Coriell # # 重复:等位基因 1、2 NA06075 12、56、70 (+/‐ 0.9) NA23265 12、75 NA23378 22、138 (+/‐ 5) NA05164 21、377 (+/‐53) NA03697 12、412 (+/‐ 33) NA04567 21、637 (+/‐ 33) NA03696 12、697 (+/‐ 13) NA04648 5、1008 (+/‐ 49) NA05152 5、1621 (+/‐30) NA03132 5、2078 (+/‐ 217)
通过Corigen®药物安全计划,您可以找出您现在服用的药物(或将来可以服用)对您来说是最安全,最有效的。Coriell Life Sciences(CLS)提供的测试将对您的药物和DNA进行分析。通过这些测试结果授权,经过特殊训练的药剂师将直接与您和您的医生合作,以做出遗传知情,个性化的决定,这些决策可以使您的健康有什么适合您的健康,这可以最大程度地减少不良药物的反应和副作用,改善每天的感觉,并减少对风险和昂贵的试用药物的需求。
Number Cas9-expressing cell lines 1, ATCC: CCL-185 A549 , adherent 2, Coriell Institute GM12878 , suspension 3, ATCC: CCL-247 HCT116 , adherent 4, ATCC: CRL-1573 HEK293 , adherent 5, ATCC: CCL-2 HeLa , adherent 6, ATCC: HB-8065 Hep G2 , adherent 7, ATCC: TIB-152 Jurkat , suspension 8, ATCC: CCL-243 K562 , suspension 9, ATCC: HTB-22 MCF7 , adherent 10, ATCC: HTB-132 MDA-MB-468 , adherent 11, ATCC: CRL-5807 NCI-H358 , adherent 12, ATCC: CRL-5872 NCI-H1437,遵守13,ATCC:CRL-5887 NCI-H1693,ADHERENT 14,ATCC:CRL-2577 RKO,RKO,RKO,辅助15,ATCC:CRL-2137 SK-N-AS,sk-n-as,ASCCC:CCL-235 SW837,ATCC:ATCC:ATCC:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB-202: U-2 OS,附着
hiPSC 培养:来自健康受试者的 hiPSC 系来自再生医学计划,AD hiPSC 来自 Coriell。通过 Sanger 测序和液滴数字 PCR 确认存在家族性突变。在创建主细胞库和工作细胞库之前,对所有细胞进行了活力、无菌性、细胞系身份、核型和多能性标志物表达测试。hiPSC 在基质胶上培养,如 StemCell Technologies(mTeSRTM1 手册中的人类多能干细胞维护)所述,使用 mTeSR1 作为细胞培养基和温和的解离剂进行传代。如果观察到自发分化,则使用 ReLeaSer(StemCell Technologies)来维持未分化培养。 NGN2 诱导的稳定 iPSC 的生成:健康对照和 AD 供体的 hiPSC 被编码 NGN2 的慢病毒转导,并在预定浓度的抗生素选择下放置 10 天,以生成可诱导表达 NGN2 的 hiPSC 多克隆稳定池。NGN2 稳定的 iPSC 向皮质神经元的分化:将 hiPSC 重新接种为单细胞,并通过添加强力霉素诱导 NGN2 的表达,以将 iPSC 分化为神经元前体 (NPC)。单次接种和诱导 NGN2 4 天后,将 NPC 用胰蛋白酶消化并重新接种到 PLO/matrigel 包被的 96 孔板中,密度为 30,000 个细胞/cm 2 。在 NPC 接种 2 天后,用预定的最佳浓度的 Ara-C 处理培养物以防止星形胶质细胞的出现。
(HG-002)此参考材料(RM)用于验证,优化和过程评估目的。它由一个来自个人基因组项目(ID HUAA53E0)的东欧Ashkenazi犹太血统的男性全人基因组样本组成,可以用来评估基因组测序的变体呼叫的性能。RM 8391的单位由一个含有人类基因组DNA的小瓶组成,该小瓶从单一的大生长人类淋巴母细胞系GM24385(标记为HG-002)中提取,从科里尔医学研究所(Camden,NJ)中提取。小瓶含有大约10 µg的基因组DNA,DNA在Te缓冲液中(10 mM Tris,1 mM EDTA,pH 8.0)。该材料旨在通过获得真实阳性,假阳性和假阴性的估计来评估人类基因组测序变体的性能。测序应用可以包括整个基因组测序,整个外显子组测序以及更多靶向测序,例如基因面板。该基因组DNA旨在以与实验室处理和分析提取的DNA相同的方式进行分析。由于RM是提取DNA的,因此它对于评估诸如DNA提取等分析前步骤没有用,但是它确实挑战了测序库制备,测序机以及映射,对齐和变体调用的生物信息学步骤。此RM并非旨在评估随后的生物信息学步骤,例如功能或临床解释。信息值:为单核苷酸变化(SNV),小插入和缺失(Indels)和纯合参考基因型提供信息值。v3.3.2基准集覆盖了GRCH37组件的88%,使用参考文献1中描述的方法。一个信息值被认为是对RM用户感兴趣和使用的值,但是信息不足以评估与该值相关的不确定性。我们使用当前可用的数据和方法来描述和传播对基因型的最佳,最自信的估计。随着新的数据积累,测量和信息学方法的可用,这些数据和基因组特征将随着时间的流逝而保持。HG-002的数据可以在国家生物技术信息中心(NCBI)序列读取存档中的BioSample SAMN03283347下找到。信息值作为一个变体调用文件(VCF),其中包含基准SNV和小indels,以及描述基准区域的TAB划分的“床”文件,其中任何其他变体在基准VCF中没有任何其他变体都应是错误。信息值不能用来建立计量学可追溯性。本报告中引用的文件可在国家生物技术信息中心(NCBI)托管的FTP站点的基因组中获得。基准VCF和基准区域的FTP站点中的基因组是: