摘要我们提出了CAFA-evaluator,这是一个强大的Python程序,旨在评估具有层次CAL概念依赖性目标的预测方法的性能。它将多标签评估概括为现代本体论,其中预测目标是从定向的无环图中得出的,并通过利用矩阵计算和拓扑排序来实现高效率。程序要求包括少数标准的Python库,使CAFA-Evaluator易于维护。该代码复制了蛋白质功能注释(CAFA)基准测试的关键评估,该评估评估了基因本体论中一致亚法的预测。由于其可靠性和准确性,组织者选择了CAFA-Evaluator作为官方CAFA评估软件。
div> damiano piovesan damiano.piovesan@unipd.it orcid:0000-0001-8210-2390当前职位:帕多亚大学生物化学副教授(BIOS-07/A),帕多亚大学(自2022年以来)教育:Ph.D.。博洛尼亚大学生物技术,药理学和毒理学博士学位(2013)博洛尼亚大学生物信息学(2009年)B.Sc.博洛尼亚大学生物技术学院(2007)先前职位:帕多亚大学助理教授(2019-2022)帕多亚大学博士后研究员(2015-2019)博士学位。学生,博洛尼亚大学(2009-2013)研究兴趣:生物信息学,计算生物学,蛋白质本质上无序的蛋白质,机器学习,蛋白质功能注释核心竞争力:结构性生物信息和计算分析蛋白质的蛋白质开发的蛋白质开发方法,用于预测蛋白质特征和培训蛋白质的培训的方法,以实验性数据的培训,以实验性的研究:研究蛋白质的培训和标准化的培训,以实验性数据的研究:用于研究的培训,以实验性的研究:用于研究的培养基:结构生物信息学,生物数据分析奖和荣誉:CAFA 2019蛋白质功能预测挑战在生物化学(2021-2032)中排名第二。
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