国家政府的信息和通信技术上部的反对派,这是其第一个晋升,这使我可以选择目的地Carlos III Health Institute。 div>在1993年至1998年之间,我负责研究所的ICT,并改进了其基础架构和信息系统,包括Chamartin和Majadahonda的所有建筑物的网络接线,校园与第一个Internet服务(网站,电子邮件和Intranet)之间的互连,除了植入其他特定系统以供其他特定的系统植入Carlos III III III的特定系统。 div>在1998年,我被授权创建Majadahonda的生物信息学单元(Biotic),并将我的研究活动集中在遗传健康数据的处理中。 div>2000年,建立了生物信息学和公共卫生领域,由于从多个国家和国际研究项目中获得资金,总共成长为17人(只有2名官员)。 div>在2002年至2010年期间,生物植物在西班牙和欧洲的生物医学计算机研究的巩固中发挥了关键作用,这是通过两个REIC(Inbiomed,Combiemed)的协调和科学领导以及一个欧洲卓越的网络(Noe Infobiomed)。 div>
*此模型是隐式或显式的:PhyloSub(Jiao等,BMC Bioinform。2014),门片(Deshwar等人,基因组Biol。2015),Citup(Malikic等人,生物信息学2015),Lichee(Popic等,基因组Biol。 2015),Ancestree(El-Kebir等人,BioInformitics 2015),Canopy(Jiang等,PNAS,2016),Clonevol(Dang等,Ann。,Ann。 oncol。 2017),Calder(Myers等,Cell Systems,2019),Pairtree(Wintersinger等,《血液癌发现》,2022年),Orchard(Kulman等,2023),…2015),Citup(Malikic等人,生物信息学2015),Lichee(Popic等,基因组Biol。2015),Ancestree(El-Kebir等人,BioInformitics 2015),Canopy(Jiang等,PNAS,2016),Clonevol(Dang等,Ann。,Ann。 oncol。 2017),Calder(Myers等,Cell Systems,2019),Pairtree(Wintersinger等,《血液癌发现》,2022年),Orchard(Kulman等,2023),…2015),Ancestree(El-Kebir等人,BioInformitics 2015),Canopy(Jiang等,PNAS,2016),Clonevol(Dang等,Ann。,Ann。oncol。2017),Calder(Myers等,Cell Systems,2019),Pairtree(Wintersinger等,《血液癌发现》,2022年),Orchard(Kulman等,2023),…
1 Dobin,A。等。 星:超快通用RNA-seq对准器。 生物信息学29,15-21,doi:10.1093/bioinformatics/bts635(2013)。 2 Liao,Y.,Smyth,G。K.&Shi,W。R package rsubread更容易,更快,更便宜,更适合对RNA测序读取的对齐和定量。 核酸Res 47,E47,DOI:10.1093/nar/gkz114(2019)。 3 Love,M。I.,Huber,W。&Anders,S。带有DESEQ2的RNA-Seq数据的折叠变化和分散的调节估计。 基因组生物学15,550,doi:10.1186/s13059-014-0550-8(2014)。 4 Subramanian,A。等。 基因集富集分析:一种基于知识的方法,用于解释全基因组表达谱。 Proc Natl Acad Sci U S 102,15545-15550,doi:10.1073/pnas.0506580102(2005)。 5 Kolberg,L.,Raudvere,U.,Kuzmin,I.,Vilo,J. &Peterson,H。Gprofiler2-用于基因列表功能富集分析和名称空间转换工具集的R软件包G:Profiler。 f1000res 9,doi:10.12688/f1000research.24956.2(2020)。 6 Zhang,Y.,Parmigiani,G。&Johnson,W。E.战斗seq:RNA-Seq计数数据的批处理效应调整。 nar Genom Bioinform 2,LQAA078,doi:10.1093/nargab/lqaa078(2020)。1 Dobin,A。等。星:超快通用RNA-seq对准器。生物信息学29,15-21,doi:10.1093/bioinformatics/bts635(2013)。2 Liao,Y.,Smyth,G。K.&Shi,W。R package rsubread更容易,更快,更便宜,更适合对RNA测序读取的对齐和定量。核酸Res 47,E47,DOI:10.1093/nar/gkz114(2019)。3 Love,M。I.,Huber,W。&Anders,S。带有DESEQ2的RNA-Seq数据的折叠变化和分散的调节估计。基因组生物学15,550,doi:10.1186/s13059-014-0550-8(2014)。4 Subramanian,A。等。基因集富集分析:一种基于知识的方法,用于解释全基因组表达谱。Proc Natl Acad Sci U S 102,15545-15550,doi:10.1073/pnas.0506580102(2005)。5 Kolberg,L.,Raudvere,U.,Kuzmin,I.,Vilo,J.&Peterson,H。Gprofiler2-用于基因列表功能富集分析和名称空间转换工具集的R软件包G:Profiler。f1000res 9,doi:10.12688/f1000research.24956.2(2020)。6 Zhang,Y.,Parmigiani,G。&Johnson,W。E.战斗seq:RNA-Seq计数数据的批处理效应调整。nar Genom Bioinform 2,LQAA078,doi:10.1093/nargab/lqaa078(2020)。