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USA001435-22-DPC.pdf - OUSD A&S
代表 (COR) 指南并撤销 2021 年 5 月发布的 COR 指南。本文件包括政府问责局 (GAO) 审计 GAO-21-546“人口贩运：国防部应解决承包商监督和合同相关调查报告薄弱问题”后关于打击人口贩运 (CTIP) 的新指南。更新后的 CTIP 指南位于第 87 至 89 页，此外，在第 167 和 168 页添加了新的 CTIP 清单作为附录 D.7。
利用 CRISPR-Cas9 同时进行 HDR 过表达和 NHEJ 抑制，在杨树中进行精确的外源插入和序列替换
CRISPR 介导的基因组编辑已成为生物性状遗传修饰的有力工具。然而，开发基于同源定向 DNA 修复 (HDR) 的高效、位点特异性基因敲入系统仍然是植物面临的重大挑战，尤其是在杨树等木本植物中。本文表明，同时抑制非同源末端连接 (NHEJ) 重组辅因子 XRCC4 和过度表达 HDR 增强因子 CtIP 和 MRE11 可以提高基因敲入的 HDR 效率。使用这种方法，BleoR 基因被整合到 MKK2 MAP 激酶基因的 3' 端以产生 BleoR-MKK2 融合蛋白。根据 TaqMan 实时 PCR 评估的完全编辑核苷酸，与没有 HDR 增强或 NHEJ 沉默相比，当使用 XRCC4 沉默结合 CtIP 和 MRE11 过度表达时，HDR 介导的敲入效率高达 48%。此外，HDR 增强子过表达和 NHEJ 抑制的组合还提高了基因组靶向效率，使 CRISPR 诱导的插入和缺失 (InDels) 减少了 7 倍，从而对杨树中基于 MKK2 的盐胁迫反应没有功能性影响。因此，这种方法不仅适用于杨树和植物或农作物，也适用于哺乳动物，以提高 CRISPR 介导的基因敲入效率。
利用 CRISPR-Cas9 同时进行 HDR 过表达和 NHEJ 抑制，在杨树中进行精确的外源插入和序列替换
CRISPR 介导的基因组编辑已成为生物性状遗传修饰的有力工具。然而，开发基于同源定向 DNA 修复 (HDR) 的高效、位点特异性基因敲入系统仍然是植物面临的重大挑战，尤其是在杨树等木本植物中。本文表明，同时抑制非同源末端连接 (NHEJ) 重组辅因子 XRCC4 和过度表达 HDR 增强因子 CtIP 和 MRE11 可以提高基因敲入的 HDR 效率。使用这种方法，BleoR 基因被整合到 MKK2 MAP 激酶基因的 3' 端以产生 BleoR-MKK2 融合蛋白。根据 TaqMan 实时 PCR 评估的完全编辑核苷酸，与没有 HDR 增强或 NHEJ 沉默相比，当使用 XRCC4 沉默结合 CtIP 和 MRE11 过度表达时，HDR 介导的敲入效率高达 48%。此外，HDR 增强子过表达和 NHEJ 抑制的组合还提高了基因组靶向效率，使 CRISPR 诱导的插入和缺失 (InDels) 减少了 7 倍，从而对杨树中基于 MKK2 的盐胁迫反应没有功能性影响。因此，这种方法不仅适用于杨树和植物或农作物，也适用于哺乳动物，以提高 CRISPR 介导的基因敲入效率。
DODIG-2022-082：对报告编号 DODIG-2019-088 的后续评估，“评估国防部打击科威特人口贩运的努力”，2019 年 6 月 11 日
国家安全总统令 (NSPD) 22 确立了消除国际人口贩运 (TIP) 的目标，并制定了针对美国政府雇员和承包商的零容忍政策。1 公法 115-425，第 112 节“确保美国采购不资助人口贩运”讨论了机构要求，以确保采购人员和机构官员了解如何实施 CTIP 相关法律和法规。2 2013 财年国防授权法案 (NDAA) 第 17 章“终止政府采购中的贩运”讨论了签订合同、监控和调查是否符合 TIP 法律和指导方针的要求。3
Cas9 融合可实现精确的体内编辑
Cas9 以高特异性靶向基因组位点。然而，当用于敲入时，Cas9 通常会导致非预期的靶向敲除，而不是预期的编辑。这种不精确性是无法进行克隆选择的直接体内编辑的障碍。在这里，我们展示了一种高通量工作流程，以比率方式评估编辑结果的靶向效率和精度。使用这种工作流程，我们筛选了供体 DNA 和 Cas9 变体的组合，以及与 DNA 修复蛋白的融合。这产生了新的高性能双链断裂修复编辑剂和组合优化，敲入精度提高了几个数量级。Cas9-RC 是一种与 eRad18 和 CtIP 融合的新型 Cas9，在发育中的小鼠大脑中，体外和体内的敲入性能提高了 3 倍以上。继续使用这种效率和精度的比率框架对现有和新型编辑剂进行比较评估，将进一步促进直接体内敲入和未来基因疗法的发展。
HDAC4通过与HDAC1＆SOL; HDAC2组装来控制DNA损伤响应并抵消衰老，以控制H2BK120乙酰化和指导的维修
抽象访问DNA是调节基因转录的第一级控制，该控制对于维持DNA完整性也至关重要。细胞衰老的特征是深刻的转录重排和DNA病变的积累。在这里，我们在H2BK120乙酰化中发现了一个表观遗传学的X介于C4和HD A C4和HD A C1 / HD A C2。HD A C4 / HD A C1 / HD A C2复合物通过H2BK120的动态脱乙酰化来调整通过同源重组的DNA修复效率。HD A C4的缺乏会导致H2BK120AC的积累，BRCA1的募集受损和CTIP募集到病变部位，累积DNA和衰老。在衰老细胞中，由于HD A C4的蛋白酶体降解增加，这种复合物被拆卸。在Ras诱导的衰老的HD A C4强迫表达降低了γH2AX的基因组扩散。 它也会影响H2BK120AC LE V ELS，在RAS诱导的衰老过程中积累的DNA受损区域中增加了。 总而言之，衰老过程中HD A C4的降解会导致DNA受损的积累，并有助于由维持衰老的超级增强剂控制的转录程序的激活。在Ras诱导的衰老的HD A C4强迫表达降低了γH2AX的基因组扩散。它也会影响H2BK120AC LE V ELS，在RAS诱导的衰老过程中积累的DNA受损区域中增加了。总而言之，衰老过程中HD A C4的降解会导致DNA受损的积累，并有助于由维持衰老的超级增强剂控制的转录程序的激活。
范可尼贫血核心复合物促进 CtIP-...
在修复链间交联 (ICL) 期间，会产生 DNA 双链断裂 (DSB)。范康尼贫血症 (FA) 核心复合物被募集到 ICL，通过同源重组 (HR) 促进该 DSB 的高精度修复。然而，FA 核心复合物是否也促进 ICL 独立 DSB（例如由电离辐射或核酸酶诱导的 DSB）的 HR 仍存在争议。在这里，我们在基于 CRISPR/Cas9 的筛选中将 FA 核心复合物成员 FANCL 和 Ube2T 鉴定为 HR 促进因子。使用同源细胞系模型，我们进一步证明了 FANCL 和 Ube2T 及其泛素化底物 FANCD2 的 HR 促进功能。我们表明 FANCL 和 Ube2T 以 FANCM 依赖的方式定位在 DSB 上，并且是 FANCD2 在 DSB 上积累所必需的。从机制上讲，我们证明 FANCL 泛素连接酶活性是 CtIP 在 DSB 上积累所必需的，从而促进末端切除和 Rad51 加载。总之，这些数据表明 FA 核心复合物和 FANCD2 在促进 ICL 和 DSB 修复方面具有双重基因组维护功能。