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World File Search SystemCoxiella
coxbase：一个流行病学监视，可视化，分析和键入coxiella burnetii基因组序列
摘要Q（查询）发烧是一种由革兰氏菌细菌引起的感染性人畜共患病。尽管该疾病已经研究了数十年，但由于欧洲各个农场的零星暴发，它仍然代表着威胁。缺乏用于巡逻数据管理的中央平台是一个重要的流行病学差距，在爆发的情况下是相关的。为了填补这一差距，我们已经设计并实施了一个在线，开源的，基于Web的平台，称为Coxbase（https：// coxbase.q-gaps.de）。该平台包含一个数据库，该数据库与元数据旁边有400多个Coxiella隔离株的基因分型信息，以注释它们。我们还使用五种不同的键入方法，查询现有分离株的查询，通过在世界地图上的聚集来对分离株的视觉构造，对分离株的视觉构造，对完全组装的coxiella序列的硅基因分型实现了特征，并提交了新的分离株。我们在从RefSeq数据库中下载的50个Coxiella基因组上测试了我们的计算机打字方法，除了序列质量较差的情况外，我们成功地基因分型了所有基因组。我们使用我们对所有50个基因组及其质粒类型的ADAA基因表型识别了新的间隔序列（MST），并确定了ADAA基因表型。
全球牛群伯纳特氏柯克斯体（Q 热）血清流行率、分子流行率及趋势：系统评价与荟萃分析
结果：在 1541 篇引文中，荟萃分析纳入了 86 项研究，涉及六大洲 42 个国家的 38,057 个牛群。估计全球牛群水平的 C. burnetii 血清流行率为 44.4%（95% 置信区间 [CI]，37.9%–51.1%），纳入的研究之间存在高度异质性。奶牛群的牛群水平血清流行率明显高于肉牛群（分别为 49.0% [95% CI：41.9%–56.2%] vs. 14.5% [95% CI：5.8%–32.1%]）。估计全球牛群水平的 C. burnetii 分子流行率为 32.3%（95% CI：25.3%–40.01%），纳入的研究之间存在高度异质性。各大洲的牛群水平分子流行率存在显著差异。牛群水平分子流行率范围从亚洲的 12.8%（95% CI：7.1%–21.9%）到北美的 70.0%（95% CI：36.3%–90.5%）。就趋势而言，在研究年份中，牛群水平的伯氏锥虫血清流行率没有显著变化。