我是一名计算/理论化学家,对三大领域感兴趣:1) 开发新的量子和统计力学技术,用于在后 DFT 时代建模强相关分子和量子材料 [电子结构];2) 设计新的替代(分子、量子和细胞)计算技术和算法 [替代计算];3) 使用生物物理和统计方法预测蛋白质的进化,以及可以针对它们的药物 [生物物理学]。到目前为止,我的团队已经开发了各种新的、更准确和更高效的量子蒙特卡罗方法,展示了如何使用简单的有机分子来存储信息和计算,并预测了与耐药性有关的酶 β-内酰胺酶如何进化。其他过去和现在的研究兴趣包括计算生物学和神经科学、数据科学、信息论、计算线性代数、随机学和凝聚态物理学中的问题。我们经常与实验者合作,以实现我们关于量子材料、量子传感和替代计算策略的理论。
摘要简介:遗传性载脂蛋白 A-I (AApoAI) 淀粉样变性是一种罕见的异质性疾病,发病年龄和器官受累各不相同。很少有系列文章详细介绍了一系列致病性 APOA1 基因突变的实体器官移植的自然史和结果。方法:我们确定了 1986 年至 2019 年期间在国家淀粉样变性中心 (NAC) 就诊的所有 AApoAI 淀粉样变性患者。结果:总共确定了 57 名患有 14 种不同 APOA1 突变的患者,包括 18 名接受肾移植的患者(5 例肝肾联合 (LKT) 移植和 2 例心肾联合 (HKT) 移植)。发病年龄中位数为 43 岁,从发病到转诊的中位数时间为 3(0 – 31 年)。81%、67% 和 28% 的患者检测到淀粉样蛋白累及肾脏、肝脏和心脏。肾淀粉样变性普遍与最常见的变异 (Gly26Arg, n ¼ 28) 有关。在所有变异中,肾淀粉样变性患者在诊断为 AApoAI 淀粉样变性时肌酐中位数为 159 m mol/L,尿蛋白中位数为 0.3 g/24 h,从诊断到终末期肾病的中位时间为 15.0 (95% CI: 10.0 – 20.0) 年。肾移植后,同种异体移植的中位生存期为 22.0 (13.0 – 31.0) 年。移植后有一例患者早期死亡(肾移植后 2 个月感染相关),未发生导致移植失败的早期排斥反应。在所有四例接受连续 123 I-SAP 闪烁显像的病例中,肝移植均导致淀粉样蛋白消退。结论:AApoAI 淀粉样变性是一种进展缓慢、难以诊断的疾病。移植结果令人鼓舞,移植物存活率极高。
荣誉和奖项2024学术护士教育学证书(ANEC)奖(提名/院长)来自约翰·霍普金斯大学(Johns Hopkins University)的马里兰州高等教育委员会(MHEC)。获奖者,$ 5,000 2023新的护理学院奖学金(提名/院长)来自约翰·霍普金斯大学的马里兰州高等教育委员会(MHEC)。获奖者,50,000美元(5年以上)2021教学卓越奖提名人,护理与健康教授学院,德雷克塞尔大学2019年学术级别晋升,德雷克塞尔大学副教授,Drexel University 2018-2019新兴教育管理员研究所,Scholar,Scholar School(九年级学者中的教学培训;德雷克塞尔大学护理与健康学院的获得者2017年教学卓越奖提名人,护理与健康教授学院,德雷克斯尔大学2011学术区别,查塔姆大学,萨米·劳德(Summa cum Laude),查塔姆大学(Chatham University)| Sigma Theta Tau国际荣誉学会归纳,Chi Zeta荣誉学会归纳2006年学术区别,Summa Cum Laude,Thomas Jefferson University | Sigma Theta Tau国际荣誉学会,Delta Rho Honor Society归纳2005-2006奖获得者全能奖学金,独立蓝十字和Blue Shield,宾夕法尼亚州高等教育奖学金2004-2005奖学金获得者奖学金获得全能奖学金,独立蓝十字和Blue Cross&Blue Shield,PA高等教育奖学金,PA高等教育奖学金,2004年学术奖学金,2004年cuma cumaude cumaude laude,Imbacaculata commaculata commaculata commaculata commaculata commaculata compis | Sigma Theta Tau国际荣誉学会归纳,Alpha Sigma Lambda分会资助的研究/授予
研究经验科学家二,2022年3月 - 目前的计算生物学家III,2019年6月至2022年3月,计算生物学家II,2017年11月 - 2019年6月,2015年6月,2015年6月 - 2017年11月,2017年11月,范·艾伦实验室,达纳 - 法伯癌症研究所,波士顿,马萨诸塞州波士顿,马萨诸塞州
澳大利亚2。澳大利亚维多利亚州帕克维尔市墨尔本大学医学生物学系3. 分子医学部,哈里·珀金斯医学研究所,西澳大利亚州默多克,澳大利亚摘要背景:通过Adar酶将腺苷转化为RNA中的inosine insine insine酶,发生在人类转录组中的数千个地点,对于健康的大脑发育至关重要。 在许多神经精神疾病中,这种编辑过程失调,但尚未按单个神经元的水平进行大规模研究。 方法:我们在全长捕获核转录组中量化了RNA编辑位点,该位点的核转录组是来自六个神经型验尸后女性供体的六个皮质区域的3055个神经元的核转录组。 推定的编辑位点与包括健康和神经精神脑组织在内的散装人体组织转录组中的位点相交,并在无关脑供体的单个核中鉴定出的位点。 使用线性模型对细胞类型和皮质区域以及其中的各个位点和基因之间的差异编辑。 还测试了基因丰度与编辑之间的。 结果:我们在至少十个神经元核中鉴定了41,930个RNA编辑位点,具有可靠的读取覆盖率。 大多数站点位于内含子或3'UTR中的Alu重复序列中,并且在已发表的RNA编辑数据库中分类了约80%。 我们确定了9285个假定的新型RNA编辑位点,其中29%在无关供体的神经元转录组中也可检测到。 自闭症相关的基因富含预测可修饰RNA结构的编辑位点。澳大利亚维多利亚州帕克维尔市墨尔本大学医学生物学系3.分子医学部,哈里·珀金斯医学研究所,西澳大利亚州默多克,澳大利亚摘要背景:通过Adar酶将腺苷转化为RNA中的inosine insine insine酶,发生在人类转录组中的数千个地点,对于健康的大脑发育至关重要。在许多神经精神疾病中,这种编辑过程失调,但尚未按单个神经元的水平进行大规模研究。方法:我们在全长捕获核转录组中量化了RNA编辑位点,该位点的核转录组是来自六个神经型验尸后女性供体的六个皮质区域的3055个神经元的核转录组。推定的编辑位点与包括健康和神经精神脑组织在内的散装人体组织转录组中的位点相交,并在无关脑供体的单个核中鉴定出的位点。使用线性模型对细胞类型和皮质区域以及其中的各个位点和基因之间的差异编辑。。结果:我们在至少十个神经元核中鉴定了41,930个RNA编辑位点,具有可靠的读取覆盖率。大多数站点位于内含子或3'UTR中的Alu重复序列中,并且在已发表的RNA编辑数据库中分类了约80%。我们确定了9285个假定的新型RNA编辑位点,其中29%在无关供体的神经元转录组中也可检测到。自闭症相关的基因富含预测可修饰RNA结构的编辑位点。全球编辑率最强的相关性是SNORD115和SNORD116群集(15Q11)的snornas,该snornas已知可调节5-羟色胺受体加工并与ADAR2共定位。抑制性神经元比兴奋性神经元更高的总体转录组编辑。 此外,我们确定了在兴奋性神经元中优先编辑的29个基因和43个基因在包括RBFOX1,其靶基因的抑制性神经元中更严重,在自闭症相关的Prader-willi locus-Willi locus 15q11中,包括RBFOX1,其靶基因和小核仁RNA相关基因。 这些结果为1730个地点提供了细胞类型和空间上下文,这些位点在精神分裂症患者的大脑中差异化,自闭症患者中有910个部位。 结论:RNA编辑,包括数千个先前未报告的位点,在单个神经元核中可牢固地检测到,其中细胞亚型之间的基因编辑差异比皮质区域之间的差异更强。 抑制性神经元中自闭症相关基因的编辑不足可能在自闭症中这些细胞的特异性扰动中表现出来。抑制性神经元比兴奋性神经元更高的总体转录组编辑。此外,我们确定了在兴奋性神经元中优先编辑的29个基因和43个基因在包括RBFOX1,其靶基因的抑制性神经元中更严重,在自闭症相关的Prader-willi locus-Willi locus 15q11中,包括RBFOX1,其靶基因和小核仁RNA相关基因。这些结果为1730个地点提供了细胞类型和空间上下文,这些位点在精神分裂症患者的大脑中差异化,自闭症患者中有910个部位。结论:RNA编辑,包括数千个先前未报告的位点,在单个神经元核中可牢固地检测到,其中细胞亚型之间的基因编辑差异比皮质区域之间的差异更强。抑制性神经元中自闭症相关基因的编辑不足可能在自闭症中这些细胞的特异性扰动中表现出来。抑制性神经元中自闭症相关基因的编辑不足可能在自闭症中这些细胞的特异性扰动中表现出来。